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Ecology Letters|生命的普適性法則:代謝率、生物時(shí)和等適合度范式

 菌心說 2021-10-19

原文信息

原文標(biāo)題:Universal rules of life: metabolic rates, biological times and the equal fitness paradigm

發(fā)表期刊:Ecology Letters

影響因子:8.665

發(fā)表時(shí)間:2021.04.21

第一作者:Joseph Robert Burger, Chen Hou, Charles A.S Hall, James H. Brown

通訊作者:Joseph Robert Burger

第一單位:University of Arizona

原文鏈接:

https:///10.1111/ele.13715

編    譯:陳丹虹,、李婷,、侯海燕;云南大學(xué)國際河流與生態(tài)安全研究院

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摘要

本文綜述和擴(kuò)展了等適合度范式(EFP),,將其作為發(fā)展和檢驗(yàn)基于能量和新陳代謝的生態(tài)學(xué)和進(jìn)化論綜合理論的重要環(huán)節(jié)。EFP指出,,所有生物體在穩(wěn)定狀態(tài)下的適合度都是相等的,,因?yàn)樗鼈兎峙淞讼嗤瑪?shù)量的能量,約22.4 kJ/g/代用于繁殖后代,。一方面,,EFP可能看起來是重言式的,因?yàn)榈冗m合度對于生物多樣性的起源和維持是必要的,。另一方面,,EFP反映了生命的普遍規(guī)律:如何將能量的吸收、轉(zhuǎn)化和分配等生物新陳代謝過程以跨組織層面的方式與生態(tài)、進(jìn)化模式及過程聯(lián)系在一起,。其中所涉及的組織層級(jí)主要包括:1)單個(gè)有機(jī)體的結(jié)構(gòu)和功能,;2)種群的生活史和動(dòng)態(tài);3)生態(tài)系統(tǒng)中物種的相互作用和協(xié)同進(jìn)化,。新陳代謝的物理和生物學(xué)特性促進(jìn)了數(shù)百萬物種的進(jìn)化,,這些物種具有獨(dú)特的解剖學(xué)、生理學(xué),、行為學(xué)和生態(tài)學(xué),但也有許多共同的性狀和權(quán)衡,,這反映了生命的單一起源和普適性規(guī)則,。

引言

生命呈現(xiàn)出一種迷人的二元性。一方面,,生物種類繁多,令人驚嘆,。數(shù)以百萬計(jì)的動(dòng)物,、植物和微生物物種中的每一個(gè)都是獨(dú)一無二的。它們都有獨(dú)特的解剖學(xué),、生理學(xué),、形態(tài)學(xué)、行為學(xué)和生態(tài)學(xué)特征,,反映了它們獨(dú)特的生態(tài)位和系統(tǒng)發(fā)育史,。然而,在其它方面,,生物卻驚人的相似,。它們具有共同的結(jié)構(gòu)和功能基本特征,反映了它們的共同祖先以及對隨后進(jìn)化和多樣化的生物物理制約,。一些共同的性狀是在分子和細(xì)胞的組織水平上,,它們反映了遺傳和新陳代謝的生物化學(xué)。其它共有的性狀是在更高的組織水平上,,它們反映了生理性能,、種群動(dòng)態(tài)、生態(tài)系統(tǒng)組織和進(jìn)化多樣化的一般模式和過程。

生命的這種二元性是獨(dú)特而普遍的,,是自然選擇進(jìn)化的結(jié)果,。在一個(gè)種群內(nèi),基因和個(gè)體之間的變異導(dǎo)致不同的生存和繁殖,,并通過適合度修飾產(chǎn)生后代,。適合度是進(jìn)化生物學(xué)的核心概念:適合度更強(qiáng)的個(gè)體有更高的存活率或繁殖力,將其可遺傳性狀傳遞給后代,。自從達(dá)爾文提出進(jìn)化論以來,,理論生物學(xué)家一直在努力定義適合度,實(shí)驗(yàn)生物學(xué)家也一直在努力衡量它,。事實(shí)上,,生物學(xué)家已經(jīng)根據(jù)測量單位和分析水平以許多不同的方式定義了適合度(框1),但從根本上說,,適合度是將個(gè)體,、基因和/或數(shù)量遺傳性狀遺傳給下一代的能力。一個(gè)推論是,,盡管種群內(nèi)不同個(gè)體的適合度不同,,但在生態(tài)集群中,不同物種的適合度幾乎是相等的,。這種等適合度范式(EFP)是對生物圈可用能源有限供應(yīng)的競爭以及對生產(chǎn)和生存分配方式的限制和權(quán)衡的結(jié)果,。由此產(chǎn)生的物種近乎相等的適合度是生物多樣性起源和維持的必要條件,。

框1. 自然選擇和適合度的另一種定義

自從達(dá)爾文提出自然選擇進(jìn)化論以來,,生物學(xué)家一直在努力定義適合度。大多數(shù)定義認(rèn)為適合度是自然選擇使其最大化或最優(yōu)化的量,。自然選擇是在單一物種種群內(nèi)的基因,、數(shù)量性狀和個(gè)體之間的變異上進(jìn)行的,。當(dāng)進(jìn)行自然選擇時(shí),就會(huì)偏離穩(wěn)定狀態(tài),。適合度更強(qiáng)的個(gè)體在下一代留下更多的后代可遺傳性狀和后代,。在生活史、進(jìn)化論和生理生態(tài)學(xué)的文獻(xiàn)中,,已經(jīng)確立了以下幾種適合度的衡量標(biāo)準(zhǔn),。

增長率

其中一個(gè)是基于這樣的前提,即自然選擇傾向于最大限度地提高促進(jìn)繁殖或存活的可遺傳性狀,,以及擁有這些性狀的個(gè)體的增長率,。常用的測量方法有兩種:(1)種群生長率,r = 1/N dN/dt,,其中N是拷貝數(shù)或個(gè)體數(shù)量,;(2)凈繁殖率,,R0 = ∑lxfx,其中l(wèi)x存活率和fx繁殖力是年齡x的函數(shù),。當(dāng)自然選擇進(jìn)行時(shí),,這些指標(biāo)通常用于量化在偏離穩(wěn)定狀態(tài)期間種群內(nèi)等位基因、數(shù)量性狀,、基因型或表型的頻率每單位時(shí)鐘時(shí)間(r)或每代(R0)的變化率,。

