Western免疫印跡(Western Blot)是將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到膜上,,然后利用抗體進(jìn)行檢測。對已知表達(dá)蛋白,,可用相應(yīng)抗體作為一抗進(jìn)行檢測,,對新基因的表達(dá)產(chǎn)物,可通過融合部分的抗體檢測,。 本文主要通過以下幾個方面來詳細(xì)地介紹一下Western Blot技術(shù): 一,、原理 二、 分類 i.放射自顯影 ii.底物化學(xué)發(fā)光ECL ECF iv.底物DAB呈色 三,、 主要試劑 四,、 主要步驟 五、 實(shí)驗常見的問題指南 1.參考書推薦 2.針對樣品的常見問題 3.抗體 4.濾紙,、膠和膜的問題 5.Marker的相關(guān)疑問 6.染色的選擇 7.參照的疑問 8.緩沖液配方的常見問題 9.條件的摸索 10.方法的介紹 11.結(jié)果分析
一,、 原理 與Southern或Northern雜交方法類似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝膠電泳,,被檢測物是蛋白質(zhì),,“探針”是抗體,“顯色”用標(biāo)記的二抗,。經(jīng)過PAGE分離的蛋白質(zhì)樣品,,轉(zhuǎn)移到固相載體(例如硝酸纖維素薄膜)上,固相載體以非共價鍵形式吸附蛋白質(zhì),,且能保持電泳分離的多肽類型及其生物學(xué)活性不變,。以固相載體上的蛋白質(zhì)或多肽作為抗原,與對應(yīng)的抗體起免疫反應(yīng),,再與酶或同位素標(biāo)記的第二抗體起反應(yīng),,經(jīng)過底物顯色或放射自顯影以檢測電泳分離的特異性目的基因表達(dá)的蛋白成分。該技術(shù)也廣泛應(yīng)用于檢測蛋白水平的表達(dá),。
二,、分類
現(xiàn)常用的有底物化學(xué)發(fā)光ECL和底物DAB呈色,,體同水平和實(shí)驗條件的是用第一種方法,目前發(fā)表文章通常是用底物化學(xué)發(fā)光ECL,。只要買現(xiàn)成的試劑盒就行,,操作也比較簡單,原理如下(二抗用HRP標(biāo)記):反應(yīng)底物為過氧化物+魯米諾,,如遇到HRP,,即發(fā)光,可使膠片曝光,,就可洗出條帶,。
三、主要試劑 1,、 丙烯酰胺和N,,N’-亞甲雙丙烯酰胺,應(yīng)以溫?zé)?以利于溶解雙丙稀酰胺)的去離子水配制含有29%(w/v)丙稀酰胺和1%(w/v)N,,N’-亞甲雙丙烯酰胺儲存液丙稀酰胺29g,N,,N-亞甲叉雙丙稀酰胺1g,,加H2O至100ml。)儲于棕色瓶,,4℃避光保存,。嚴(yán)格核實(shí)PH不得超過7.0,因可以發(fā)生脫氨基反應(yīng)是光催化或堿催化的,。使用期不得超過兩個月,,隔幾個月須重新配制。如有沉淀,,可以過濾,。 2、 十二烷基硫酸鈉SDS溶液:10%(w/v)0.1gSDS,,1mlH2O去離子水配制,,室溫保存。 3,、 分離膠緩沖液:1.5mmol/LTris-HCL(pH8.8):18.15gTris和48ml1mol/LHCL混合,,加水稀釋到100ml終體積。過濾后40C保存,。 4,、 濃縮膠緩沖液:0.5mmol/LTris-HCL(pH6.8):6.05gTris溶于40mlH2O中,用約48ml 1mol/L HCL調(diào)至pH6.8加水稀釋到100ml終體積,。過濾后40C保存,。這兩種緩沖液必須使用Tris堿制備,,再用HCL調(diào)節(jié)PH值,而不用Tris.CL,。 5,、 TEMED原溶液N,N,,N’N’四甲基乙二胺催化過硫酸銨形成自由基而加速兩種丙稀酰胺的聚合,。PH太低時,聚合反應(yīng)受到抑制,。