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20款常用生物在線工具匯總

 微笑如酒 2017-06-15

本文轉(zhuǎn)載自:安諾基因,有更改


Promoter Scan

功能:啟動(dòng)子預(yù)測

網(wǎng)址:https://www-bimas.cit./molbio/proscan/


  ORF Finder

功能:ORF預(yù)測

網(wǎng)址:https://www.ncbi.nlm./orffinder/




NCBI-BLAST

功能:序列比對

網(wǎng)址:https://blast.ncbi.nlm./Blast.cgi



          MUSCLE


功能:運(yùn)行速度比較快的多序列比對

網(wǎng)址:http://www./Tools/msa/muscle/#



                Clustal Omega


功能:DNA,、RNA、蛋白的多序列比對

網(wǎng)址:http://www./Tools/msa/clustalo/



ClustalW2


功能:應(yīng)用較廣泛的多序列比對

網(wǎng)址:http://www./Tools/msa/clustalw2/




   T-Coffee


功能:準(zhǔn)確度高,速度慢的多序列比對

網(wǎng)址:

http://www./Tools/msa/tcoffee/





SimiTriX-SimiTetra


功能:多序列比對相似性展示

網(wǎng)址:http://cotton./EN/tools/BioERCP/simitrix.php



         Venn圖

功能:繪制Venn圖

網(wǎng)址:http://www./index.php



   Venn圖

功能:繪制Venn圖

網(wǎng)址:http://bioinformatics.psb./cgi-bin/liste/Venn/calculate_venn.htpl 





     Venn圖


功能:繪制Venn圖

網(wǎng)址:http://bioinfogp.cnb./tools/venny/index.html



WEGO



功能:繪制GO注釋結(jié)果圖 

網(wǎng)址:http://wego./cgi-bin/wego/index.pl




 CIRCOS

功能:繪制圈圖

網(wǎng)址:http://mkweb./tableviewer/visualize/



CIRCexplorer

功能:進(jìn)行circRNA分析

網(wǎng)址:http://circexplorer2./en/latest/



iPath

功能:進(jìn)行可視化通路圖在線分析

網(wǎng)址:http://pathways./



KEGG

功能:進(jìn)行基因的代謝通路注釋

網(wǎng)址:http://www./blastkoala/


UCSC

功能:進(jìn)行基因組可視化

網(wǎng)址:http://genome./index.html



IBS

功能:進(jìn)行序列結(jié)構(gòu)示意圖繪制

網(wǎng)址:http://ibs./online.php



RAP


功能:在線分析RNA-seq 

網(wǎng)址:https://bioinformatics./rap/


AUGUSTUS

功能:基因外顯子內(nèi)含子,,UTR,注釋

網(wǎng)址:http://bioinf./webaugustus/prediction/create


GSDS

功能:基因外顯子內(nèi)含子,,UTR,domain等區(qū)域特征展示

網(wǎng)址:http://gsds.cbi.pku.edu.cn/



來源:安諾基因,有更改

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