最大功率

另一個(gè)建議是,選擇往往會(huì)最大化新陳代謝或生殖能力,。這被稱為最大功率原理(MPP),,主要由Alfred Lotka和H.T. Odum提出,。功率是以每次的能量單位(例如焦耳/秒或瓦特)來衡量的,。生物功率以呼吸或生產(chǎn)速率表示,隨著體重的增加而增加,,正比例于m3/4,。但是,更大更強(qiáng)壯的動(dòng)物不一定適合度更高,。

資源利用效率

生理生態(tài)學(xué)家經(jīng)常使用資源利用效率(RUE),,碳、水,、養(yǎng)分或其它一些限制性資源的RUE作為性能的衡量標(biāo)準(zhǔn),,暗示自然選擇往往使RUE最大化。效率是無單位的比率:RUE = output/input,,例如以g/g或kJ/kJ為單位,。然而,更高的RUE并不意味著效率更高的生物體一定適合度更高,。

終生繁殖能力

能量適合度E與Charnov的終生繁殖能力LRE有相似之處,,因?yàn)镋和LRE都被預(yù)測為近似恒定:與體型大小、繁殖力,、壽命和其它生活史性狀無關(guān),。Charnov的模型使用凈繁殖率R0作為適合度的衡量標(biāo)準(zhǔn),并對成分變量與體重的比例進(jìn)行了假設(shè),。LRE和E的最大區(qū)別在于前者沒有明確包含后代的生長和繁殖前死亡率(Wcoh,,公式7)。因此,,幾乎恒定的LRE預(yù)測似乎只適用于哺乳動(dòng)物和蜥蜴等動(dòng)物,,它們產(chǎn)生一些相對較大的后代,在獨(dú)立后生長和死亡率相對較小,。EFP可以看作是一種更為普遍的理論,,它把Charnov的恒定的終生繁殖能力模型作為一個(gè)特例。

上述定義不同于EFP的能量適合度E。EFP是由Brown等人(2018)開發(fā)的,,解釋了E ≈ 22.4kJ/g/代(公式1和2)在不同類群,、功能群和環(huán)境中的物種間的幾乎恒定值。與Hardy-Weinburg平衡定律一樣,,EFP使用穩(wěn)態(tài)假設(shè)來建立基線,,以量化偏離。因此,,EFP與重點(diǎn)關(guān)注自然選擇導(dǎo)致的性狀進(jìn)化的適合度定義是不同的,,但也是一致的。EFP與自然選擇可以增加上述適合度指標(biāo)(r,、R0,、代謝能力、RUE或L)的命題并不矛盾,。它會(huì)如此,,但只有在脫離穩(wěn)定狀態(tài)時(shí),或多或少多產(chǎn),、長壽,、強(qiáng)大或高效的變體才會(huì)暫時(shí)具有更高的能量適合度。

幾十年來,,由于使用不同的通用語,,生物組織水平和生態(tài)學(xué)與進(jìn)化學(xué)各分支學(xué)科之間的綜合一直受到阻礙。個(gè)體生物體層面的生理學(xué)家和生態(tài)系統(tǒng)層面的生態(tài)學(xué)家專注于新陳代謝,,并使用生物物理學(xué)的dE/dt通用語:能量和物質(zhì)的通量和儲(chǔ)存,。種群和群落層面的生態(tài)學(xué)家專注于種群動(dòng)態(tài),并使用數(shù)字dN/dt通用語:個(gè)體數(shù)量,。綜合各種通用語十分困難,,因?yàn)閷⑸镂锢頂?shù)據(jù)和生理與生態(tài)系統(tǒng)生態(tài)學(xué)理論轉(zhuǎn)換成人口學(xué)、種群和群落生態(tài)學(xué)的數(shù)字通用語非常困難,,反之亦然,。然而,最近,,生態(tài)學(xué)家開始關(guān)注能量代謝,,通過將個(gè)體的性能與生態(tài)位關(guān)系、生態(tài)系統(tǒng)組織和生物多樣性的新興結(jié)果聯(lián)系起來,,進(jìn)行跨學(xué)科和跨組織水平的綜合,。EFP是生物體內(nèi)捕獲的入射太陽能在物種間競爭和協(xié)同進(jìn)化的必然結(jié)果。

對適合度的能量定義

能量是生物的終極限制資源,。Boltzmann(1886)富有洞察力地寫道:“生物的'生存斗爭’是……主要通過綠色植物,,從炎熱的太陽到寒冷的地球的輻射能的轉(zhuǎn)移中獲得的自由能”,。通過綠色植物的光合作用捕獲并轉(zhuǎn)化為有機(jī)分子的太陽能基本上提供了有機(jī)體所使用的所有能量。在新陳代謝的過程中,,分子中的能量被釋放出來,,用來為生物的工作提供能量:同化、呼吸和生產(chǎn),。同化是從環(huán)境中吸收能量,。自養(yǎng)植物吸收太陽能、二氧化碳和氧氣,,并捕獲有機(jī)分子中的能量,。異養(yǎng)動(dòng)物和微生物通過消耗植物獲得生物質(zhì)能。呼吸作用是生物質(zhì)能轉(zhuǎn)化為工作能量的生物化學(xué)過程:有機(jī)分子與氧氣結(jié)合,,還原為二氧化碳和水,,能量被ATP分子捕獲。ATP在體內(nèi)運(yùn)輸,,并被轉(zhuǎn)化為ADP,,釋放能量進(jìn)行消化,、排泄,、活動(dòng)、生長和繁殖,。一些被同化的生物質(zhì)能不在呼吸中分解,,而是分配給生產(chǎn),并以后代生長和親代投資的形式傳遞給下一代,。

能量可以說是生物適合度最基本的通用語,,因?yàn)檫m合度的傳統(tǒng)組成部分(生存、生長和繁殖)都受到能量和物質(zhì)平衡的物理定律的支配,。能量平衡要求每一代在呼吸和生產(chǎn)之間分配從環(huán)境中吸收的能量,;分配給生產(chǎn)的能量在生長和繁殖之間分配。因此,,由于生產(chǎn)而獲得的能量與死亡所造成的能量損失相匹配(見下文和圖1),。能量平衡的一個(gè)結(jié)果是適合度可以用能量來表示

E = PcohGFQ                                                       (1)

