| 全國自然保護區(qū)名錄（截至到2007年12月） | | 序號 | 保護區(qū)名稱 | 行政區(qū)域 | 總面積（hm2） | 主要保護對象 | GB類型 | 級別 | 始建時間 | 主管部門 |
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| | 1 | 布爾根河貍 | 青河縣 | 5000 | 河貍及其生境 | 野生動物 | 省級 | 1980-01-01 | 林業(yè) |
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| | 2 | 金塔斯山地草原 | 福海縣 | 56700 | 山地草原生態(tài)系統(tǒng) | 草原草甸 | 省級 | 1986-05-03 | 農(nóng)業(yè) |
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| | 3 | 哈納斯 | 布爾津縣,、哈巴河縣 | 220162 | 森林生態(tài)系統(tǒng)及自然景觀 | 森林生態(tài) | 國家級 | 1980-05-01 | 林業(yè) |
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| | 4 | 額爾齊斯河科克托海濕地 | 阿勒泰地區(qū) | 99040 | 河流濕地,、湖泊濕地、沼澤濕地動植物資源 | 內(nèi)陸濕地 | 省級 | 2005-02-01 | 林業(yè) |
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| | 5 | 兩河源頭 | 阿勒泰地區(qū) | 1130000 | 森林,、動植物,、濕地 | 森林生態(tài) | 省級 | 2001-09-01 | 林業(yè) |
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| | 6 | 克科蘇濕地 | 阿勒泰地區(qū) | 30667 | 濕地及動植物資源 | 內(nèi)陸濕地 | 省級 | 2001-09-01 | 林業(yè) |
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| | 7 | 塔城巴爾魯克山 | 裕民縣 | 115000 | 野巴旦杏及其生境 | 野生植物 | 省級 | 1980-01-01 | 林業(yè) |
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| | 8 | 甘家湖梭梭林 | 烏蘇市、精河縣 | 54667 | 梭梭林及其生境 | 荒漠生態(tài) | 國家級 | 1983-10-01 | 林業(yè) |
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| | 9 | 新源山地草甸類草地 | 新源縣 | 65300 | 草原草甸,、野生牧草近緣種 | 草原草甸 | 省級 | 1986-07-05 | 農(nóng)業(yè) |
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| | 10 | 鞏留野核桃 | 鞏留縣 | 1180 | 野核桃及其生境 | 野生植物 | 省級 | 1983-01-01 | 林業(yè) |
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| | 11 | 西天山 | 鞏留縣 | 31217 | 雪嶺云杉林森林生態(tài)系統(tǒng) | 森林生態(tài) | 國家級 | 1983-01-02 | 林業(yè) |
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| | 12 | 霍城四爪陸龜 | 霍城縣 | 27000 | 四爪陸龜及其生境 | 野生動物 | 省級 | 1983-01-01 | 林業(yè) |
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| | 13 | 伊犁小葉白蠟 | 伊寧縣 | 405 | 小葉白蠟樹及其生境 | 野生植物 | 省級 | 1983-01-01 | 林業(yè) |
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| | 14 | 塔什庫爾干野生動物 | 塔什庫爾干塔吉克自治縣 | 1500000 | 雪豹,、盤羊等高山野生動物 | 野生動物 | 省級 | 1984-05-08 | 林業(yè) |
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| | 15 | 帕米爾高原濕地 | 阿克陶縣 | 153000 | 典型高原濕地生態(tài)系統(tǒng) | 內(nèi)陸濕地 | 省級 | 2005-01-01 | 林業(yè) |
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| | 16 | 托木爾峰 | 溫宿縣 | 237600 | 森林及野生動植物 | 森林生態(tài) | 國家級 | 1980-01-01 | 林業(yè) |
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| | 17 | 巴音布魯克 | 和靜縣 | 100000 | 天鵝等珍稀水禽、沼澤濕地 | 野生動物 | 國家級 | 1980-05-09 | 林業(yè) |
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| | 18 | 中昆侖 | 且末縣 | 3200000 | 藏羚羊等野生動物 | 野生動物 | 省級 | 2001-01-01 | 林業(yè) |
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| | 19 | 羅布泊野駱駝 | 若羌縣 | 7800000 | 野駱駝及其生境 | 野生動物 | 國家級 | 1986-01-01 | 環(huán)保 |
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| | 20 | 阿爾金山 | 若羌縣 | 4500000 | 有蹄類野生動物及高原生態(tài)系統(tǒng) | 荒漠生態(tài) | 國家級 | 1983-01-01 | 環(huán)保 |
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| | 21 | 塔里木胡楊 | 尉犁縣,、輪臺縣 | 395420 | 胡楊,、灰楊林 | 森林生態(tài) | 國家級 | 1983-01-01 | 林業(yè) |
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| | 22 | 溫泉北鯢 | 溫泉縣 | 695 | 新疆北鯢及其生境 | 野生動物 | 省級 | 1997-01-01 | 林業(yè) |
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| | 23 | 艾比湖濕地 | 精河縣 | 267085 | 濕地及珍稀野生動植物 | 內(nèi)陸濕地 | 省級 | 2000-06-02 | 林業(yè) |
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| | 24 | 夏爾希里 | 博樂市 | 31400 | 森林及野生動物資源 | 森林生態(tài) | 省級 | 2000-06-02 | 林業(yè) |
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| | 25 | 卡拉麥里山 | 奇臺、富蘊等六縣 | 1589958 | 野驢等有蹄類野生動物及生境 | 野生動物 | 省級 | 1986-01-01 | 林業(yè) |
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| | 26 | 奇臺荒漠類草地 | 奇臺縣 | 38600 | 荒漠生態(tài)系統(tǒng)及荒漠草原生態(tài)系統(tǒng) | 荒漠生態(tài) | 省級 | 1986-07-05 | 農(nóng)業(yè) |
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| | 27 | 天池 | 阜康市 | 38069 | 森林生態(tài)系統(tǒng),、高山湖泊 | 森林生態(tài) | 省級 | 1980-01-01 | 林業(yè) |
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| | 28 | 六盤山 | 西吉縣 | 26667 | 水源涵養(yǎng)林及野生動物 | 森林生態(tài) | 國家級 | 1982-05-09 | 林業(yè) |
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| | 29 | 黨家岔 | 西吉縣 | 4100 | 濕地生態(tài)系統(tǒng)及野生動植物 | 內(nèi)陸濕地 | 省級 | 2002-12-01 | 其他 |
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| | 30 | 南化山 | 海原縣 | 20100 | 水源涵養(yǎng)林,、野生動植物 | 森林生態(tài) | 省級 | 2004-12-13 | 林業(yè) |
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