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第八屆全國功能基因組學高峰論壇-微生物分會場 完美落幕!

 菌心說 2021-10-23

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2021年10月19日,,由北京百邁客生物科技有限公司主辦的“第八屆全國功能基因組學高峰論壇-微生物分會場”線上直播會議完美落幕,。

全國功能基因組學高峰論壇始于2014年,每年舉辦一屆,,至今已成功舉辦八屆,,累計邀請近800名專家學者進行大會主題報告,7000余名與會科研人員,、近百家大眾及行業(yè)合作伙伴,、媒體朋友參加此盛會,在業(yè)界形成了較高的行業(yè)影響力和認可度,。

大會得到了各位專家,、學者的大力支持,本次論壇微生物分會場共邀請到中國科學院水生生物研究所繆煒研究員,、山東大學張玉忠教授,、自然資源部第三海洋研究所龔林鋒助理研究員、中國科學院海洋研究所趙峰副研究員,、中國地質大學(武漢)王紅梅教授,、中科院遺傳發(fā)育所劉永鑫高級工程師、中南大學腫瘤研究所周文研究員,、廣東省微生物研究所謝黎煒研究員,、內蒙古農業(yè)大學孫志宏研究員、中國科學院北京生命科學研究院趙方慶研究員等10位著名專家學者,,共同探討最新研究進展及發(fā)展方向,。此外,百邁客微生物產品部副總監(jiān)王年和珀金埃爾默企業(yè)管理(上海)有限公司資深應用專家王萌也帶來了主題報告,。


大會精彩報告


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中國科學院水生生物研究所繆煒研究員介紹了“萬種原生生物基因組計劃”,,2019年12月30日,由中國科學院水生生物研究所聯(lián)合西藏大學,、河南農業(yè)大學,、中國農業(yè)科學院蘭州獸醫(yī)研究所,、中國科學院北京基因組研究所和華中科技大學等單位共同發(fā)起“萬種原生生物基因組計劃”(Protist 10,000 Genomes Project, 簡稱P10K),,旨在繪制萬種代表性原生生物基因組圖譜,,建立一個大規(guī)模的原生生物遺傳資源數(shù)據(jù)庫。

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山東大學張玉忠教授講述了“海洋微生物的多樣性,、獨特的生命特征及其適應與進化機制:基因組分析與整合生物學研究,。”張老師團隊首先從基因組層面,,系統(tǒng)揭示了深海,、極地海域微生物的多樣性及生物地理分布特征;然后,,揭示了深海,、極地海域微生物獨特的生命特征及極端環(huán)境適應與進化的基因組學證據(jù)。在此基礎上,,從微生物生理學,、遺傳學、生物化學與結構生物學等多個層面,,系統(tǒng)闡明深海,、極地海域微生物獨特的生命特征、環(huán)境適應與生態(tài)效應的分子機制,,為開發(fā)利用深海,、極地海域微生物及其基因資源奠定理論基礎。

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自然資源部第三海洋研究所龔林鋒助理研究員向大家介紹了“深海(熱液)生物資源和空間信息大數(shù)據(jù)平臺”,,該平臺是基于“標準建設,安全保障,,高效共享,,全面服務”理念,建立以空間信息系統(tǒng),、海洋環(huán)境數(shù)據(jù)為基礎的,,一系列專業(yè)的樣品、(微)生物,、微生物菌株,、基因、化合物的實物信息和基因信息大數(shù)據(jù)平臺,,將為深海生物資源的科學研究,、開發(fā)利用和服務共享提供巨大支撐。

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中國科學院海洋研究所趙峰副研究員介紹了“深海真核微生物分子多樣性與地理分布”趙老師團隊利用高通量DNA測序研究了從潮間帶到大陸架,,直至深海平原,、海山和熱液區(qū)沉積物中真核微生物的多樣性和地理分布模式,。溯源分析表明:大陸架和深海平原源-匯關系比其他生境更緊密,生境差異對群落變異的貢獻大于空間變量和水深,。
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中國地質大學(武漢)王紅梅教授的報告題目:“洞穴地下生物圈的組成,、功能及生態(tài)學意義”,王教授向大家介紹了洞穴生態(tài)系統(tǒng),,洞穴是開發(fā)抗生素等新藥物的重要來源,。隨后介紹了洞穴地下生物圈中的微生物:組成及功能,針對大氣甲烷氧化菌進行詳細講述,。最后對未來大氣甲烷氧化菌的未來發(fā)展方向進行了展望,。

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百邁客生物科技有限公司微生物產品部王年副總監(jiān)帶來報告“升級微生物組研究的幾款利器”主要介紹了微生物組研究技術,詳細介紹了百邁客對PacBio 全長擴增子產品的研發(fā)投入,,促使技術普及,,包括串聯(lián)建庫體系,以及配套的生信算法和專有數(shù)據(jù)庫輔助注釋,。同時,,也介紹了nanopore測序技術在宏基因組測序上的優(yōu)勢和應用場景。緊接著介紹了微生物組和代謝組聯(lián)合分析研究思路,。最后,,介紹了如何利用百邁客云平臺為科學研究提效。

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中科院遺傳發(fā)育所劉永鑫高級工程師的報告題目是“擴增子和宏基因組數(shù)據(jù)分析與可視化流程”,。劉老師首先介紹了微生物組研究技術,,研究方法,詳細介紹了分析流程及相關軟件,。對當前宏基因組數(shù)據(jù)分析的主流方法進行整理和總結,,為同領域研究者更方便、靈活的開展數(shù)據(jù)分析,,快速選擇研究分析工具,,高效挖掘數(shù)據(jù)背后的生物學意義提供參考,進一步推動微生物組研究領域的發(fā)展,。