其中E是能量適合度,單位為千焦耳/克/代,,Pcoh是父母一生中產(chǎn)生的后代的生物質(zhì)能生產(chǎn)(生長和繁殖)的質(zhì)量比率,,單位為克/克/年,G是以年為單位的世代時(shí)間,,Q是生物質(zhì)的能量密度,,以千焦耳/克為單位,F(xiàn)是在下一代中傳遞給存活后代的終生生物量的分?jǐn)?shù),。因此,,公式1定義了傳統(tǒng)達(dá)爾文適合度的組成部分,,生存、生長和繁殖,,根據(jù)物理通用語和能量新陳代謝的新陳代謝過程,。

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圖1. 單個(gè)動(dòng)物的能量平衡。從食物吸收的能量在呼吸和生產(chǎn)之間分配,;呼吸作用在ATP中捕獲的能量在基礎(chǔ)或靜息代謝和活動(dòng)新陳代謝(包括消化,、體溫調(diào)節(jié)、生長,、對病原體的免疫反應(yīng)以及運(yùn)動(dòng),、攝食、領(lǐng)土防御,、求偶和交配行為)之間分配,。生物質(zhì)能傳遞給下一代,因?yàn)樯a(chǎn)在后代生長和父母對配子和營養(yǎng)的投資之間進(jìn)行分配,。在一個(gè)處于穩(wěn)定狀態(tài)的普通個(gè)體的一生中,,同化過程中從環(huán)境中吸收的能量作為新陳代謝以死亡和熱量的形式返回到環(huán)境中。

通過認(rèn)識(shí)到生物質(zhì)的能量密度在所有生物中幾乎是恒定的,,這個(gè)關(guān)系可以簡化為:Q ≈ 22.4kJ/g干重,。因此,公式1可以根據(jù)質(zhì)量平衡重寫

E/Q = 1 = PcohGF                                                    (2)

其中E/Q是適合度,,單位為克/克/代,。

這種基于能量和質(zhì)量平衡的適合度生物物理特征(圖1和公式1和2)適用于所有生物組織水平,從種群內(nèi)的等位基因,、數(shù)量性狀和個(gè)體,,到生物圈群落和生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)的物種。大多數(shù)傳統(tǒng)的適合度處理方法側(cè)重于種群水平,,在種群水平上,,等位基因、數(shù)量可遺傳性狀或個(gè)體之間的差異會(huì)導(dǎo)致不同的生存和繁殖(框1),。這種變異是自然選擇進(jìn)化的基礎(chǔ),。適合度高于平均水平的個(gè)體存活和繁殖的概率更高,在未來的種群中會(huì)留下更多的后代,,因此具有這些優(yōu)勢的可遺傳性狀的頻率增加,。這與能量適合度是一致的;任何不同的生存(世代時(shí)間)或繁殖(生產(chǎn)率)必然反映在能量適合度的變化中,。當(dāng)自然選擇發(fā)揮作用時(shí),,即當(dāng)一個(gè)基因、性狀或個(gè)體的適合度高于平均水平時(shí),,能量適合度大于1,,并在下一代增加,。以能量或質(zhì)量為單位表達(dá)適合度,而不是等位基因,、可遺傳性狀或個(gè)體,,并將傳統(tǒng)生物通用語與其生物物理基礎(chǔ)聯(lián)系起來,這與我們對種群水平上的適合度,、自然選擇和進(jìn)化的認(rèn)識(shí)是一致的,。然而,它在群落,、生態(tài)系統(tǒng)和生物圈層面的生態(tài)學(xué)和進(jìn)化方面帶來了新的見解和觀點(diǎn),。

等適合度范式(EFP)

對生態(tài)學(xué)和進(jìn)化的生物物理基礎(chǔ)的更深入研究來自于援引種群穩(wěn)定狀態(tài)的假設(shè),這將能量適合度的概念從等適合度范式(EFP)擴(kuò)展到生物組織的多個(gè)層次,。穩(wěn)態(tài)假設(shè)非常關(guān)鍵,,并且是現(xiàn)實(shí)存在的。在穩(wěn)定狀態(tài)下,,父母每一代都用相同的能量,、質(zhì)量和后代數(shù)量來代替自己,因此出生率與死亡率相等,,種群不會(huì)增加或減少,,物種共存,生物多樣性得以維持,。公式1和2表明物種具有相同的能量適合度,,因?yàn)樵诜€(wěn)定狀態(tài)下,父母每代將22.4kJ/g的能量或1g/g的生物量傳遞給存活的后代,。

在某些方面,EFP讓人想起種群遺傳學(xué)中的Hardy--Weinburg平衡定律,。HWE還提出了穩(wěn)定狀態(tài)的關(guān)鍵假設(shè),,以證明一個(gè)種群中的基因和基因型的頻率不會(huì)隨著時(shí)間的推移而固有地改變。當(dāng)HWE第一次被提出時(shí),,許多遺傳學(xué)家似乎認(rèn)為顯性基因的頻率會(huì)隨著世代的推移而增加,,這似乎與他們的直覺相悖。HWE也是重言式的,,因?yàn)樗?guī)定基因的頻率在穩(wěn)定狀態(tài)下不會(huì)改變,。然而,HWE不僅僅是一種重言式,。它在種群遺傳學(xué)和進(jìn)化中起著開創(chuàng)性的作用,,因?yàn)樗峁┝肆炕N群中基因和基因型頻率的理論基礎(chǔ),并在穩(wěn)態(tài)假設(shè)不成立的情況下預(yù)測這些頻率因自然選擇,、遺傳漂變和擴(kuò)散而發(fā)生的變化,。

對于生物學(xué)家來說,,EFP也可能看起來是重言式的、反直覺的或兩者兼而有之,,他們傳統(tǒng)上將適合度與生存和繁殖的變異聯(lián)系在一起,。事實(shí)上,從微生物到哺乳動(dòng)物,,不同物種的適合度成分(如世代時(shí)間和繁殖力)存在著許多數(shù)量級(jí)的差異,。能量適合度在不同物種之間是恒定的,因?yàn)樵谏a(chǎn)率Pcoh和世代時(shí)間G之間存在權(quán)衡,,因此在穩(wěn)定狀態(tài)的每一代中,,雙親平均用含有等量生物量和22.4 kJ/g能量的后代取代自己。PcohGF的乘積是恒定的,,盡管這三個(gè)變量在不同物種之間存在著許多數(shù)量級(jí)的差異,。生活史策略中千差萬別的模式反映了能量分配途徑之間的普遍權(quán)衡。

