在清代,，蒙古族,、維吾爾族、藏族等少數(shù)民族居住的內(nèi),、外蒙古及青海、新疆,、西藏等地區(qū)被稱為“蕃部”,，而維吾爾民族居住的天山以南地區(qū)又被稱為“回部”。

清朝統(tǒng)一漠南,、漠北和漠西三大蒙古各部后,，把蒙古分為內(nèi)屬蒙古、外蕃蒙古和八旗蒙古,，并在政治和軍事上對蒙古進行了重大的改革,，實行盟旗制度和軍府制度。清政府一方面采取聯(lián)盟政策,，充分利用蒙古各部的力量為其統(tǒng)一和鞏固服務(wù),，還設(shè)立理蕃院，負責(zé)制定和研究貫徹對蒙古的政策,，專門處理對蒙古(包括新疆,、西藏)的事物。另一方面,，又采取防御和削弱蒙古各部力量的政策,，把蒙古族列入以滿族統(tǒng)治階級為核心的政治行政體制，建立由中央直轄的軍事機構(gòu),，直接派遣將軍,、都統(tǒng)和大臣等官吏,，對蒙古地區(qū)進行監(jiān)督和行政控制。在漠南蒙古,、漠北蒙古,、漠西蒙古相繼設(shè)立將軍、都統(tǒng)(副都統(tǒng)),、總管,、、大臣,，用以加強對蒙古族的統(tǒng)治,。這些官員大多是滿人，一般都是皇親國戚,，少數(shù)為蒙古人,。

他們代表清政府，在蒙古地區(qū)具有極大權(quán)威,，所有蒙古貴族都要受其節(jié)制和調(diào)遣,。清朝在漠南除盛京將軍、黑龍江將軍,、吉林將軍直控今哲里木蒙古地區(qū)外,，還設(shè)有綏遠將軍、熱河都統(tǒng),、察哈爾都統(tǒng),、呼倫貝爾副都統(tǒng)、安北將軍,、左衛(wèi)將軍等,，在喀爾喀蒙古地區(qū)設(shè)有定邊左副將軍(或稱烏里雅臺將軍)、科布多參贊大臣,、庫倫辦事大臣,，其下又按需要設(shè)有多名都督、副將軍和參事等職務(wù),。在青海設(shè)西寧辦事大臣,。在寧夏、陜甘地區(qū)有寧夏大臣直控阿拉善蒙古,，設(shè)陜甘總督直控額濟納蒙古,。在新疆設(shè)伊犁將軍，其下設(shè)烏魯木齊都統(tǒng),、塔爾巴哈臺和喀什噶爾參贊大臣與領(lǐng)隊大臣等等,。

“札薩克”系蒙古語，意為“執(zhí)政官”，是清朝時主要對蒙古族和滿族人授予的軍事,、政治官職,。有內(nèi)札薩克與外札薩克之分。

內(nèi)札薩克蒙古或內(nèi)札薩克,，指歸附清朝較早的漠南蒙古各旗札薩克,，地位在外札薩克之上，屬于外蕃蒙古,。乾隆以后,，內(nèi)札薩克分為二十四部四十九旗，由理蕃院旗籍清史司,、王會清史司管理,。

外札薩克蒙古，指清代外蕃蒙古中除內(nèi)蒙古二十四部以外的蒙古各旗,，與哈密,、吐魯番、西藏等地的郡王同為外札薩克,。外札薩克蒙古包括西套蒙古二旗,、漠北喀爾喀四部以及科布多、青海,、新疆所屬札薩克各旗，由理蕃院典屬清吏司與柔遠清吏司管理,。清末,，外札薩克蒙古有時僅指揮喀爾喀四部，后演變出外蒙古的概念,，即土謝圖汗部,、賽音諾顏部、車臣汗部與札薩克圖汗部,。