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中南大學腫瘤研究所周文研究員的報告題目是“多發(fā)性骨髓瘤腸道微生物-宿主代謝互作機制及干預”,,周老師首先介紹了多發(fā)性骨髓瘤(Multiple Myeloma, MM)的特點,隨后介紹了課題組利用宏基因組測序技術得到的發(fā)現(xiàn),,MM患者腸道微生物生態(tài)紊亂,,并出現(xiàn)氮源微生物的優(yōu)勢生長,腸道微生物-宿主代謝兩者互作從而加速宿主MM的腫瘤進程,。通過干預MM患者腸道菌群和氮源攝入可作為MM治療的新靶標,。 

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廣東省微生物研究所謝黎煒研究員講解了“腸道微生物:代謝性疾病的干預窗口”謝老師首先介紹了腸道菌群是多因素誘發(fā)肥胖癥的承載體,代謝性疾病,,例如:2型糖尿病,,肥胖和代謝性肝病等,,嚴重損害身體健康,甚至致殘致死,。研究發(fā)現(xiàn)代謝性疾病的發(fā)生和發(fā)展伴隨腸道微生物多樣性,、種類和功能的變化,謝老師團隊近期開展的短期理床低碳減重研究和益生菌代謝產物緩解機體糖脂代謝的研究為代謝性疾病的腸道干預提供了有力的證據(jù),。

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內蒙古農業(yè)大學孫志宏研究員課題組靳煒博士帶來了“基于納米孔的宏基因組測序揭示了人類腸道微生物基因組的暗物質”的主題報告,,靳老師介紹了人類腸道微生物組研究進展,提出因為絕大多數(shù)研究采用二代測序,,導致了無法解決基因組重復區(qū)的問題,,并使組裝連續(xù)受到限制。孫老師課題組整合了來自180個人類腸道樣本的3.7Tbp Nanopore平臺和21.6Tb Illumina平臺高質量宏基因組數(shù)據(jù),,并從中還原符合高質量MIMAG標準的宏基因組組裝基因組(MAGs),。該方法將第三代與第二代超深度測序相結合,大幅提高了宏基因組組裝的準確性和連續(xù)性,。

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中國科學院北京生命科學研究院趙方慶研究員的報告主題為“微生物組:金礦還是泡沫,?”趙老師提出高通量測序技術為基礎的微生物組學已經是目前最為關鍵和成熟的組學方法,也已成為基因組研究領域最活躍的方向之一,。趙老師團隊重點開發(fā)了多種微生物組學研究的新技術和新方法,,包括:RiboFR-seq、metaSort,、inGAP-sf,、inGAP-CDG和CRIPSR-network等。為高效解讀微生物組提供了全新的技術手段,。

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PerkinElmer公司資深應用專家王萌帶來了“PerkinElmer樣本質控及NGS整體解決方案”報告,,向大家詳細介紹了基于樣品質控金標準的LabChip微流控技術,它可以提供全面,、高質量的核酸質控數(shù)據(jù),。隨后介紹了LabChip GX Touch提供的全面核酸樣本分析及應用案例展示,以及PerkinElmer的NGS全流程解決方案,。最后,,介紹了PerkinElmer explorer G3全自動平臺,,可運用于全自動化超高通量NGS文庫構建,,新冠萬人份核酸檢測等。

在濃厚的學術氛圍下,,第八屆百邁客全國功能基因組學高峰論壇-微生物分會場落下了帷幕,!通過這次峰會,充分展示了功能基因組學研究領域的重大進展,,加強了行業(yè)信息與資源的共享,,促進了該領域的交流與合作,,將對我國功能基因組學研究的深入和發(fā)展起到推動作用。

      相信每一位參會人員都受益匪淺,,也祝愿每一位研究學者都能喜報頻頻,!讓我們共同期待2022年“第九屆全國功能基因組學高峰論壇”,我們將繼續(xù)秉承大會“解讀基因,、助力科研”的使命,,努力將此論壇打造成行業(yè)標桿性學術交流盛會!
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干貨|百邁客單細胞 & 空間轉錄組專題系列

百邁客生物基于高通量測序技術,、生物信息分析技術和生物云計算技術,,為廣大科研工作者提供以綜合技術服務、生物云分析,、三代高通量測序以及試劑,、儀器等科研周邊業(yè)務。

公司擁有Nanopore,、PacBio,、Illumina、Waters,、10XGenomics等主流服務平臺,,以及基于云架構的生物云計算平臺—百邁客云,提供涵蓋人重外顯子,、三維基因組,、單細胞與空間轉錄組、基因組組裝,、轉錄調控,、微生物、群體遺傳,、質譜及表觀遺傳等研究方向的技術服務,。目前百邁客云平臺擁有200多款基因分析工具,分析結果可直接用于文章發(fā)表,,更有近百部科研相關視頻和8大基因數(shù)據(jù)庫助力科研工作者深度數(shù)據(jù)挖掘,。

自公司成立起先后在《Cell》、《Nature》,、《Nature Genetics》,、《Nature Communications》、《Plant Cell》等學術刊物發(fā)表論文數(shù)千篇,,擁有國家發(fā)明專利技術40余項,,軟件著作權近200余項。

我們一直秉承”生物科技創(chuàng)新,,服務社會,,造福人民”的企業(yè)使命,,致力于打造“生物科技創(chuàng)新中心”的發(fā)展愿景,讓生物科技更快,,更好的提高人類生活質量,。

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