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Ubuntu下MPICH2集群系統(tǒng)安裝手冊(采用建立信任ssh)

 七天小勝 2011-03-15
一、安裝配置基本linux系統(tǒng)
















第一步:IP地址配置:
打開終端,,啟動(dòng)文本編輯器來編輯Linux網(wǎng)絡(luò)配置文件,命令如下:
sudo gedit /etc/network/interfaces
在這里你應(yīng)該會(huì)看到如下內(nèi)容:
auto lo
iface lo inet loopback
這個(gè)正是lo回環(huán),,我需要讓這臺運(yùn)行Ubuntu Server的機(jī)子通過DHCP獲得IP來加入網(wǎng)絡(luò),,那么我只需要在上面的
lo回環(huán)的配置內(nèi)容下面加入:
auto eth0
iface eth0 inet static
address 192.168.0.30
netmask 255.255.255.0
gateway 192.168.0.1
如果是手動(dòng)指定IP并且還需要訪問互聯(lián)網(wǎng),那么還需要設(shè)置DNS:
$sudo gedit /etc/resolv.conf
假如dns地址為192.168.3.2,則向這里添加如下配置內(nèi)容:
nameserver 192.168.3.2保存即可,。
重啟網(wǎng)絡(luò)組件讓網(wǎng)絡(luò)配置文件生效:
$sudo /etc/init.d/networking restart
只要顯示Reconfiguring network interfaces... [OK]
即成功重啟網(wǎng)絡(luò)組件,。
第二步:編輯每臺機(jī)器的/etc/hosts文件
將所有節(jié)點(diǎn)名稱及其IP地址填入。如:在每一臺機(jī)中做如下配置:
127.0.0.1    localhost
192.168.0.30 node0 server
192.168.0.31 node1
192.168.0.32 node2
192.168.0.33 node3
 
最后,,可以通過ping server 或者ssh server進(jìn)行測試
二,、安裝NFS文件系統(tǒng)
$sudo apt-get install nfs-kernel-server nfs-common
安裝完成之后,在/usr目錄下建立文件夾:mkdir cluster,文件夾cluster作為共享文件夾,。
接下來需要修改該目錄所屬的用戶及組,,使用ls –l命令可以看到,剛才創(chuàng)建的/cluster目錄屬于root用戶,,
需要將它的用戶和組改為cluster,。使用如下命令更改用戶和組:
sudo chown cluster:cluster /usr/cluster
配置NFS server:
編輯/etc/exports文件,在該文件中增加以下幾行:
/usr/cluster node1(rw,sync)
/usr/cluster node2(rw,sync)
/usr/cluster node3(rw,sync)
/usr/cluster node4(rw,sync)
三,、創(chuàng)建SSH信任連接(在root目錄下)
1,、安裝ssh:sudo apt-get install ssh
2、在node01生成SSH秘鑰對.
 #ssh-keygen -t rsa  一路回車即可
 產(chǎn)生.ssh文件,
 #ls -a   查看是否有.ssh文件夾
 
3,、進(jìn)入.ssh目錄
 #cd .ssh
4,、生成authorized_keys文件
 #cp id_rsa.pub authorized_keys
5、退出到root目錄
 #cd ..
6,、建立本身的信任連接
 #ssh node01     按提示輸入yes(三個(gè)字母要打全)
7,、設(shè)置node02(node02的root目錄下)
 #ssh-keygen -t rsa     生成.ssh文件夾
 #scp node01的IP:/root/.ssh/* /root/.ssh    拷貝node01上的.ssh文件夾覆蓋本地的
 #scp node01的IP:/etc/hosts /etc/hosts      拷貝node01上的hosts文件覆蓋本地的
 #ssh node01  提示處輸入yes回車
 設(shè)置node03,node04的方法與node02相同
8、確認(rèn)四臺機(jī)器的信任連接已建立
 對每個(gè)節(jié)點(diǎn)執(zhí)行:
 #ssh node01
 #ssh node02
 #ssh node03
 #ssh node04
 在提示處輸入yes回車,,最后確定無需輸入密碼并且沒有任何提示信息即可登陸("Last login:時(shí)間日期"提示信息除外)

四,、安裝MPICH2(在節(jié)點(diǎn)root目錄下)
1、解壓縮
 #tar -zxvf mpich2-1.0.1.tar.gz
 或者 #gunzip -c mpich2-1.0.1.tar.gz|tar xf mpich2-1.0.1.tar
2,、創(chuàng)建安裝目錄
 #mkdir /usr/MPICH-instsll
3,、進(jìn)入mpich2解壓目錄
 #cd mpich2-1.0.1
4、設(shè)置安裝目錄
 #./configure --prefix=/usr/MPICH-install
5、編譯
 #make
6,、安裝
 #make install
7,、退出到root目錄
 #cd ..
8、通過編輯.bashrc文件修改環(huán)境變量
 #vi .bashrc
 修改后的.bashrc文件如下:
 # .bashrc
 # User specific aliases and functions 
 
 alias rm='rm -i'
 alias cp='cp -i'
 alias mv='mv -i'
 PATH="$PATH:/usr/MPICH-install/bin"   新增加的
 #Source global definitions
 if [ -f /etc/bashrc ]; then
  . /etc/bashrc
 fi
9,、測試環(huán)境變量設(shè)置
 #which mpd
 #which mpicc
 #which mpiexec
 #which mpirun
10,、修改/etc/mpd.conf文件,內(nèi)容為secretword=myword
 #vi /etc/mpd.conf
 設(shè)置文件讀取權(quán)限和修改時(shí)間
 #touch /etc/mpd.conf
 #chmod 600 /etc/mpd.conf
11,、創(chuàng)建主機(jī)名稱集合文件/root/mpd.hosts
 #vi mpd.hosts
 文件內(nèi)容如下:
 node01
 node02
 node03
 node04
五,、測試
1、本地測試
 #mpd &    啟動(dòng)
 #mpdtrace 觀看啟動(dòng)機(jī)器
 #mpdallexit 退出
2,、通過mpd.hosts運(yùn)行集群系統(tǒng)
 #mpdboot -n number -f mpd.hosts        number為要起動(dòng)的機(jī)器個(gè)數(shù)
 #mpdtrace
 #mpdallexit

3,、測試運(yùn)行MPICH的例子程序
 #mpdboot -n 4 -f mpd.hosts   啟動(dòng)4臺機(jī)器
 #mpiexec -n number /usr/MPICH-install/examples/cpi     number為使用的進(jìn)程數(shù)
 #mpdallexit
4、如果測試不能通過,,請進(jìn)行第四步

六,、問題解決
1、通過mpdcheck獲得一寫幫助信息
 #mpdcheck -pc
 
2,、查錯(cuò)
 #mpdcheck -l
3,、通過mpd.hosts文件查錯(cuò)
 #mpdcheck -f mpd.hosts  如果無錯(cuò)誤
 #mpdcheck -f mpd.hosts  -ssh
4、如果上述無錯(cuò)誤,,可略過此步
 對任意兩臺機(jī)器進(jìn)行查錯(cuò)
 m1: #mpdcheck -s  輸出主機(jī)名host和端口port
 m2: #mpdcheck -c host port
注意:以上四步都是在沒有運(yùn)行mpd的情況下進(jìn)行的
5,、mpd查錯(cuò)
 m1: #mpd -e & 返回使用的端口
 m2: #mpd -h m1 -p echoed_port_m1 &

以上測試通過,集群系統(tǒng)就建成了,。

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