宋室南渡以后,，形成了南宋與金,、元南北對峙的局面,。當(dāng)時(shí)道教內(nèi)部宗派紛起,，在金元之際,，北方先后出現(xiàn)了太一道,、真大道、全真道等道派,。
　　太一道為衛(wèi)州（今河南汲縣）人蕭抱珍（,？—1166年）于金初創(chuàng)立。該派重符箓齋醮,，規(guī)定道士必須出家,，七傳以后逐漸與正一道相融合,。
　　太一道創(chuàng)立于金熙宗天眷年間（1138—1140年）,。始祖為蕭抱珍,，他以“元?dú)鉁啘S,、太極剖判,、至理統(tǒng)一”為教旨,，概稱其數(shù)為“太一教”。始祖蕭抱珍,，衛(wèi)州人,。他聲稱曾得仙人所賜秘箓,，擅長祈禱訶禁法術(shù)，在鄉(xiāng)間郡里常以符箓,、符水為百姓治病,；用祈禱咒語驅(qū)除蝗災(zāi),、求雨，利用這些濟(jì)世利民的手段,，得到河北地區(qū)民眾的尊崇,。他以傳授“太一三元法箓”為名，在河南濟(jì)縣建立了第一個(gè)庵堂,，信奉者日眾，從此創(chuàng)立了太一教,。金熙宗皇統(tǒng)八年（1148年）被召至京，為皇室治病,，受到禮遇,，賜改庵堂為“太一萬壽觀”,，太一道從此顯赫。金大定二年（1162年）詔準(zhǔn)入粟購買度牒,，道士所居之處,，沒有名額者，也可以輸買,，因此蕭抱珍又建太清,、迎祥兩觀，廣招信徒入教,。太一教借皇家的寵遇,，得以在北方地區(qū)迅速發(fā)展，使太一教初具規(guī)模。蕭抱珍卒于大定六年（1166年）,，賜號(hào)“太一一悟傳教真人”。太一教以“元?dú)饣鞙S,，太極剖判,，至理統(tǒng)一”為教門宗旨，以“篤人倫,，翊世教”為教門法則,，是儒、道思想結(jié)合的體系,。以老子“弱者道之用”為處世原則，以崇尚符箓為行世手段,。信奉者需出家，尊守教門戒律,；居住宮觀始稱庵,，后改稱宮，墓稱塔,。接受法嗣者必須先受秘箓法物,，改姓始祖“蕭”姓,，這是所有道教派別中僅有的一派,。
　　太一道與當(dāng)時(shí)興盛起來的真大道教,、全真教一樣是以拯救民眾和社會(huì)為目標(biāo)的重視實(shí)踐性的三教合一的道派,。
　　真大道亦創(chuàng)立于金初,，創(chuàng)始人為滄州樂陵人劉德仁（1120—1180年）,，號(hào)無憂子,。自幼喜讀詩書。靖康之亂后,，遷居鹽山。由于身歷北方社會(huì)的戰(zhàn)亂,，頗受流離之苦，因而產(chǎn)生了強(qiáng)烈的憤世嫉俗的思想,。同時(shí)又受儒家,、佛教的影響，把掙脫苦海的希望寄托在宗教信仰上,，于是他自稱遇一白發(fā)老翁（暗示老子），授以《道德經(jīng)要言》,，以此言論為救世大道的理論基礎(chǔ),，對己可以修身，對人可以化度,，在河北一帶民眾中廣為流傳。信徒漸漸增多后,，便創(chuàng)立了大道教。劉德仁立教規(guī)九條：
　?。?） 視物猶己,，勿萌戕害兇嗔之心,；
　　（2） 忠于君,，孝于親,，誠于人,，辭無綺語，口無惡聲,；
　?。?） 除邪淫,，守清靜,；
　?。?） 遠(yuǎn)勢力，安賤貧,，力耕而食,，量入為用；
　?。?） 毋事博奕,，毋習(xí)盜竊,；
　?。?） 毋飲酒茹葷，衣食取足,，毋為驕盈,；
　?。?） 虛心而弱志,，和光而同塵,；
　?。?） 毋恃強(qiáng)梁,，謙尊而光,；
　　（9） 知足不辱，知止不殆,。