10%(w/v)過硫酸胺溶液,。提供兩種丙稀酰胺聚合所必須的自由基。去離子水配制數(shù)ml,,臨用前配制. 6,、 SDS-PAGE加樣緩沖液:pH6.8 0.5mol/L Tris緩沖液8ml,甘油6.4ml,,10%SDS 12.8ml,,巰基乙醇3.2ml,0.05%溴酚藍(lán)1.6ml,,H2O 32ml混勻備用,。按1:1或1:2比例與蛋白質(zhì)樣品混合,在沸水終煮3min混勻后再上樣,,一般為20-25ul,,總蛋白量100μg。 7,、 Tris-甘氨酸電泳緩沖液:30.3gTris,,188g甘氨酸,10gSDS,,用蒸餾水溶解至1000ml,,得0.25mol/L Tris-1.92mol/L甘氨酸電極緩沖液。臨用前稀釋10倍,。 8,、 轉(zhuǎn)移緩沖液:配制1L轉(zhuǎn)移緩沖液,需稱取2.9g甘氨酸,、5.8gTris堿,、0.37g SDS,并加入200ml甲醇,,加水至總量1L,。 9、 麗春紅染液儲存液:麗春紅S 2g 三氯乙酸30g 磺基水楊酸 30g 加水至100ml 用時上述儲存液稀釋10倍即成麗春紅S使用液。使用后應(yīng)予以廢棄,。 10,、 脫脂奶粉5%(w/v)。 11,、 NaN3 0.02% 疊氮鈉(有毒,,戴手套操作),溶于磷酸緩沖鹽溶液(PBS),。 12,、 Tris緩沖鹽溶液(TBS):20mmol/LTris/HCL(pH7.5),500mmol/LnaCl,。 13,、 Tween20(15)鼠抗人-MMP-9(16)鼠抗人-TIMP-1。 14,、 過氧化物酶標(biāo)記的第二抗體,。 15、 NBT(溶于70%二甲基甲酰胺,,75mg/ml),。 16、 BCIP(溶于100%二甲基甲酰胺,,50mg/ml),。 17、 100mmol/LTris-HCL(pH9.5),。 18、 100mmol/L NaCl,。 19,、 50mmol/LTris-HCL(pH7.5),5mmol/L EDTA,。 (可以參看分子克?。?/p>
四、主要步驟 主要包括以下4個基本步驟
1.樣品制備
原始樣品可為細(xì)胞,、組織,、培養(yǎng)上清、免疫沉淀或親和純化的蛋白,,以下為定性檢測目的蛋白時細(xì)胞樣品的處理方法,,其余的樣品制備方法參閱相關(guān)文獻(xiàn)。
1.培養(yǎng)細(xì)胞或藥物處理,。
2.棄培養(yǎng)基,,用1X PBS漂洗細(xì)胞2次,去盡殘留培養(yǎng)基,。
3.加入1X SDS樣品緩沖液(6-well plate, 100 μl /w或 75 cm2 plate, 500-1000 μl/瓶),,刮落細(xì)胞,,轉(zhuǎn)移到Ep管。注意:冰上操作,。
4.超聲 10~15秒剪切DNA以減低樣品粘性,。
5.煮沸樣品5 minutes。
6.離心 12000g, 5 min,,取上清,。
7.電泳分離:上樣15μl~20 μl 至 SDS-PAGE 膠 ( 10 cm x 10 cm)電泳。 如要定量檢測某蛋白的表達(dá)水平,,應(yīng)用RIPA裂解液(1 ml per 107 cells/ 100 mm dish/ 150 cm2 flask)裂解細(xì)胞,,收集裂解液至離心管中,在振蕩器上混勻4~15min,, 14000g離心15min( 4℃),,棄沉淀,用Bradford法或其它蛋白質(zhì)測定方法測定上清中蛋白濃度以調(diào)整上樣體積和上樣量,,進(jìn)行Western雜交時還需設(shè)置內(nèi)或外參照,,通常用beta-actin。
注意:一般上樣20~30 μg已足夠,,如待檢蛋白為低豐度蛋白,,可加大上樣量至100μg,但電泳條帶易拖尾,,可制備亞細(xì)胞組份或采用更敏感的檢測方法,。
2.電泳分離(參照SDS-PAGE電泳方法)
