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誰也不想 WB 總出錯!配圖詳解 12 個 WB 翻車原因

 新用戶82921936 2023-07-17 發(fā)布于安徽

經(jīng)常做 western blot 的同學(xué)

通常會有一種錯覺
這哪里是搞科研

明明是搞「玄學(xué)圖片

十個 WB 七個歪八個丑九個壞

還有一個不出來

要么條帶失蹤圖片

要么背景漆黑圖片

要么雜帶叢生圖片

……

有時就算湊齊天時地利人和

也不一定能得到一組完美條帶

江湖傳言:一個生物學(xué)博士,要跑滿 1000 板膠才有可能畢業(yè)

WB 實(shí)驗本身就難

還總是牽涉進(jìn)

「造假撤稿學(xué)術(shù)不端等丑聞

使得主流期刊對 WB 數(shù)據(jù)要求越來越高

要求作者提供相關(guān)原始數(shù)據(jù)

甚至要求提供未切割的 WB 全膜條帶

 對于出道 29 年的大博士而言 

WB 的「玄之操作

它早就積攢了一本厚厚的攻略

【PS:由于排版字?jǐn)?shù)限制,,以下分享部分精華】

收獲這份攻略

高靈敏度,,高信噪比,更低背景……

讓你的條帶顯露真身圖片圖片圖片

跑膠是 WB 實(shí)驗成敗之母

提高跑膠質(zhì)量的 Tips

蛋白分子量偏高或偏低

可能是膠的濃度與目的蛋白的濃度不對應(yīng),,比如說 100KD 的蛋白你用 12% 的膠跑,,或者說 20KD 的蛋白你用 8% 的膠跑。

蛋白質(zhì)降解

蛋白質(zhì)降解后很可能會在比原來位置低的地方出現(xiàn)主帶,,然后出現(xiàn)一些其他帶,,最主要的特點(diǎn)是所有的條帶比正常的都低,并且條帶模糊不清晰,。

所有條帶連成一片無間隔

最可能是上樣量過多,,其次是樣品彌散(比如電泳長時間停止樣品彌散)。

溴酚藍(lán)拖尾

樣品溶解不好或上樣前未變性完全,。

縱向的紋理

上樣樣品中存在不溶性顆粒,。

溴酚藍(lán)很粗

濃縮膠濃縮效果不好,可能是濃縮膠太短或者配錯,。

在分離膠中跑不動

Tris-Cl pH 值不對,,或者忘記加 SDS。

BOSTER

#1/無背景無條帶

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原因分析

如果 marker 正常,,其他位置沒有條帶,,最可能是一抗加成其他抗體,或者二抗種屬加錯了,,比如兔的加成鼠的,。

解決辦法

a. 目的蛋白完全無信號,但同時做的內(nèi)參是正常的,,那么大部分情況是一抗抗體失效或用錯二抗,。

b. 目的蛋白和內(nèi)參均無信號,則考慮是否發(fā)光液失效,。如果膜上沒有 marker 則為轉(zhuǎn)膜失敗,。

c. 如果中間出現(xiàn)了細(xì)微條帶,,可能是蛋白上樣量太少,,或一抗?jié)舛冗^低。

經(jīng)驗之談

上圖展示一點(diǎn)信號都沒有,,大部分情況是因為抗體加錯了,。如果中間出現(xiàn)細(xì)微的條帶,可能是蛋白上樣量太少,,一抗?jié)舛冗^低,,ECL 發(fā)光液失效。

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#2/高背景

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原因分析

封閉不充分,一抗?jié)舛冗^高,,洗膜時間次數(shù)不夠,。

解決辦法

降低一抗?jié)舛龋黾酉茨r間和次數(shù),。

a.一抗/二抗?jié)舛扰浔炔缓线m:雜帶多,,大概率是抗體特異性不好,也有可能抗體濃度太高,,可嘗試降低一抗?jié)舛冗M(jìn)行實(shí)驗,。

b.封閉液問題:配制封閉液所用的脫脂奶粉應(yīng)選用無防腐劑實(shí)驗專用脫脂奶粉。

c.洗膜不充分:洗膜按規(guī)定來 5min*5 次或 10min*3 次,。

經(jīng)驗之談

高背景是 WB 實(shí)驗中最常見的問題,,目的條帶單一清晰,但其他地方又彌漫性較均一的背景(比較連續(xù)的),。雜帶多大概率是抗體特異性不好,,也有可能抗體濃度太高,可嘗試降低一抗?jié)舛冗M(jìn)行實(shí)驗,。