　　大道教居處始稱庵,，后為宮觀,，墓稱塔,，與太一教同。大道教發(fā)展到第四祖毛希琮時(shí)改大道教為“真大道”,，以區(qū)別以前之大道教,。該派的特點(diǎn)是以清心寡欲,、謙卑自守,、力作而食為教旨，以無為保正性命,，以無相驅(qū)役鬼神為教行,。信教者須出家，遵守教戒,。真大道教流行于河北燕京地區(qū),，所建宮觀甚多，如大都之天寶宮,、玉虛宮,；平谷之迎祥宮；房山之隆陽宮等,，但現(xiàn)存無幾,。該派以《道德經(jīng)》為教旨，不尚煉丹飛仙之事,，而頗重默禱召劾為人治病,，主張出家苦行。元以后,，逐漸衰落并消失,，或已合并于全真道。
　　全真道,，是金代興起于北方三大新道派中最大的和最重要的派別,，因始祖自題所居庵為全真堂而得名。該派創(chuàng)建于金大定（1161—1189年）年間,，創(chuàng)立者王喆,，生于宋徽宗政和二年（1112年），陜西咸陽大魏村人,。原名中孚,，字允卿，后改名世雄,，字威德,。入道后始改名為喆，字知明,。因仰慕陶淵明之高風(fēng)亮節(jié),，取號(hào)為重陽子。早年為儒生,，兼習(xí)射騎,。道書載,，金正隆四年（1159年）曾于甘河遇仙人密付口訣，飲噀神水,，自是斷絕俗念,，悟道出家。于終南山筑墓穴名曰“活死人墓”,，開始修道,。金世宗大定七年（1167年），云游至山東寧海,，遇馬鈺（道號(hào)丹陽子）,、孫不二（號(hào)清靜散人）拜以為師，從此宣揚(yáng)全真之道,。后又收譚處端（號(hào)長真子）,、劉處玄（號(hào)長生子）、丘處機(jī)（號(hào)長春子）,、王處一（號(hào)玉陽子）,、郝大通（號(hào)廣寧子）為弟子，并在文登,、萊州、登州等地建立三教七寶會(huì),、三教三光會(huì),、三教玉華會(huì)、三教金蓮會(huì),、三教平等會(huì),。大定九年（1169年），與弟子馬玉陽,、譚長真,、劉長生、丘長春西歸,，羽化于道中,，葬于終南山劉蔣村，從此全真道尊為祖庭,，金章宗賜庵名靈虛觀,，后元太宗加封為重陽萬壽宮。元世祖至元六年（1269年）封王重陽為全真開化真君,；元武宗至大三年（1310年）加封為重陽全真開化輔極帝君,。王重陽著有傳道詩千余首，編于《重陽全真集》內(nèi),，又有《重陽教化集》,、《重陽立教十五論》,、《重陽分梨十化集》等。
　　該派主張三教合一,，在修行方法上注重內(nèi)丹修煉,，不尚符箓與黃白之術(shù)，規(guī)定道士必須出家住宮觀,，不蓄妻子,，持齋茹素，并制定了嚴(yán)格的清規(guī)戒律,。全真教由一個(gè)有民族意識(shí)的宗教而興起,，援儒攝佛，吸收二教思想,，形成以道家思想為核心的三教合一的新道教派別,。為了廣招信徒，把《道德經(jīng)》,、《般若心經(jīng)》,、《孝經(jīng)》列為信徒必讀經(jīng)典，教人“孝謹(jǐn)純一”,，“正心誠意,，少思寡欲”。注重在下層民眾中傳教,，廣為結(jié)納中層士大夫階級(jí),，謀求上層達(dá)官貴族、皇家宗室的支持,，因此教派基礎(chǔ)深厚,，思想意識(shí)滲透到各個(gè)階層，影響深遠(yuǎn),。
　　全真道的創(chuàng)始人王重陽傳有七徒,，是為“全真七子”，他們都對北方全真道的傳播合發(fā)展作過重大貢獻(xiàn),。其中以丘處機(jī)最為突出,。丘處機(jī)（1148—1227年），字通密,，號(hào)長春子,，山東登州棲霞人。19歲出家入道,，次年于山東寧海全真堂拜王重陽為師,。當(dāng)丘處機(jī)嗣教時(shí)，正值金元之際。金興定三年（1219年）,，宋寧宗譴使召請,，不應(yīng)。元太祖聞其名,，自乃蠻（今蒙古境內(nèi)）譴臣持詔召請,，丘處機(jī)以71歲高齡率十八弟子，從萊州出發(fā),，跋涉萬里,，歷盡艱辛，歷時(shí)兩年多到達(dá)西域大雪山與成吉思汗相會(huì),?！疤鏁r(shí)方西征，日事攻戰(zhàn),，處機(jī)每言,，欲一天下者，必在乎不嗜殺人,；及問為治之方,，則對以敬天愛民為本；問長生久視之道,，則告以清心寡欲為要”（見《元史·丘處機(jī)傳》）,。