3.轉(zhuǎn)膜
雜交膜的選擇是決定Western blot成敗的重要環(huán)節(jié)。應(yīng)根據(jù)雜交方案,、被轉(zhuǎn)移蛋白的特性以及分子大小等因素,,選擇合適材質(zhì)、孔徑和規(guī)格的雜交膜,。用于Western blot的膜主要有兩種:硝酸纖維素膜(NC) 和PVDF膜,。NC膜是蛋白印跡實(shí)驗的標(biāo)準(zhǔn)固相支持物,在低離子轉(zhuǎn)移緩沖液的環(huán)境下,,大多數(shù)帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)會與膜發(fā)生疏水作用而高親和力的結(jié)合在一起,,但在非離子型的去污劑作用下,結(jié)合的蛋白還可以被洗脫下來,。根據(jù)被轉(zhuǎn)移的蛋白分子量大小,,選擇不同孔徑的NC膜。因為隨著膜孔徑的不斷減小,,膜對低分子量蛋白的結(jié)合就越牢固,。通常用0.45μm和0.2μm兩種規(guī)格的NC膜。大于20kD的蛋白可用0.45μm的膜,小于20kD的蛋白就要用0.2μm的膜了,,如用0.45μm的膜就會發(fā)生“Blowthrough”的現(xiàn)象,。PVDF膜靈敏度、分辨率和蛋白親和力比常規(guī)的膜要高,,非常適合于低分子量蛋白的檢測,。但PVDF膜在使用之前必需用純甲醇浸泡飽和1-5秒鐘。
蛋白質(zhì)常用的轉(zhuǎn)移方法主要有兩種:槽式濕轉(zhuǎn)和半干轉(zhuǎn)移,。前者操作容易,,轉(zhuǎn)移效率高;而后者適用于大膠的蛋白轉(zhuǎn)移,,所用緩沖液少,。以下為槽式濕轉(zhuǎn)的操作步驟。
1. 將膠浸于轉(zhuǎn)移緩沖液中平衡10min,。 注意:如檢測小分子蛋白,,可省略此步,因小分子蛋白容易擴(kuò)散出膠,。
2. 依據(jù)膠的大小剪取膜和濾紙6片,,放入轉(zhuǎn)移緩沖液中平衡10min。如用PVDF膜需用純甲醇浸泡飽和3-5秒鐘,。
3. 裝配轉(zhuǎn)移三明治:海綿?3層濾紙?膠?膜?3層濾紙?海綿,,每層放好后,用試管趕去氣泡,。切記:膠放于負(fù)極面(黑色面),。
4. 將轉(zhuǎn)移槽置于冰浴中,放入三明治(黑色面對黑色面),,加轉(zhuǎn)移緩沖液,,插上電極,100V,,1h(電流約為 0.3A)。注意:應(yīng)再次檢查三明治和電極是否裝配正確,,電源是否接通,。
5. 轉(zhuǎn)膜結(jié)束后,切斷電源,,取出雜交膜
4.免疫雜交與顯色
1.用25 ml TBS 洗膜5min,,室溫,搖動,。
2.置膜于25 ml 封閉緩沖液中1h, 室溫,,搖動。
3.15ml TBS/T洗3次(5 min/T)。
4.加入合適稀釋度的一抗,,室溫孵育1-2h或 4°C過夜,,緩慢搖動。
5.15 ml TBS/T洗3次(5 min/T),。
6.加入合適稀釋度的堿性磷酸酶(AP)或辣根過氧化酶(HRP)標(biāo)記的二抗,,室溫孵育1h,緩慢搖動,。
7.15 ml TBS/T洗3次(5 min/T),。
8.15 ml TBS洗1次。
9.蛋白檢測(顯色法或發(fā)光法,,按相應(yīng)試劑說明操作),。
注意事項:
1.操作中戴手套,不要用手觸膜,。
2.PVDF膜在甲醇中浸泡時間不要超過5秒,。
3.如檢測小于20kD的蛋白應(yīng)用0.2μm的膜,并可省略轉(zhuǎn)移時的平衡步驟,。
4.某些抗原和抗體可被Tween-20 洗脫,,此時可用1.0% BSA代替Tween-20。
5.關(guān)于封閉劑的選擇:5%脫脂奶/TBS or PBS: 能和某些抗原相互作用,,掩蓋抗體結(jié)合能力,;0.3~3% BSA in PBS:低的內(nèi)源性交叉反應(yīng)性。