旗為軍事,、行政合一的單位，由清政府在旗內(nèi)王公中任命札薩克為旗長,，可以世襲,。其職權(quán)為戰(zhàn)時動員本旗兵丁出戰(zhàn)，平時總攬本旗行政,、司法,、稅收等項事務(wù)。下設(shè)協(xié)理臺吉(札薩克之副職),、管旗章京(次于臺吉之管旗官)等僚屬,，協(xié)助札薩克治事。旗以下置佐(或稱“箭”，蒙古語為“蘇木”),，設(shè)佐領(lǐng),。佐原為基本軍事單位，后逐漸成為旗以下的一級行政單位,。佐領(lǐng)不僅統(tǒng)領(lǐng)本佐兵丁,，還辦理清冊、收稅,、征丁等事宜,。佐的多少標(biāo)志著一個旗的兵力狀況。原則上,，佐由150名壯丁組成,，但實際上有增無減。凡年在18～60歲的蒙古男丁,，都有服兵役的義務(wù),。內(nèi)札薩克建旗少而置佐多，外札薩克建旗多而置佐少,，有的旗甚至只置1佐,。

盟為旗的會盟組織，合數(shù)旗而成,。盟的蒙古語名稱是楚右勒干,，意為聚會、盟的名稱一般以會盟地點命名,。每盟設(shè)盟長1人,、副盟長1人。盟長原由盟內(nèi)各旗札薩克在會盟時推舉,，后改由理蕃院在盟內(nèi)各旗中推舉合適人選并簽請皇帝批準3兼攝,。喀爾喀蒙古各盟是在部的基礎(chǔ)上建立的,，所以部長又是盟長,。盟并非一級行政機構(gòu)，盟長的主要任務(wù)是充當(dāng)三年一次的會盟召集人,，履行比丁,、練兵、清查錢谷,、審理重大刑民案件等職責(zé),，但無權(quán)發(fā)兵，不能直接干涉各旗內(nèi)部事務(wù),，也無權(quán)向各旗發(fā)布命令,，只是對盟內(nèi)各旗札薩克實行監(jiān)督,，有責(zé)任隨時告發(fā)札薩克的不法或叛逆行為。額魯特蒙古各盟則不設(shè)盟長,，其盟務(wù)由管轄該地區(qū)的將軍或辦事大臣直接掌管,。

蒙古地區(qū)的旗分為總管旗、札薩克旗,、喇嘛旗三種,。總管旗設(shè)總管,，由朝廷派遣到將軍,、都統(tǒng)、大臣直接統(tǒng)轄,，其中包括內(nèi)屬的察哈爾8旗,、歸化土默特翼及熱河都統(tǒng)所轄額魯特一旗，科布多參贊大臣所轄明阿特,、扎哈沁各一旗,、阿爾泰和阿爾泰諾爾烏梁海九旗、定邊左副將軍所轄唐努烏梁海五旗,、駐藏大臣所轄達木蒙古八旗等,。

其余大多數(shù)蒙古部之旗，稱為札薩克旗,，受中央監(jiān)督,。札薩克旗又分為內(nèi)札薩克(漠南蒙古，亦稱內(nèi)蒙古,，六盟二十四部四十九旗)加上阿拉善,、額濟納二旗和外札薩克(由漠北蒙古，又稱外蒙古或喀爾喀蒙古,，四盟六部八十六旗)，以及漠西蒙古八盟四部六十四旗(包括青海蒙古二十九旗,，新疆蒙古二十二旗,，科布多蒙古三十二旗組成)，共18盟,、59部,、246旗。

蒙古札薩克之爵位有札薩克和碩親王,、札薩克多羅郡王,、札薩克多羅貝勒、札薩克鎮(zhèn)國公,、札薩克輔國公,、一至四等札薩克臺吉(或一至四等塔布囊)。有爵位而非札薩克者，稱為閑散王公,、閑散臺吉,。

清政府實行盟旗制度后，由清政府派遣官吏進行管理,，建立直屬于清政府的各級行政組織,，從而把北方民族地區(qū)的政權(quán)與清政府進一步聯(lián)成一體，同時使邊疆各民族和內(nèi)陸各族人民也進一步連成一體,，加強各族人民密切的經(jīng)濟聯(lián)系,，形成更加牢固的統(tǒng)一整體，為我國統(tǒng)一的多民族國家的形成,，為我國疆域的形成,，成為各民族經(jīng)濟的共同發(fā)展，奠定了良好的基礎(chǔ),。