這種變化很大程度上與體型大小和溫度有關(guān),。生態(tài)學(xué)的標(biāo)準(zhǔn)代謝理論預(yù)測了Pcoh和G的比例:

Pcoh = P0mAe-Ea/kt                                                                              (3)

G = G0mAαe Ea/kt                                                                                (4)

其中Pcoh是群體生物量生產(chǎn)的質(zhì)量比率,,單位為克/克/年,P0是歸一化系數(shù),,G是以年為單位的世代時(shí)間,,mA是成體體重,α是質(zhì)量比例指數(shù),,e是自然對數(shù)的根,,Ea是表示溫度依賴性的“活化能”,k是玻耳茲曼常數(shù),,t是以開爾文為單位的溫度,。這些比例關(guān)系既適用于物種內(nèi)的個(gè)體發(fā)育,也適用于物種間的個(gè)體發(fā)育,。標(biāo)準(zhǔn)代謝理論預(yù)測α= 1/4,,Ea ≈ 為0.65 eV,相當(dāng)于Q10約為2.5,。

生產(chǎn)率和世代時(shí)間與體重的這些相等但相反的比例在經(jīng)驗(yàn)上得到了很好的支持(圖2),。它們的指數(shù)值,稱為'生長率’和'壽命’,,分別為?0.26和0.24,,與我們所說的'生產(chǎn)率’和'世代時(shí)間’的?1/4和1/4的預(yù)測值非常相似。因此,,它們的'壽命增長’或我們的'能量適合度’的乘積幾乎是恒定的,,約等于0,與體型大?。ㄒ约皽囟龋捍颂幬达@示)無關(guān),。

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圖2. 來自Hatton等人(2019)的數(shù)據(jù),,顯示了在對數(shù)軸上繪制的四個(gè)主要分類/功能類群的個(gè)體生產(chǎn)率、世代時(shí)間和個(gè)體終身生產(chǎn)量作為體重的函數(shù)的比例,。注意擬合指數(shù)和預(yù)測值之間的緊密一致性:分別為?0.26 vs. ?0.25,、0.24 vs. 0.25和0.01 vs. 0.00。注意灰點(diǎn)是細(xì)菌,。

然而,,有相當(dāng)大的變異。這在一定程度上是由于缺乏標(biāo)準(zhǔn)化和測量誤差,。測試EFP(公式1)需要一致的參數(shù)定義和標(biāo)準(zhǔn)化(框2),。然而,即使?jié)M足標(biāo)準(zhǔn)化和假設(shè),,在EFP的四個(gè)參數(shù)中仍然存在生物學(xué)上相關(guān)的變異,。公式(1)提供了一個(gè)定量的框架來解釋這種變異。首先,,由于生命的多樣性,,E和Q的相對恒定性是驚人的。其次,,傳統(tǒng)的新陳代謝比例理論預(yù)測了Pcoh和G隨體型和溫度的大部分變異,。不同類群和功能團(tuán)之間的變異通常會(huì)抵消,從而產(chǎn)生相對不變的標(biāo)度指數(shù)和歸一化常數(shù),。第三,,Q和F有額外的系統(tǒng)變異,這不是體型大小和溫度所能解釋的,。其中一些顯然是由于生殖力和親代撫育的變異(見下文),。第四,種群內(nèi)可遺傳性狀的變異受到自然選擇和生態(tài)位進(jìn)化的影響,。當(dāng)穩(wěn)態(tài)假設(shè)不成立時(shí),,它會(huì)導(dǎo)致時(shí)間和空間的變異。在總結(jié)了生活史的代謝理論之后,,我們在以下幾節(jié)中進(jìn)行了詳細(xì)的闡述。

框2. 代謝變量的定義和標(biāo)準(zhǔn)化

能量平衡和生命表部分強(qiáng)調(diào)了謹(jǐn)慎定義和測量相關(guān)變量的重要性,。在過去對生物標(biāo)度,、代謝生態(tài)學(xué)的研究中,以及在編制用于實(shí)證分析的電子數(shù)據(jù)庫時(shí),,往往沒有做到這一點(diǎn),。這會(huì)導(dǎo)致系統(tǒng)偏差和隨機(jī)誤差。相關(guān)問題包括:

同化

我們將同化率定義為從環(huán)境中吸收能量或物質(zhì)的速率:即從腸道或整個(gè)體表吸收,。在復(fù)雜的后生動(dòng)物中,,同化是食物的攝入量減去糞便的排泄,,這是一個(gè)重要的闡釋,因?yàn)橥ǔ1徽J(rèn)為是總食物消耗量的某個(gè)恒定部分,。

呼吸

如果沒有嚴(yán)格定義和仔細(xì)測量,,報(bào)告呼吸速率的變異可能反映非受控因素的影響,包括生物質(zhì)的生化組成,、氧化途徑(例如有氧代謝和無氧代謝),、活動(dòng)水平(例如基礎(chǔ)、靜息,、最大或田間代謝率)以及其它狀態(tài)(例如體溫調(diào)節(jié),、脅迫或繁殖)。例如,,體力活動(dòng)期間的最大呼吸頻率(最大耗氧量)可能會(huì)有幾倍的差異,,這既取決于物種間“運(yùn)動(dòng)能力”的不同(例如,久坐不動(dòng)的樹懶與競技蜘蛛猴),,也取決于個(gè)體內(nèi)部的活動(dòng)強(qiáng)度和持續(xù)時(shí)間(例如,,100米短跑與100公里超級(jí)馬拉松)。報(bào)告的最大呼吸速率和田間呼吸速率通常被簡單地假設(shè)為基礎(chǔ)呼吸速率或靜息呼吸速率的某個(gè)恒定倍數(shù),。

生產(chǎn)

文獻(xiàn)和電子數(shù)據(jù)庫中報(bào)告的'生產(chǎn)率’經(jīng)常被不一致地衡量,,即要么是增長,要么是親代投資,,而不是兩者兼而有之,。