6.如用0. 1% Tween 20,、0.02% NaN 3 in PBS or TBS作封閉劑和抗體稀釋液,,抗體檢測后可進(jìn)行蛋白染色。
如要同時檢測大分子量和小分子蛋白,,最好用梯度膠分離蛋白,。
五、 實(shí)驗常見的問題指南 根據(jù)問題的類型主要分成以下幾類(以下資料權(quán)作參考,,請勿盲目模仿?。?/p>
1. 參考書推薦
A. 對初學(xué)者看什么資料比較好? 解答:《抗體技術(shù)實(shí)驗指南》和Antibodies(a laboratory manual,, wrote by Ed Harlow ,,david lane)兩本書不錯。
2. 針對樣品的常見問題
B. 做線粒體膜UCP2蛋白的Western Blot (以下簡寫成Western Blot),,提取線粒體后凍存(未加蛋白酶抑制劑),,用的博士德的一抗,開始還有點(diǎn)痕跡,,現(xiàn)在越來越差,,上樣量已加到120μg,,換了個santa cloz的一抗仍不行。是什么原因,?蛋白酶抑制劑單加PMSF行嗎,? 解答:懷疑是樣品問題,可能是:1,,樣品不能反復(fù)凍融,;2,樣品未加蛋白酶抑制劑,。同時,,建議檢查Western Blot過程, 提高一抗?jié)舛?。對于加蛋白酶抑制劑來說,,一般加PMSF就可以了,最好能多加幾中種蛋白酶抑制劑,。
E. 同一蛋白樣品能同時進(jìn)行兩種因子的Western Blot檢測嗎,? 解答:當(dāng)然可以,有的甚至可以同時測幾十種樣品,。
F. 如果目標(biāo)蛋白是膜蛋白或是胞漿蛋白,,操作需要注意什么? 解答:如果是膜蛋白和胞漿蛋白,,所用的去垢劑就要溫和得多,,這時最好加上NaF去抑制磷酸化酶的活性。
G. 我的樣品的蛋白含量很低,,每微升不到1微克,,但是在轉(zhuǎn)膜時經(jīng)常會發(fā)現(xiàn)只有一部分蛋白轉(zhuǎn)到了膜上,就是在轉(zhuǎn)膜后染膠發(fā)現(xiàn)有的孔所有的蛋白條帶都在,,只是顏色變淡了,,有什么辦法可以解決? 解答:你可以加大上樣量,,沒有問題,,還有轉(zhuǎn)移時你可以用減少電流延長時間,多加5-10%甲醇,。
H. 想分離的蛋白是分子量260kd的,,SDS-PAGE電泳的分離膠濃度多大合適?積層膠的濃度又該用多少,?這么大分子量的蛋白容易作Western Blot嗎,? 解答:260kd的蛋白不好做,, 分離膠用6%,, Stacking Gel 3.5%,。
I. 如果上樣量超載,要用什么方法來增加上樣量,?如果需要加大上樣量使原來弱的條帶能看清楚,。 解答:可以濃縮樣品,也可以根據(jù)你的目標(biāo)分子量透析掉一部分小分子蛋白,。一般地,,超載30%是不會有問題的。如果已經(jīng)超了不少了,,而且小分子量的也要,,可以考慮加大膠的厚度,可以試試 1.5mm的 comb,。
J. 蛋白變性后可以存放多久,? 解答:- 80℃,一兩年沒有問題,。最關(guān)鍵兩條:不要被蛋白酶水解掉,;不要被細(xì)菌消化掉(也是被酶水解了)。
K. 我所測定的蛋白分子量是105KD,,按理說分離膠應(yīng)當(dāng)采用7.5%,,但我所查資料卻要求分離膠和濃縮膠均采用11%的配方,不知為何,? 解答:上述您提到的兩種凝膠均可以使用,,因為105KD的蛋白在上述兩種膠的線性分辨范圍內(nèi),但需注意條帶位置,。
L. 接下來我準(zhǔn)備采用DAB顯色技術(shù),,二抗是生物素化的多克隆抗體,三抗是親和素生物素體系,,不知采用這樣的方案后,,封閉液是否要作調(diào)整,能否再用5%的脫脂奶粉呢,?好像有資料說脫脂奶粉會影響親和素生物素的生成,,是嗎? 解答:不能使用脫脂奶粉,,因為脫脂奶粉中含生物素,,用BSA代替應(yīng)該好一點(diǎn).
