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單細(xì)胞表觀研究 染色質(zhì)開放性分析（ATAC-Seq）近年來(lái)已成為表觀基因組學(xué)研究領(lǐng)域的新寵,。ATAC-Seq是通過(guò)改造后的Tn5轉(zhuǎn)座酶介導(dǎo)，對(duì)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的開放區(qū)域進(jìn)行捕獲測(cè)序,，僅需少量細(xì)胞便可獲得全基因組的活性調(diào)控序列信息,，廣泛應(yīng)用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合分析、核小體定位,、活性調(diào)控元件分布等研究,。 由于實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單，樣本起始量要求少等優(yōu)勢(shì),，ATAC-Seq目前應(yīng)用非常廣泛,。 然而，針對(duì)單細(xì)胞的ATAC-Seq（scATAC-seq）當(dāng)前方法要么保持相對(duì)較低的通量,，要么提供較低數(shù)據(jù)量,。因此需要一個(gè)靈敏度、靈活性及通量較高的新方法來(lái)做單細(xì)胞研究,。 如何突破單細(xì)胞研究通量？  來(lái)自美國(guó)的研究人員在《Nature Biotechnology》發(fā)表了一種基于液滴-微流控技術(shù)為基礎(chǔ)的單細(xì)胞染色質(zhì)可及性分析方法：dscATAC-seq ,。該技術(shù)解決了快速分離細(xì)胞的難題,，大幅提升了單細(xì)胞分析速度。 dscATAC-seq提供了一個(gè)強(qiáng)大的新工具,，將大量DNA調(diào)控元件與功能聯(lián)系起來(lái),，可被應(yīng)用于分析健康個(gè)體或患者群體的表觀基因組變異，以確定共同特征或疾病背后的調(diào)控元件和細(xì)胞類型的功能角色。 01   dscATAC-seq通過(guò)實(shí)驗(yàn)與算法的創(chuàng)新,，可獲取95%的細(xì)胞數(shù)據(jù),，通過(guò)對(duì)46,653個(gè)成年小鼠大腦細(xì)胞類型和調(diào)節(jié)因子的無(wú)偏發(fā)現(xiàn)，對(duì)其進(jìn)行驗(yàn)證,。 02  此外,，研究人員擴(kuò)展了dscATAC-seq方法，通過(guò)在Tn5轉(zhuǎn)座酶接頭序列加標(biāo)簽的方式,，結(jié)合之前的dscATAC-seq,，開發(fā)出dsciATAC-Seq成功將每次反應(yīng)分析的細(xì)胞擴(kuò)大到50000個(gè)。 03  通過(guò)檢測(cè)136,463個(gè)靜息和受刺激狀態(tài)的骨髓來(lái)源細(xì)胞的染色質(zhì)可及性,，驗(yàn)證了dsciATAC-Seq的實(shí)用性,，揭示了單細(xì)胞分辨率下刺激后不同細(xì)胞類型的順式和反式調(diào)節(jié)變化的景觀。  這種高通量單細(xì)胞表觀基因組學(xué)的新方法為獲得正常組織的表觀基因組圖譜指明了清晰的道路,，并為大規(guī)模的單細(xì)胞表觀基因組分析提供了新的機(jī)會(huì),。 課程預(yù)告 下周CNGBdb組學(xué)系列課程又要上新咯，關(guān)鍵詞：單細(xì)胞技術(shù),。 參考文獻(xiàn) Lareau C A, Duarte F M, Chew J G, et al. Droplet-based combinatorial indexing for massive-scale single-cell chromatin accessibility[J]. Nature Biotechnology, 2019: 1. 圖片來(lái)源：均來(lái)自于參考文獻(xiàn),，如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系刪除。
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