太祖深契其言，禮遇甚隆,，尊為神仙,，命他掌管天下道教事，又受賜金虎符,，許他便宜從事，并赦免全真道士的賦稅,。這就為全真道的鼎盛奠定了基礎(chǔ),。丘處機(jī)于1224年返大都（今北京），住長春宮（今北京白云觀）,，此處成為全真道的活動(dòng)中心,。丘處機(jī)在此演教，立龍門之宗,。在他的努力下,，全真道的宮觀數(shù)量和道教徒人數(shù)都迅速擴(kuò)充，全真道進(jìn)入鼎盛時(shí)期,。丘長春著作有《大丹直指》,、《攝生消息論》、《潘溪集》等。
　　全真教之所以比太一教,、大道教興盛,、流傳長久，除了受到統(tǒng)治階級(jí)的青睞外,，其中最主要的原因是教徒能恪守戒律,，遵守規(guī)勸，注意自我的身心修養(yǎng),，得到民眾的尊崇,。全真教徒注重教史的修撰，第一部著作是真常真人李志常的《長春真人西游記》,，其次是全真子宋披云繼鑿龍山道教石窟,，重刊《金藏》于平陽。秦志安撰《金蓮正宗記》,，前收鐘,、呂，后述七真,，是一部全真早期的教史,。其后他在修撰，《金蓮正宗記》,、《煙霞錄》,、《繹仙》、《婺仙》等有關(guān)全真教史料,，保存了有價(jià)值的資料,。特別值得一提的是李道謙，以儒士入道,，終身未嘗廢書,。歷任重陽宮主事，京兆道門提占,，陜西五路西蜀四川道教提點(diǎn),。除自著《筠溪集》外，還著有《終南祖庭仙真內(nèi)傳》三卷,、《七真年譜》一卷,、《終南山記》三十卷、《甘水仙源錄》六卷,，使全真教史大備,，歷來為道教史家所重視。
　　自從全真道興起以后,，道教便出現(xiàn)了“北宗”與“南宗”的分立,。南宗即北宋張伯端所傳一派,，主要活動(dòng)于南宋時(shí)期。至元代中后期,，在與南北二派均有師承關(guān)系的陳致虛（1289—,？年）的努力下，紫陽一派亦歸于全真,，被稱為“南宗”,，王重陽一派，被稱為“北宗”,。
　　與北方三大道派興起的同時(shí),，在南方除舊有的龍虎天師、茅山上清,、閣皂靈寶等三山符箓諸派之外,，這時(shí)自稱獨(dú)得異傳而別立宗派者甚多，主要有從天師道衍化而來的神霄派,，由上清派衍化而來的清微派,，由靈寶派分化而來的東華派和凈明道。
　　神霄派以傳習(xí)“神霄雷法”而得名,，假托其道法出自元始天王之子神霄玉清真王,。實(shí)際上該派創(chuàng)始人是北宋末江西南豐道士王文卿（1093—1153年）。他曾被宋徽宗召見,，拜為太素大夫,，凝神殿校籍，不久又拜金門羽客,，升凝神殿侍宸,，賜號(hào)“沖虛通妙先生”。王文卿退居鄉(xiāng)里后弟子甚多,，得其傳者依次有新城高子羽,、臨江徐次舉、金溪聶天錫等人,。其后得其傳而最顯著者則為臨川譚悟真,，據(jù)說“人不敢稱其名，但謂之譚五雷”,。北宋時(shí)在朝的名道士也多習(xí)神霄雷法,，如林靈素,、張繼先,、劉混康、徐守信,、薩守堅(jiān),、萬宗師等。宋元間傳神霄雷法的還有莫月鼎。神霄雷法還影響宋元間其它道派,。例如張伯端所創(chuàng)金丹派南宗,，從四祖陳楠開始兼?zhèn)魃裣隼追ǎ愰桨子耋缸欣追ㄖ鞫喾N,。