M. 還有一問題,一般一次上樣的蛋白總量是多少,,跟目的蛋白的表達(dá)量有關(guān)系嗎,? 解答:Western Blot一般上樣30-100微克不等,結(jié)果跟目的蛋白的豐度,、上樣量,、一二抗的量和撫育時間都有關(guān)系,,也與顯色時間長短有關(guān)。開始摸條件時,,為了拿到陽性結(jié)果,,各個步驟都可以量多一點(diǎn)時間長一點(diǎn),當(dāng)然背景也就出來了,。要拿到好的結(jié)果,,如果抗體好的話比較容易,抗體不好的話就需要反復(fù)地試了,,當(dāng)然有的不適合Western Blot的怎樣做也不行,。所以拿到好的結(jié)果不容易。
N. 做組織樣品的western的時候,,處理樣品有什么訣竅嗎,?還有,您用過大牛血清做封閉劑嗎,?濃度如何,?效果是不是比BSA好一點(diǎn)? 解答:必須進(jìn)行研磨,、勻漿,、超聲處理,蛋白質(zhì)溶解度會更好,,離心要充分,,膜蛋白需用更劇 烈的方法抽提,低豐度膜蛋白可能還要分步抽提(超速離心),。還有一點(diǎn)就是組織中的蛋白酶活性更強(qiáng),,需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF和蛋白酶抑制劑cocktail),封閉劑一般5%脫脂奶粉較常用,。如果一抗為多克隆抗體,,使用BSA也是不錯的選擇。
O. 您是否可以介紹一下大分子量蛋白200KD,,在做western要注意什么呢,? 解答:做200kd蛋白的Western Blot時要注意,分離膠最好選擇>7%的,;剝膠時要小心,;轉(zhuǎn)移時間需要相應(yīng)延長;要做分子量參照(否則出現(xiàn)雜帶不知道如何分析),。
P. 有什么方法可以提高上樣量,? 解答:可以濃縮樣品;增大上樣體積來增大上樣量,。
Q. 我要檢測的目的蛋白是分子量大概為42kd的膜蛋白,,膜蛋白提取可不可以不用到超速離心機(jī),,有沒有直接用低溫高速離心機(jī)就可以的提到膜蛋白的方法,42kd的蛋白分子量算不算大,? 解答:如是需要提取膜蛋白,(而不是只需要提取膜蛋白),,可以用Ripa buffer提取膜蛋白和胞漿蛋白,,用這個做Western Blot就可以了。如果是非要只提取膜蛋白就要用到超速離心機(jī),。42kd 不算大,,也不算小,所以,,可以按照一般的轉(zhuǎn)移方法實(shí)施,。
R. 蛋白的上樣量有沒有什么具體的要求? 解答:上樣量要根據(jù)實(shí)驗的要求來定,, 如果要求是定量和半定量的Western Blot 則上樣量要均等,, 如果只是要定性,則沒有太大的關(guān)系,, 盡量多上就行了,, 但是不要超過0.3μg/mm2。
S. 一抗,,二抗的比例是否重要,? 解答:比較重要,調(diào)整好一抗,,二抗的比例,,可以去掉部分非特異的本底。
3. 抗體
T.
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