壽命和世代

在文獻(xiàn)和比較數(shù)據(jù)庫中經(jīng)常報(bào)告特定類群的幾種不同的生活史世代:平均(通常沒有嚴(yán)格定義)、總共(從出生到死亡),、繁殖(從第一次繁殖到最后繁殖),,并反映野生動(dòng)物和圈養(yǎng)動(dòng)物從出生到死亡的最大壽命。它們之間不能直接比較,,也不能直接比較世代時(shí)間,,因此不加區(qū)別地使用它們可能會(huì)導(dǎo)致混淆和嚴(yán)重的錯(cuò)誤。例如,,人們經(jīng)常假設(shè)世代時(shí)間是壽命的倒數(shù)(G = 1/tlife),,但只有當(dāng)tlife是從出生到更替繁殖的平均時(shí)間時(shí)才是正確的,這需要生命表才能準(zhǔn)確確定,。


新陳代謝和生活史


能量適合度的理念融合了物理學(xué),、生物學(xué)、新陳代謝和生活史,。它闡述了個(gè)體生物的能量表現(xiàn)如何影響其對后代的貢獻(xiàn),,與其它物種和非生物環(huán)境的相互作用,以及共同進(jìn)化動(dòng)力學(xué)。生活史是指生物一生中生存和繁殖的時(shí)間表,;它決定了基因,、性狀和個(gè)體對下一代適應(yīng)性的貢獻(xiàn),服從于能量和質(zhì)量平衡的物理定律,,以及種群統(tǒng)計(jì)學(xué)和動(dòng)力學(xué)的生物定律,。


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個(gè)體的能量平衡

所有有機(jī)體都遵守能量和質(zhì)量守恒的物理定律。圖1描繪了單個(gè)動(dòng)物在吸收,、轉(zhuǎn)化和消耗代謝能量方面的能量平衡,。

同化

食物的消耗和同化促進(jìn)了動(dòng)物的新陳代謝。正如玻爾茲曼所指出的(見上文),,生物體所使用的能量來自太陽,,并通過植物的光合作用固定在有機(jī)分子中。動(dòng)物通過消耗和同化植物或其它動(dòng)物體內(nèi)的食物,,從環(huán)境中吸收生物質(zhì)能,。同化作用獲得的能量在體內(nèi)被加工和轉(zhuǎn)化,并分配給呼吸作用和生產(chǎn),。

呼吸

同化獲得的大部分能量用于呼吸作用,。食物中的有機(jī)分子被氧化代謝分解,產(chǎn)生二氧化碳,、水和熱量,,然后被釋放到環(huán)境中??捎媚芰繒簳r(shí)被存儲(chǔ)在ATP中,,隨后用于機(jī)體工作:維持、生產(chǎn)和活動(dòng),。呼吸就是Kleiber(1932)及其后的生理學(xué)家所說的“新陳代謝”或“新陳代謝率”,。動(dòng)物生理學(xué)家經(jīng)常在實(shí)驗(yàn)室中使用標(biāo)準(zhǔn)化條件來測量不同水平的代謝:(1)基礎(chǔ)代謝率或靜息代謝率(BMR或RMR),在適宜溫度下不活動(dòng),、禁食個(gè)體的呼吸率(生長中的動(dòng)物和從事溫度調(diào)節(jié),、運(yùn)動(dòng)、攝食,、領(lǐng)土防御,、求偶、繁殖和對病原體免疫反應(yīng)動(dòng)物的呼吸率較高),;(2)最大代謝率(VO2max),,活動(dòng)或應(yīng)激時(shí)呼吸速率增加;(3)野外代謝率(FMR),,即自然界中自由生活動(dòng)物的平均呼吸率。所有呼吸代謝水平相互關(guān)聯(lián)。它們的歸一化系數(shù)可能不同,,但是與體重的比例相似:生物整體代謝速率符合~ m3/4,,質(zhì)量比代謝率服從~ m1/4。這些呼吸測量不包括用于生長和繁殖的攝取和消耗,,它們不代表個(gè)體在其生命周期內(nèi)的能量平衡,。

生產(chǎn)

生命周期所獲得的生物量中,一部分生物量不會(huì)被呼吸作用分解,,而是作為“凈新生物量”暫時(shí)儲(chǔ)存在體內(nèi),。這些大分子可能會(huì)被代謝生物化學(xué)所改變,但大部分能量被完整傳遞,,并用于體細(xì)胞生長和親本繁殖,。

如圖1所示,動(dòng)物一生的質(zhì)能平衡需要輸入等于輸出,,所以:(1)同化(Aind)從食物攝?。坏扔冢?)呼吸(Rind),,用于ATP的合成和消耗,,加上(3)生產(chǎn)(Wind),用于生長和繁殖:

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生產(chǎn)由兩部分組成:Hind,,個(gè)體生長時(shí)體內(nèi)積累的生物量,;Iind,以配子和受精后的營養(yǎng)進(jìn)行繁殖所消耗的生物量(如哺乳動(dòng)物的懷孕,、哺乳和喂養(yǎng)),。

種群統(tǒng)計(jì)和生命表。

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生命表

所有生命都是生而赴死的,。生命之所以持續(xù),,是因?yàn)楹蟠歉改傅难永m(xù)。生活史是一個(gè)世代整個(gè)生命周期內(nèi)生存,、生長和繁殖的時(shí)間表(圖3),。動(dòng)物生活史表現(xiàn)出驚人的多樣性,包括有性生殖和無性生殖,,單次繁殖和多次繁殖,,確定和不確定增長,親代和子代體型大小,、繁殖力和世代時(shí)間的數(shù)量級(jí)變化,。然而,盡管存在這種差異,,種群統(tǒng)計(jì)學(xué)的生物學(xué)規(guī)律表明,,在有性繁殖的物種中,,雙親在其一生中用兩個(gè)后代取代自己;即使出生后代數(shù)量從幾個(gè)到幾十億不等,,最終只有兩個(gè)能夠存活,,繁殖并完成整個(gè)生命周期。

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圖3. 各種動(dòng)物的生活史時(shí)間表,,顯示了發(fā)生時(shí)間(由↑給出?出生率和?死亡率之間的實(shí)線)與其它事件的時(shí)間之間的關(guān)系,。

凈生殖率

生命表中,該表根據(jù)年齡x的函數(shù)來量化生存率lx和繁殖力fx,。凈增值率R0=∑lxfx,。在穩(wěn)定狀態(tài)下,適合度是中性的,,種群不會(huì)增長,,因?yàn)槌錾实扔谒劳雎蔙0 = 1。


雌性的繁殖力是:

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N幸存后的數(shù)量,,N0隨著年齡的增長而減少,。已經(jīng)發(fā)表的動(dòng)物物種生命表有數(shù)百種,它們有著不同的生活史,。

