Archival single-cell genomics reveals persistent subclones during DCIS progression 【作者】 美國(guó)UT MD安德森癌癥中心Nicholas E. Navin教授 Cell最新發(fā)布 背景:原位導(dǎo)管癌(DCIS)是侵襲性乳腺癌的常見前兆,但對(duì)其基因組進(jìn)化和復(fù)發(fā)相關(guān)機(jī)制了解不足,。 原位導(dǎo)管癌(DCIS)是乳腺癌的一種非侵襲性前兆病變,。它是在乳房?jī)?nèi)管道(導(dǎo)管)內(nèi)形成的異常細(xì)胞群,這些細(xì)胞看起來(lái)像癌細(xì)胞,,但尚未侵入周圍組織,。 DCIS通常通過篩查乳房X光檢查(乳腺X線攝影或乳腺鉬靶)來(lái)發(fā)現(xiàn),不會(huì)引起明顯的乳房腫塊或其他癥狀,。它被認(rèn)為是早期乳腺癌的一個(gè)階段,,并且有可能逐漸發(fā)展為侵襲性乳腺癌。 盡管DCIS本身并不具有生命危險(xiǎn),但約20%的DCIS會(huì)在15年內(nèi)復(fù)發(fā)或進(jìn)展為侵襲性乳腺癌(即使進(jìn)行了局部治療),。因此,,對(duì)DCIS的研究非常重要,以更好地理解其進(jìn)化和復(fù)發(fā)機(jī)制,,從而改善診斷和治療策略,。 然而,由于DCIS的非侵襲特性,,研究人員在獲取匹配的原發(fā)性和復(fù)發(fā)性DCIS樣本方面面臨著挑戰(zhàn),。此外,由于對(duì)FFPE樣本(福爾馬林固定石蠟包埋)的限制,,以及DCIS細(xì)胞克隆多樣性的復(fù)雜性,,以往的研究?jī)H限于使用同步DCIS侵襲性組織或不匹配的DCIS和侵襲性癌癥對(duì)的單時(shí)間點(diǎn)樣本。 因此,,開發(fā)一種能夠在FFPE樣本中進(jìn)行基因組分析的高通量單細(xì)胞DNA測(cè)序方法,,可以幫助科學(xué)家更好地了解DCIS的進(jìn)化過程以及與復(fù)發(fā)相關(guān)的亞克隆關(guān)系。 問題:目前對(duì)于DCIS的進(jìn)化模型和復(fù)發(fā)相關(guān)的亞克隆存在爭(zhēng)議,,需要更深入的研究,。 方法:研究人員開發(fā)了一種與FFPE樣本兼容的高通量單細(xì)胞DNA測(cè)序方法,稱為Arc-well,。他們分析了來(lái)自細(xì)胞系,、冷凍組織的單細(xì)胞以及儲(chǔ)存了多年的乳腺、肺和前列腺腫瘤的FFPE樣本,。此外,,他們對(duì)10名匹配DCIS和復(fù)發(fā)的癌癥患者進(jìn)行了分析。 結(jié)果和討論:研究結(jié)果顯示,,許多原發(fā)性DCIS已經(jīng)發(fā)生了全基因組加倍和克隆多樣化,,并且在復(fù)發(fā)中它們與持續(xù)的亞克隆共享基因組譜系。進(jìn)化分析揭示了大多數(shù)DCIS經(jīng)歷了進(jìn)化瓶頸,,并確定了與復(fù)發(fā)相關(guān)的持久亞克隆中的染色體畸變,。 總結(jié):研究人員開發(fā)了一種與FFPE樣本兼容的高通量單細(xì)胞DNA測(cè)序方法,用于研究DCIS的基因組進(jìn)化和復(fù)發(fā)機(jī)制,。他們的研究結(jié)果揭示了DCIS的克隆多樣性和與復(fù)發(fā)相關(guān)的持久亞克隆,。這些發(fā)現(xiàn)有助于更好地理解和預(yù)測(cè)DCIS的發(fā)展和復(fù)發(fā)過程。 |
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