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#3/非特異性條帶

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原因分析

一抗非特異性與蛋白結(jié)合,。

解決辦法

更換一抗。

經(jīng)驗之談

此種情況絕大多數(shù)是因為一抗不好,,你無法判斷哪一條是目的條帶,。如果實(shí)在沒有更好的抗體,建議采用陰性對照和陽性對照來確定上述哪個條帶是目的條帶,。當(dāng)然也有一種很小幾率的可能是一抗?jié)舛忍咭鸬姆翘禺愋越Y(jié)合,。

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#4/條帶中出現(xiàn)邊緣規(guī)則的白圈

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原因分析

a.電轉(zhuǎn)中膜與膠之間存在氣泡。

b.可能是轉(zhuǎn)膜過程燒膜了,,特別是半干轉(zhuǎn)操作不當(dāng)導(dǎo)致燒膜,。

c.轉(zhuǎn)膜時溫度過高產(chǎn)生氣泡。

d.印跡膜活化不佳,。

解決辦法

a.注意排清氣泡,。

b.優(yōu)化實(shí)驗條件或使用濕轉(zhuǎn)法轉(zhuǎn)膜。

c.把整個轉(zhuǎn)膜裝置放于 -20 度冰箱中電轉(zhuǎn),。

d.確保印跡膜完全活化,。

經(jīng)驗之談

我們常常將電轉(zhuǎn)液倒入一個盤子里,倒入的液體不宜太多或太少,,建議高度與放上第一層濾紙齊平,,然后往濾紙上澆點(diǎn)轉(zhuǎn)膜液,往膠上面澆點(diǎn)電轉(zhuǎn)液,,用兩只手的拇指和食指輕輕夾住 NC 膜的兩側(cè)中間,,使膜成 U 型,,然后將 U 型底部接觸膠的中間,慢慢往兩邊放下膜,,這樣一般氣泡很少,。然后上層濾紙同樣用 U 型的放置方法,用玻璃棒稍微貼實(shí)下,,最后蓋上海綿,。

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#5/出現(xiàn)黑點(diǎn)和黑斑

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原因分析

a.一般出現(xiàn)這種情況可能是封閉液溶解不完全或封閉液存放時間太久(長菌)。

b.膜上其他部位與一抗或二抗非特異性結(jié)合,。

解決辦法

a.過濾封閉液或選用其他類型封閉液,。

b.與其他品牌已驗證過好用的抗體處理相同樣本,作比較,,看是否還有斑點(diǎn),。

經(jīng)驗之談

牛奶溶解后,最好靜止一下,,然后輕輕吸取上層牛奶進(jìn)行封閉,,封閉結(jié)束后一定要洗 3 遍之后再加一抗。

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#6/條帶拖尾

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原因分析

一抗?jié)舛忍吆蜁r間太長,。

解決辦法

根據(jù)情況調(diào)整一抗?jié)舛?,時間也可縮短。

經(jīng)驗之談

這種情況一般出現(xiàn)在大分子量抗體實(shí)驗中,,是因為一抗?jié)舛忍?,作用時間太長引起的。另外洗一抗和洗二抗千萬不要偷工減漏,,建議 5min*5 次,,不要擔(dān)心洗這么多次把抗體和蛋白洗掉了,真正的抗原抗體相結(jié)合通過這種方式是洗不掉的,。

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#7/出現(xiàn)非均一性背景

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原因分析

膜可能在孵育或洗滌過程中干過,。

解決辦法

每一步的操作過程中,注意不要讓膜干,。

經(jīng)驗之談

封閉時洗一抗洗二抗,,以及發(fā)光時都應(yīng)時刻注意切記蛋白面風(fēng)干,一旦風(fēng)干很可能會導(dǎo)致這個結(jié)果,。

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#8/某個條帶變形

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原因分析

SDS-PAGE 膠中存在氣泡或某不溶性顆粒,。

解決辦法

配膠過程中,要注意不要使用無雜質(zhì)液體,。

經(jīng)驗之談

很多實(shí)驗室中使用的不是最新設(shè)備,,比如配膠用的海綿墊,如果用了很多年,,會從下面往上面漏小氣泡,,當(dāng)氣泡足夠小并且膠快凝固的時候,走到中間的小氣泡就停留在膠內(nèi),,并會影響到后面的跑膠,。另外配膠用的水,SDS,,Tris 緩沖液要注意不要有雜質(zhì),。