新陳代謝生命表

完整地計(jì)算整個(gè)生命周期能量或質(zhì)量的分配,,需要額外的個(gè)體生長數(shù)據(jù):即x歲個(gè)體的體重或能量含量。這樣才就有可能構(gòu)建一個(gè)新陳代謝生命表(MLT),。然而,,只有少數(shù)充分研究的物種才能獲得構(gòu)建MLT所需的完整數(shù)據(jù)。此外,,由于缺乏標(biāo)準(zhǔn)化(方框2)和穩(wěn)態(tài)假設(shè),,此類信息在大型比較數(shù)據(jù)庫如FishBase、AMNIOTE,、COMADRE或DEB中不可用,。本文提供了八種不同生活史動(dòng)物的能量學(xué)和種群統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。值得注意的是,,盡管基本參數(shù)變化很大,,但在穩(wěn)定狀態(tài)下,它們都遵守能量-質(zhì)量守恒和種群統(tǒng)計(jì)學(xué)規(guī)律,,并且具有相等的適應(yīng)度,,E = 22.4 kJ / g /世代。


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生物質(zhì)能密度


EFP及其等式1和2引起人們對Q(生物質(zhì)能密度)的重要關(guān)注,。Q是生物學(xué)常數(shù):≈22.4 kJ / g干重(7kJ/g 濕重),。Q在微生物到哺乳動(dòng)物和樹木等20個(gè)數(shù)量級(jí)的生物體中變化不到2倍。Q值由生物化學(xué)確定,,因?yàn)樯锪坑上嗨票壤奶妓衔?,蛋白質(zhì)和脂質(zhì)組成,。早在50多年前,人們就認(rèn)識(shí)到了這一點(diǎn),,但在代謝生態(tài)學(xué)領(lǐng)域一直未得到重視,。它是生命在分子水平上的另一特征,并且對從生理學(xué)到生態(tài)系統(tǒng)生態(tài)學(xué)的生物能學(xué)有深遠(yuǎn)的影響,。重要的是,Q的恒定性允許EFP和壽命歷史參數(shù)可以用質(zhì)量單位表示,,與能量單位相比,,在質(zhì)量上更容易測量和也更容易獲得。


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群體生產(chǎn)


EFP明確表達(dá)為非增長種群或穩(wěn)定母本產(chǎn)生的后代群體的質(zhì)量-能量和種群平衡:

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AcohRcoh是雌性母本產(chǎn)生的所有后代的總同化作用和呼吸作用,,Wcoh是雙方母本生產(chǎn)的整個(gè)后代群體的生物量,。所以Wcoh是所有后代死亡時(shí)的體重總和,包括代替母本雙方的兩個(gè)

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Nd是表示x歲時(shí)死去的后代數(shù)量,,md表示這些后代死時(shí)的質(zhì)量,。注意,EFP的特定質(zhì)量群體生物量生產(chǎn),,(等式2和6)與(等式5)不同,,被稱為“個(gè)體生產(chǎn)”、“最大生產(chǎn)”,、“增長”或簡單的 “生產(chǎn)”,。這些測量不包括在成熟和繁殖之前就死亡的后代,在其生長中歸因于母本的產(chǎn)量,。


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生產(chǎn)效率


生活史的處理中很少考慮等式1和等式2中的F,。

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是一代中產(chǎn)生的部分生物質(zhì)能,該生物質(zhì)能在下一代的存活后代中得以整合,,因此它是繁殖效率的一個(gè)衡量標(biāo)準(zhǔn),。在圖3和圖4中的八個(gè)物種中,F(xiàn)值的變化超過了一個(gè)數(shù)量級(jí):從鱈魚和橈足類的0.013到0.032,,到黑猩猩和棕色蝙蝠的0.30到0.35,。(注意,F(xiàn)與生態(tài)系統(tǒng)中物種的營養(yǎng)效率并不相同,,是能量平衡的另一個(gè)結(jié)果,。)

與生態(tài)學(xué)尤其相關(guān)的是互補(bǔ)部分(1-F),即每一代種群產(chǎn)生的生物量中因生殖前死亡從而留在生態(tài)系統(tǒng)中,,被其它有機(jī)體(捕食者和分解者)消耗而損失的部分,。F和(1-F)的變化與后代的數(shù)量和相對大小密切相關(guān)。例如哺乳動(dòng)物,,它們有大量的親代照顧,,并產(chǎn)生一些相對較大的后代,,將種群產(chǎn)的一半以上傳給下一代;它們比魚和無脊椎動(dòng)物更有活力,,而魚和無脊椎動(dòng)物能產(chǎn)生大量的小后代,,但在生態(tài)系統(tǒng)中,由于繁殖前的死亡率,,它們失去了超過90%(有時(shí)超過99%)的種群產(chǎn)量,。

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圖4. 基于可獲取的數(shù)據(jù)展示了八種動(dòng)物的代謝生活史,代表了分類群,、體型和生活方式的多樣性,。


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發(fā)展為更完整的理論


生活史的代謝理論仍在發(fā)展中。最近的進(jìn)展突出了基于和物理學(xué),、生物學(xué)的基本原理進(jìn)行合成的前景,。如圖3和圖4所示,動(dòng)物在生活史上表現(xiàn)出廣泛的變化,。EFP提供了對這種變化的原因,、后果以及尺度和程度的深刻見解。Burger等人展示了基本生活史的權(quán)衡——在世代時(shí)間和生產(chǎn)率,、后代生長和母本投資,、后代數(shù)量和大小之間的權(quán)衡——是由于物質(zhì)能量平衡和種群統(tǒng)計(jì)學(xué)的基本限制。

其它重要的模式和過程還有待探索,。例如,,在出生率和死亡率之間必然存在一種聯(lián)系,更普遍地,,在代謝生態(tài)學(xué)變量與種群統(tǒng)計(jì)學(xué)和種群動(dòng)態(tài)學(xué)變量之間必然存在機(jī)械聯(lián)系,。進(jìn)展的取得需要理論和經(jīng)驗(yàn)上的進(jìn)步:關(guān)鍵過程的新模型和處理上述準(zhǔn)確性和標(biāo)準(zhǔn)化問題的新數(shù)據(jù)匯編(框1和2)。


