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linux Ubuntu安裝及更新升級(jí)R教程

 jingda 2021-10-20
Distributor ID: Ubuntu
Description:    Ubuntu 18.04.3 LTS
Release:    18.04
Codename:   bionic

安裝

今天下午安裝了一下午的R,,稍微記錄一下吧。由于之前都是在window上安裝R和Rstudio,傻瓜式next安裝即可,,由于實(shí)驗(yàn)室老服務(wù)器之前重裝了,,一直沒(méi)有R,正好這兩天在幫師兄跑一下svm,,加上考慮到以后師弟師妹可能也要用,,那就在服務(wù)器上安裝一下吧。

  1. 首先來(lái)到R官網(wǎng)鏈接: link,,點(diǎn)擊鏡像
    1
  2. 來(lái)到鏡像頁(yè)面后,,選擇我們國(guó)內(nèi)鏡像,例如我選擇的清華鏡像
    2
  3. 接下來(lái),,來(lái)到我們的linux系統(tǒng)下的 /etc/apt/sources.list,,在里面添加清華鏡像deb https://mirrors.tuna./CRAN/bin/linux/ubuntu/ bionic-cran35/,需要注意的是,,不同的Ubuntu版本 以及不同的R版本是不一樣的,。這里是 Ubuntu18.04,下載R3.6.3版本,。其他版本詳細(xì)查看鏈接: readme.
    3
  4. 然后,,添加進(jìn)去之后,執(zhí)行 sudo apt-get update,,更新源,。然后執(zhí)行sudo apt-get install r-base r-base-core r-base-dev下載。第一次安裝很快成功,。輸入R,,可看到下圖4
    即表示安裝成功。輸入q()退出R,到這里安裝成功了,。

更新升級(jí)

  1. 首先把之前的版本清除干凈,,remove 會(huì)刪除軟件包而保留軟件的配置文件;purge 會(huì)同時(shí)清除軟件包和軟件的配置文件
sudo apt-get --purge remove r-base
sudo apt-get --purge remove r-base-core
sudo apt-get --purge remove r-base-dev
  1. 并且,,之前的R包也需要清理
"/usr/local/lib/R/site-library"
"/usr/lib/R/site-library"
"/usr/lib/R/library"
  1. 由于我之前安裝的是3.4版本,,我現(xiàn)在需要升級(jí)為3.6.3版本,那么同樣,,我需要先進(jìn)入 /etc/apt/sources.list文件,,在里面添加清華鏡像deb https://mirrors.tuna./CRAN/bin/linux/ubuntu/ bionic-cran35/.
    – 如果升級(jí)為4.0版本,那么更改為https://mirrors.tuna./CRAN/bin/linux/ubuntu/ bionic-cran40/,,具體不同版本查看 readme.

  2. 然后更新key

sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9

sudo apt-get update

sudo apt-get install r-base r-base-core  r-base-dev
  1. 到這里,,就成功了。

走過(guò)的坑

  1. 在這里,,我走過(guò)的坑是如下
r-base : Depends: r-recommended (= 3.6.2.20200221-1~ubuntu18.04.1~ppa1) but it is not going to be installed

這個(gè)是因?yàn)?,source源中的版本和linux系統(tǒng)版本不一致,注意查看,我之前寫成了16.04,,因?yàn)槲野裭inux版本給記錯(cuò),,之前沒(méi)重裝的時(shí)候才是16.04. sad~

  1. 另外,還出現(xiàn)這個(gè)錯(cuò)誤,,如果你是執(zhí)行了,,sudo add-apt-repository ppa:marutter/rdev,那么可以試著備份一下cd /etc/apt/sources.list.d的新添加的文件,,然后刪掉,,重新按照我上面的步驟升級(jí)更新。
The following packages have unmet dependencies:
 r-base-core : Depends: libcurl3 (>= 7.28.0) but it is not going to be installed
               Depends: libpng12-0 (>= 1.2.13-4) but it is not installable
               Depends: libreadline6 (>= 6.0) but it is not installable
E: Unable to correct problems, you have held broken packages.
  1. 如果出現(xiàn)這個(gè)錯(cuò)誤,,我認(rèn)為是你沒(méi)有刪除干凈,,導(dǎo)致依賴出現(xiàn)了問(wèn)題,重新按照我上面的更新步驟,,刪除干凈,,以及檢查你的源版本。如果兩個(gè)都沒(méi)問(wèn)題,,檢查你的依賴,,或者系統(tǒng)依賴退一個(gè)版本試試,由于我不是這個(gè)問(wèn)題,,正好搜到了這個(gè)答案,,記錄一下參考鏈接
  r-base : Depends: r-base-core (>= 3.6.2-1xenial) but it is not going to be installed
      Depends: r-recommended (= 3.6.2-1xenial) but it is not going to be installed
      Recommends: r-base-html but it is not going to be installed
 E: Unable to correct problems, you have held broken packages.
  • PPA
    https://blog.csdn.net/u012348774/article/details/80619803

參考文章
https://stat./pipermail/r-sig-debian/2018-July/002926.html
https:///questions/1422059/pixelbook-installing-r-base-dependency-with-held-broken-packages-error
https:///article/6222.html
https://www.jianshu.com/p/c7960451f969

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