　　清微派以傳習(xí)“清微雷法”而得名,，假托其法出自清微天元始天尊。據(jù)《清微仙譜》稱,，該派創(chuàng)始人為廣西永州人祖舒,，南宋理宗時(shí)傳至九代南畢道。實(shí)際上清微派是從南畢道,、黃舜申師徒傳授清微雷法開始興盛起來的,。南畢道，（1196——,？）四川眉山人,，宋理宗時(shí)任廣西憲司。其幕僚黃某之子黃舜申得疾,，南畢道治愈之,，并悉以清微雷法受黃舜申。黃舜申（1224——,？）遂成為清微派第十代祖師,。寶佑中（1253——1258年），黃曾出任檢閱,，以擅雷法聞名京師,。宋理宗召見，賜號(hào)“雷囦真人”,。元世祖至元丙戌（1286年）,，黃又應(yīng)詔赴闕，未幾乞還鄉(xiāng)里,，隱于紫霞湖滄州之上,。元室賜號(hào)為“雷淵廣福普化真人”。黃舜申是清微道法的集大成者,，門徒頗多,。清微派的道法書現(xiàn)存主要有《清微齋法》、《清微元降大法》,、《清微神烈秘法》等,，另外《道法會(huì)元》中也保存有不少清微雷法著作。
　　 凈明道是南宋初年,，西山道士何真公創(chuàng)立,，是由靈寶派演化出來的一個(gè)分支,。它尊奉許遜為祖師，稱其法箓出于許遜之傳,。何真公所創(chuàng)之凈明道,，除傳行一種稱為“凈明法”的符箓外，還重心性和內(nèi)丹的修煉,，特別是在其教義中力主以忠孝為本,。何真公后嗣無人，其所創(chuàng)的教派后來被玉真子劉玉新建的凈明道延續(xù)下來,。劉玉（1257——1308年）,，字頤真，號(hào)玉真子,。原籍鄱陽石門（今屬江西）,，后遷至南昌建康。弱冠而孤,，志存方外,。至元二十九年（1292年），劉玉聲稱凈明法師胡惠下降,，告之“凈明大教將興,，當(dāng)出八百弟子，汝為之師”,，并說元貞二年（1296年）臘月,，許真君當(dāng)降其家。于是,，許多信徒投奔在劉玉門下,。此后，劉玉便在西山一帶開展傳教活動(dòng),，并陸續(xù)建立了一些壇,、靖等宗教活動(dòng)據(jù)點(diǎn)，使湮沒百年的凈明道再次興盛起來,。劉玉新建的凈明道實(shí)際上是何真公凈明道的延續(xù)何發(fā)展,。劉玉羽化前以教事傳付弟子黃元吉。黃元吉（1270——1324年）,，字希文,，人稱中黃先生，豫章豐城（今屬江西）人,。年十二,，入西山玉隆萬壽宮為道士。后從劉玉,，得旌陽許真君忠孝之教,。為人剛介，治眾甚嚴(yán),。晚年以其教游說京師,。泰定元年（1324年）十二月，羽化于京中崇真萬壽宮,。其弟子著名的有陳天和,、徐慧、劉真?zhèn)?、熊玄暉,、劉思?fù)、黃通理等,。繼黃元吉掌教的凈明宗師為徐慧（1291——1350年）,，一名徐異，號(hào)丹扃道人,。他編輯凈明道諸位祖師傳記,、神降法語及劉玉、黃元吉語錄,，著成《凈明忠孝全書》六卷,。徐慧之后，凈明道傳承法嗣不明,。元以后一說合并于正一道,，一說歸于全真道。
　　東華派是從靈寶派分化出來的一個(gè)新道派,，創(chuàng)始人是南宋初的寧全真,。寧全真（1101——1181年），字本立,，開封人,。曾從田思真和仙人任子光受教，得東華,、靈寶二派之傳,，遂將二系教法合而為一。從此道業(yè)大進(jìn),，以齋醮祈禱之術(shù)行化南方,。紹興二十八年（1158年），金國南侵,，高宗特旨召全真入殿廷,，命奏章于天地，祈求國家平安,。事畢,，賜號(hào)“清微高士”,，封“贊化先生”。以后國家每有齋醮之事,，常命全真主典,。晚年居浙江何淳真家，講授道法,，所傳弟子甚多,。寧全真所創(chuàng)的東華派，在上清,、靈寶派傳統(tǒng)的存思神真的基礎(chǔ)上,，吸收了內(nèi)丹丹法，重視行法者個(gè)人的內(nèi)煉工夫,，把靜坐修煉視為徹視通神,、齋醮煉度之本。東華派傳至元代林靈真時(shí),，又進(jìn)入了一個(gè)興盛時(shí)期,。林靈真（1239——1302年），原名偉夫,，字君昭,，溫州人。累舉不第,，乃棄儒從道,，舍宅為觀。從林虛一,、薛熙真學(xué)東華道法,。三十八代天師命其為溫州路玄學(xué)講師，不久升任本州道錄,。主持溫州天清觀,，受教弟子百余人，龍虎山天師道弟子董處謙和后任玄教大宗師的吳全節(jié),，皆曾受其學(xué),。