生物時(shí)和kleiber定律的一般解釋


EFP提出了關(guān)于生物時(shí)間本質(zhì)的問題,。生物速率和時(shí)間與身體質(zhì)量比相等但相反,,分別為m-1/4和m1/4。這意味著速率和時(shí)間的乘積是一個(gè)不變的量,。一個(gè)經(jīng)典的例子是心率的乘積,,它給出了從老鼠到大象等哺乳動(dòng)物一生的心跳次數(shù),與體重?zé)o關(guān),,心跳次數(shù)幾乎是恒定的:大約20億次,。同樣,EFP給出的能量適應(yīng)度E ≈ 22.4 kJ/g/generation,,是生產(chǎn)率乘以生成時(shí)間G(等式1和2)的不變結(jié)果,。生成時(shí)間作為適應(yīng)度的重要組成部分,它與身體大小和溫度的比例相等但相反(等式 1-4)表明,,它是生命的普遍特征,,也是Kleiber定律的另一種解釋:代謝率比是身體質(zhì)量的3/4次方,。

自從Kleiber(1932)的開創(chuàng)性研究以來,科學(xué)家們一直試圖解釋為什么代謝過程是以質(zhì)量或體積的四分之一次方來衡量的,,而不是以歐幾里德幾何學(xué)為基礎(chǔ)的三次方,。我們建議生物速率以質(zhì)量的四分之一次方來衡量,是因?yàn)闀r(shí)間是第四維度,。這在理論物理學(xué)中已經(jīng)很好地確立了,,但還沒有普遍地?cái)U(kuò)展到生物學(xué)中。我們觀察生命基本上是從四維開始的,。三是歐幾里德幾何的標(biāo)準(zhǔn)維數(shù),;生物體的靜態(tài)特征以人體體積的三次方為尺度:(1)長度(例如四肢、內(nèi)臟和神經(jīng))以L∝ V1/3為尺度,;(2)表面積(例如皮膚、肺,、腮,、腸和葉)A ∝  V2/3縮放;體積或質(zhì)量(例如細(xì)胞器和器官)的標(biāo)度為m ∝  V31/3∝V,。時(shí)間作為第四維度,,是捕獲動(dòng)力學(xué)所必需的,生物過程的特征時(shí)間以t∝m1/4 表示,。實(shí)際觀測證據(jù)表明,,生物時(shí)間——跨越多個(gè)數(shù)量級(jí),從分子和細(xì)胞水平上生化反應(yīng)和肌肉收縮的毫秒數(shù),,到生態(tài)系統(tǒng)水平上生物的壽命和種群周期——尺度相當(dāng)于體重的1/4次方(圖5),。

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圖5. 生物時(shí)的標(biāo)度為生物質(zhì)量的1/4次方,數(shù)據(jù)來自Lindstedt & Calder (1981),。

我們認(rèn)為,,作為生命存在的特征之一,適應(yīng)度基本上是四維的,,而第四維反映了生物時(shí)間的尺度變化,。這引出了我們的假設(shè),,即Kleiber定律,,呼吸速率的m3/4標(biāo)度,是壽命或世代時(shí)間m1/4標(biāo)度的結(jié)果而不是原因,。

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對于質(zhì)量比生產(chǎn)率,,α= 1/4。其它代謝率(同化率,、靜息呼吸率和主動(dòng)呼吸率)以相似指數(shù)(但歸一化系數(shù)不同)衡量,,整個(gè)機(jī)體的代謝率以α = 3/4衡量,,如Kleiber定律。這表明著一克組織在一生中所消耗的能量是不變的,,與生物體的大小無關(guān),。

我們的假設(shè)Kleiber的代謝率的m3/4標(biāo)度廣泛地反映了生物時(shí)間的m1/4標(biāo)度,特別是世代時(shí)間,,這一假設(shè)比現(xiàn)有基于血管和其它提供代謝產(chǎn)物并清除廢物的模型具有更廣泛的適用性,。呼吸率與體重的3/4次方比例在整個(gè)動(dòng)物界普遍存在,出現(xiàn)在不同的分類和功能群中,,它們在同化,、運(yùn)輸和排泄呼吸代謝的基質(zhì)和廢物方面有著明顯不同的解剖學(xué)和生理學(xué)結(jié)構(gòu)。包括陸地,、淡水和海洋物種的內(nèi)臟,、肺、鰓,、動(dòng)脈,、靜脈、氣管,、腎臟和馬氏管,。因此,我們的解釋包含了大多數(shù)現(xiàn)有的網(wǎng)絡(luò)模型,,認(rèn)為它們都是促進(jìn)新陳代謝這一普遍問題的解決方案:由于時(shí)間尺度為m1/4,,整個(gè)有機(jī)體的生產(chǎn)率和其它生產(chǎn)率必然以四分之一次方來衡量。這導(dǎo)致了關(guān)于動(dòng)物形態(tài)和功能的一般理論:(1)體重從毫克到噸,,(2)溫度從0到60°C,;(3)從毫秒到世紀(jì)的時(shí)間,以及(4)從分子和細(xì)胞到種群和生態(tài)系統(tǒng)的組織水平,。


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框3. 尺度關(guān)系

幾個(gè)世紀(jì)以來,,自然科學(xué)家一直對動(dòng)物形態(tài)和功能的變化感興趣。隨著更現(xiàn)代的測量和分析方法的出現(xiàn),,先驅(qū)們深入研究了這些關(guān)系,,表明相對簡單的方程可以描述解剖、生理,、行為和生態(tài)特征等如何隨著身體大小和溫度的變化而變化,。在本文中,我們遵循了方程3和方程4中使用的標(biāo)準(zhǔn)代謝理論,。我們認(rèn)識(shí)到,,在生物標(biāo)度的整個(gè)歷史中,一直有以下爭論:(1)指數(shù)和歸一化系數(shù)的理論預(yù)測值或經(jīng)驗(yàn)估計(jì)值,以及(2)剩余變異的大小和來源,。

標(biāo)度指數(shù)

關(guān)于等式3和4中,,α = 1/4還是1/3,有一個(gè)長期的爭論,。自Kleiber’s以來,,大多數(shù)研究者偏愛四分之一,盡管其機(jī)理基礎(chǔ)仍然不清楚,。但是一些人主張幾何三次方,,部分是因?yàn)闊崃繌纳眢w表面散發(fā),其比例為m2/3,。對于簡單的玻爾茲曼指數(shù)項(xiàng)是否足以描述溫度相關(guān)性,,是否應(yīng)該使用一些更復(fù)雜的表達(dá)式,也存在一定的爭議,。