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#9/條帶不均一

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原因分析

a.配置膠凝固不均一。

b.轉(zhuǎn)膜問題:轉(zhuǎn)膜夾子不緊,,轉(zhuǎn)膜濾紙或海綿由于使用消耗,,濾紙及海綿變薄,海綿彈性不足,。

c.一抗孵育問題:抗體孵育不充分或抗體稀釋液放入過少,。

解決辦法

a.把膠配好,不合格的膠堅決不用,。

b.及時更換轉(zhuǎn)膜濾紙和海綿,。

c.增大抗體稀釋液用量、更換蹺蹺板類型的搖床將膜完全進(jìn)入抗體稀釋液中,。

經(jīng)驗之談

出現(xiàn)啞鈴最大的可能是膠沒有配好,,膠凝固后不均一。如果你拔完梳子后出現(xiàn)上圖中下面部分的情況,,多半會出現(xiàn)啞鈴狀,。另外還有一種可能是樣品中含有太多雜質(zhì),沒有離心下來,,然后雜質(zhì)沉積在孔的中間,,蛋白自然被推擠到兩邊。

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#10/最邊緣條帶彎曲

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原因分析

電泳電流不均一,,玻璃板右下側(cè)有缺口,。

解決辦法

換用新的玻璃板,不使用兩邊的兩孔,。

經(jīng)驗之談

一般我們使用的是 10 孔的膠,,如果你上樣剛好 10 個孔,那么最兩頭的兩個孔肯定會歪曲,。另外上樣最好在膠的中間,,這樣電場均一。

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#11/條帶笑臉,,marker正常

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一般來說笑臉問題首先考慮電泳環(huán)節(jié),,多半是凝膠沒凝固好。但上圖 marker 卻異常整齊,,笑臉條帶整齊地手拉手,,這就不是凝膠問題導(dǎo)致的,。

原因分析

a.loading buffer 失效,,導(dǎo)致樣品變性失敗,。

b.上樣量過大或樣品雜質(zhì)多。

c.電壓太高,。

解決辦法

a.更換 loading buffer,。

b.超濾樣品或降低上樣量,。

c.降低電壓。

經(jīng)驗之談

準(zhǔn)備樣本主要確認(rèn)上樣緩沖液是否為近期配置,,并且要妥善保存,,否則就會浪費(fèi)珍貴的實(shí)驗樣本。一般電泳過程中恒壓電泳,,濃縮膠 80V,,分離膠 120V,整個過程差不多需 2 個小時左右,。

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#12/曝光結(jié)果條帶扭曲

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原因分析

轉(zhuǎn)膜問題,,對于分子量稍大的蛋白,轉(zhuǎn)膜時間過長,,轉(zhuǎn)膜裝置產(chǎn)熱過多,,無法維持轉(zhuǎn)膜時的低溫環(huán)境,造成條帶扭曲,。

解決辦法

建議在條件允許的情況下直接在 4℃ 中進(jìn)行轉(zhuǎn)膜,,將冰更換為冰水混合物,及時更換轉(zhuǎn)膜液并將轉(zhuǎn)膜液放入 4℃ 中提前預(yù)冷,。

經(jīng)驗之談

對于大分子量的抗體,,跑膠前可以先把樣本煮一下,然后稍微離心一下,,同樣也可以改善這種情況,。

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WB實(shí)驗操作視頻

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高清完整版!

完整的 WB 實(shí)驗包括了很多步驟,,從蛋白提取到配膠,、上樣電泳,再到轉(zhuǎn)膜,、封閉,,最后孵育一抗二抗后才能去進(jìn)行檢測。時間跨度非常長,,而且這中間的每一步都包含了很多小細(xì)節(jié),,稍有不慎就會導(dǎo)致結(jié)果出錯,然后又得從頭來過,。

以下是大博士出品的 WB 實(shí)驗操作視頻,,手把手教大家如何對實(shí)驗步驟關(guān)鍵點(diǎn)進(jìn)行精細(xì)化操作,。

【點(diǎn)擊放大觀看】

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實(shí)驗技術(shù)手冊

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干貨福利免費(fèi)領(lǐng)!

本實(shí)驗技術(shù)手冊為博士德資深技術(shù)人員根據(jù)多年實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗嘔心瀝血編寫,,圍繞以下目錄中八大核心技術(shù)內(nèi)容展開,,無論對于科研萌新或?qū)嶒炦_(dá)人都是滿滿的純干貨,。

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內(nèi)容審核:康晉偉
項目審核:朱超敏

題圖來源:博士德

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