　　在元統(tǒng)一全國之后，天師道在北方得到迅速傳播,，全真道在南方有較大發(fā)展,。其他力量較為薄弱的各道派則逐漸與天師道或全真道相融合，符箓各派（如茅山宗,、閣皂宗等）融入天師道（龍虎宗）之后,，統(tǒng)稱為正一道，從而形成正一和全真兩大道派。經(jīng)元,、明,、清各代，流傳至今,。
　　宗元之際,，正一道與元朝皇室關(guān)系密切，因而在元代頗受尊崇,，愈加興盛。據(jù)說早在滅南宗之先,，元世祖便于1259年派密使?jié)撊臊埢⑸?，訪問35代天師張可大，向他不問統(tǒng)一天下之事,。張可大回答說：“后二十年天下當(dāng)混一,。”南宗滅亡后,，忽必烈乃于至元十三（1276）召見張可大之子,，第36代天師張宗演，賜以玉芙蓉冠,，組金無縫服,，命他主領(lǐng)江南諸路道教，賜給銀印,。次年又封張為真人,，命于長春宮主持周天大醮。從此之后,，元朝歷代師嗣位,，皆沿例賜為真人，襲掌三山符箓及江南諸路道教,，有權(quán)薦舉任免江南各地的道錄與宮觀提點(diǎn),，奏請新建宮觀名額及度牒，并可“自出牒度人為道士”,。元代天師中最榮耀者為第38代天師張與材,，他因劾治潮患有功，于成宗大德八年（1304）被封為“正一教主”,，武宗即位后又授金紫光祿大夫,，封留國公，賜給金印,，秩視一品,。第39代天師張嗣成，于泰定二年（1325）被封為“翊元崇德正一教主”并授集賢院知事,，掌管天下道教事務(wù),。
　　元代正一道士中還出現(xiàn)了榮耀超過天師的張留孫,、吳全節(jié)師徒。張留孫（1248——1321）原是張宗演弟子,，至元十三年隨師入朝,，對答稱旨，遂留侍闕下,。元祖常向他詢問修身治國之道,，又曾為皇太子、皇后請禱治病有驗(yàn),，因而得到寵信,，被封為上卿，賜給寶劍,，并敕命兩京各建崇真宮,，讓張留孫居之以掌祀事。至元二十五年（1278）,，又加封他為“玄教宗師,、道教都提點(diǎn)、管領(lǐng)江北淮西荊襄道教事”,，佩銀印,。此后元世祖對張“寵遇日隆，比于親臣”,?；蛎涑鲮裘酱蟠ǎ蚍钪既ソ显L求遺賢,，又受命為武宗,、仁宗取名，參與任命宰相的決策等等,。后來元成宗,、武宗、仁宗等朝,，對張的寵信亦始終不衰,，“朝廷有大謀議，必見咨問”,。他被加封的頭銜愈來愈顯耀,，官階也從三品進(jìn)至一品。元成宗時(shí)被封為“玄教大宗師同知事集賢院道教事”,，追贈(zèng)三代魏國公,。元武宗加封“大真人知集賢院大學(xué)士”。仁宗又加封為：“開府儀同三司、特進(jìn)上卿,、輔成贊化保運(yùn)玄教大宗師,、志道弘教沖玄仁靖大真人、知集賢院事,、領(lǐng)諸路道教事,。”其封號(hào)長達(dá)43字,，可謂顯赫無比,。至治元年張留孫去世，又被元英宗封贈(zèng)“真君”之號(hào),。其門下高徒有75人,，其中封真人并分掌各地道教提點(diǎn)者7人，另有9人被命為宮觀提點(diǎn),。
　　張留孫大弟子吳全節(jié)（1240——1321）,，出身儒門,，隨其師至大都,。大德十一年（1370）被授為“玄教嗣師”。至治三年（1322）繼承師位,，出任玄教大宗師,，賜真號(hào)，總攝江淮荊襄等處道教,。他掌教25年,，好與儒士結(jié)交。曾于至順二年（1331）進(jìn)陸九淵《語錄》于朝,，使陸氏心學(xué)為元室所重視,，又曾薦舉吳洽澄、閻復(fù)等儒臣,。他去世后,，夏文泳、張德隆,、于有興等人相繼出掌玄教宗師,。直至元朝滅亡后，明太祖只承認(rèn)張?zhí)鞄熀笏?，而不承認(rèn)玄教宗師,，張留孫的玄教法嗣遂告終結(jié)。
　　正一道不出家,，多從事符箓齋醮,，祈福禳災(zāi)；全真道主張“全神煉氣，出家修真”,，建立了傳戒和叢林制度,。