幕府的出現(xiàn)標(biāo)志著日本皇權(quán)被武家政治取代,，在第二個(gè)室町幕府建立之前,，第一個(gè)鐮倉(cāng)幕府已經(jīng)統(tǒng)治日本一百多年，至1333年的時(shí)候鐮倉(cāng)幕府這艘大船早已是千瘡百孔,，日本迫切需要一場(chǎng)變革。

此時(shí)正值中國(guó)元朝末年,，已經(jīng)不是那個(gè)有能力遠(yuǎn)洋攻擊日本的元朝，脫歡帖木兒在這一年繼承大統(tǒng),，是為元順帝,，而一衣帶水的日本也將迎來(lái)改朝換代,。眼見鐮倉(cāng)幕府的統(tǒng)治即將崩潰，以皇室為首的公家勢(shì)力發(fā)動(dòng)倒幕戰(zhàn)爭(zhēng),，隨著幕府大將足利尊氏的臨陣倒戈，鐮倉(cāng)幕府宣布終結(jié),。

董卓死了還有曹操，漢獻(xiàn)帝不會(huì)高興太久,。日本天皇就像漢獻(xiàn)帝或東周天子,，渴望推行“王政復(fù)古”,，也就是收回中央權(quán)力，而足利尊氏更像曹操，一心取代鐮倉(cāng)幕府成為新的實(shí)際統(tǒng)治者,。

雙方的嫌隙最終引爆戰(zhàn)爭(zhēng)，當(dāng)足利尊氏討伐鐮倉(cāng)殘余勢(shì)力并得勝還朝之后,，順勢(shì)囚禁天皇。隨后天皇逃出京都,，并在京都以南的吉野另立朝廷,，吉野位于今天日本奈良縣中部,，距離京都并不算遠(yuǎn)，但日本卻由此進(jìn)入南北朝時(shí)期,。

天皇逃跑時(shí)帶走了象征皇權(quán)的三神器：草雉劍,，八咫鏡和八尺瓊勾玉，當(dāng)時(shí)尊奉南朝為正朔的大名并不在少數(shù),，南朝鼎盛之時(shí)占據(jù)著本州島的三分之一,、九州島和四國(guó)島的全境，相當(dāng)于今天日本國(guó)全境的五分之三,。

為了時(shí)刻監(jiān)視南朝的動(dòng)向，足利尊氏就不能仿效鐮倉(cāng)幕府將治所放在遠(yuǎn)離京都的關(guān)東,，而是在京都室町殿開設(shè)幕府,，這也是室町幕府名字的由來(lái)。

然而作為武士的龍興之地,，關(guān)東實(shí)在是太重要了,，如果放任不管，難免在日后生出變故,，所以足利尊氏又派出自己的次子足利基氏統(tǒng)領(lǐng)關(guān)東諸國(guó),，這一職位被稱為“關(guān)東公方”或“鐮倉(cāng)公方”。關(guān)東公方的權(quán)力非常之大,，在所轄區(qū)域可以自行其是,，事實(shí)上就是一個(gè)小幕府。再加上關(guān)東公方與幕府一系同宗同源,，所以公方本人也是幕府將軍強(qiáng)有力的競(jìng)爭(zhēng)人選,。

室町幕府的建立，源于反對(duì)鐮倉(cāng)幕府的諸多倒幕勢(shì)力,，足利氏對(duì)其他手握重兵的大名沒(méi)有絕對(duì)的掌控力,。換言之，大名集團(tuán)承認(rèn)足利氏為己方陣營(yíng)中的翹楚，但足利氏并無(wú)權(quán)力對(duì)這些大名進(jìn)行生殺予奪,，甚至在許多國(guó)家大事上,，幕府都必須聽取這些實(shí)力派大名的意見。此時(shí)南朝的威脅尚在,，為了爭(zhēng)取“地頭蛇”們的支持,，室町幕府不斷下放權(quán)力給各地大名，這也促成了后來(lái)的日本戰(zhàn)國(guó)亂世,。

當(dāng)時(shí)日本全境分為六十六個(gè)令制國(guó),，強(qiáng)大的大名比如山名氏，一家就獨(dú)占十一國(guó),，被世人私下稱為“六分之一殿”,，其他實(shí)力派大名如大內(nèi)氏占據(jù)六國(guó)，這些都足以對(duì)室町幕府的統(tǒng)治構(gòu)成實(shí)質(zhì)性威脅,。類似的情形在中國(guó)歷史上也不乏出現(xiàn),，面對(duì)“支強(qiáng)干弱”的情況，中國(guó)天子慣用的手法是削藩,，有的成功了,，如漢武帝推恩令；有的失敗了,，如建文帝靖難之役,。

當(dāng)室町幕府傳至第三代將軍之時(shí)，確實(shí)通過(guò)削藩打擊過(guò)地方豪強(qiáng),，但后續(xù)繼任的將軍卻無(wú)一擁有足以匹敵祖先的權(quán)謀和威望,，日本進(jìn)入戰(zhàn)國(guó)時(shí)代。有人說(shuō)日本戰(zhàn)國(guó)就像村鎮(zhèn)互毆,，規(guī)模遠(yuǎn)不如中古的戰(zhàn)國(guó),，戰(zhàn)國(guó)七雄隨便一個(gè)都能統(tǒng)一日本。

當(dāng)天下紛爭(zhēng)已成定局之時(shí),，幕府迎來(lái)了最后一任將軍,，在其繼任的第五個(gè)年頭,，梟雄織田信長(zhǎng)將其放逐，室町幕府自此不復(fù)存在,。日本進(jìn)入織田信長(zhǎng)與豐臣秀吉稱霸日本的時(shí)代,，也就是日本戰(zhàn)國(guó)的頂峰時(shí)期。