歸一化系數(shù)

通常,,歸一化系數(shù)存在統(tǒng)計(jì)上的顯著變化:例如等式3和等式4中的P0和G0值。有時(shí)是由于缺乏標(biāo)準(zhǔn)化的定義或測量,。例如,,未能將活動(dòng)水平標(biāo)準(zhǔn)化(例如跑步或游泳的時(shí)間和速度)可能導(dǎo)致對明顯差異的誤解。有時(shí),,正態(tài)化系數(shù)的變化是個(gè)體間或物種間代謝表現(xiàn)的“真實(shí)”差異。

誤差

由于數(shù)據(jù)不可比較,,未能嚴(yán)格定義術(shù)語和標(biāo)準(zhǔn)化測量結(jié)果會(huì)導(dǎo)致誤差變化,。這種變化可能會(huì)增加“無法解釋的”變化的幅度,或引入系統(tǒng)偏差,。大型數(shù)據(jù)庫和信息學(xué)的頻繁使用為宏觀生態(tài)學(xué)和其它生物學(xué)領(lǐng)域做出了巨大貢獻(xiàn),。但是,無論是基于歸納模式還是基于假設(shè)的正式演繹檢驗(yàn),,都需要仔細(xì)的標(biāo)準(zhǔn)化和準(zhǔn)確的測量,。

統(tǒng)計(jì)分析

硬件、軟件和“大數(shù)據(jù)”方面的進(jìn)步伴隨著統(tǒng)計(jì)方法的爆炸式增長,,這些方法可以描述變化的幅度和來源,,并區(qū)分不同的模型和假設(shè)。但是統(tǒng)計(jì)學(xué)作為數(shù)學(xué)的一個(gè)分支學(xué)科,,它在其它科學(xué)中的應(yīng)用也在不斷變化,。沒有單一的“正確”方法或“正確”答案,最好的選擇可能會(huì)在幾年后改變,。我們需要不斷的提出新問題,,并期待更好但不是最好的答案。本文綜合的EFP提供了一個(gè)統(tǒng)一的框架來指導(dǎo)這些問題。

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EFP和紅皇后效應(yīng)

從當(dāng)?shù)胤N群和群落到全球生物圈,,所有尺度上的生態(tài)群落的物種多樣性都是等適合度范式的必然結(jié)果:等適合度是共存和持久的必要條件,。然而,在物種種群內(nèi),,個(gè)體在能量適合度E和決定eq 1參數(shù)值的遺傳性狀上存在差異,。參數(shù)Q ≈ 22.4 kJ/g是一個(gè)例外,它幾乎是恒定的,,因此,,幾乎沒有可遺傳的變異來影響選擇作用。然而,,其它參數(shù)存在數(shù)量級(jí)的變化:生長和繁殖(生產(chǎn)率,,Pcoh)、生存(世代時(shí)間,,G)和生產(chǎn)效率(F,,從父母到后代的生產(chǎn)比例)。為什么自然選擇沒有通過作用于這種變異并導(dǎo)致這些組成參數(shù)的增加來增加能量適合度E呢?

至少有三個(gè)相互關(guān)聯(lián)的原因,。首先是基因變異的枯竭,。對任何性狀的持續(xù)選擇導(dǎo)致遺傳變異減少,適合度的變化逐漸變慢,。其次是生態(tài)補(bǔ)償,。如果繁殖率、Pcoh,、存活率,、G或繁殖效率、F存在可遺傳變異,,自然選擇會(huì)偏愛具有較高價(jià)值的個(gè)體和性狀,,它們在種群中增加,種群數(shù)量就會(huì)增長,。但這種動(dòng)態(tài)將是短暫的,。最終,種群增長會(huì)受到某些環(huán)境因素(承載力)的限制,,失去最初的優(yōu)勢,,不會(huì)再有進(jìn)一步的增長。能量適合度及其組成特征不會(huì)無限增加的第三個(gè)原因是紅皇后的相互作用和共同進(jìn)化,。Boltzmann指出,,光合作用產(chǎn)生的生物質(zhì)能是生物的終極極限資源。范·瓦倫將物種在生態(tài)組合中的生態(tài)和進(jìn)化動(dòng)態(tài)描述為一場爭奪能源的“零和博弈”,。他創(chuàng)造了“紅皇后”這個(gè)詞,,以劉易斯·卡羅爾的《愛麗絲鏡中奇景》中的角色命名,這個(gè)角色說過一句名言:“你得竭盡全力才能保持原地不動(dòng)?!?/p>

紅皇后零和博弈的簡化描述如圖6所示,。可用生物質(zhì)能的總供應(yīng)量由生態(tài)系統(tǒng)的凈初級(jí)生產(chǎn)量確定(Hutchinson, 1959年),。每一個(gè)物種都有服從馬爾薩斯-達(dá)爾文的動(dòng)態(tài)條件下不斷的選擇,,以增加其份額。每個(gè)物種所使用的能量是由其固有的生物學(xué)特性和當(dāng)?shù)氐沫h(huán)境條件共同決定的,。它們共同定義了獨(dú)特的生態(tài)位,。選擇導(dǎo)致性狀的分化,如體型,、食物需求,、領(lǐng)土和反捕食行為等,以及生態(tài)位沿環(huán)境變化軸的擴(kuò)散,,如溫度,、營養(yǎng)、物理結(jié)構(gòu),、捕食風(fēng)險(xiǎn)等,。此外,隨著任何物種數(shù)量的增加,,它的生物量成為對消費(fèi)者更有吸引力的資源,,如捕食者、寄生蟲和病原體,。生態(tài)相互作用和物種共同進(jìn)化的共同結(jié)果是生態(tài)系統(tǒng)中產(chǎn)生的所有生物質(zhì)能都趨向于被利用,。在精確的時(shí)間和空間尺度上,當(dāng)每個(gè)物種在零和博弈中競爭時(shí),,生態(tài)位和多度都在不斷變化。然而,,在更大的尺度上,,有一個(gè)近似的穩(wěn)定狀態(tài),一些物種的增加與另一些物種的減少相平衡,,生物多樣性得以維持,。在穩(wěn)定狀態(tài)下,所有物種的適合度幾乎相等:每個(gè)物種都接近于其承載能力,,而且沒有一個(gè)物種在空間和時(shí)間上表現(xiàn)出暫時(shí)的優(yōu)勢,。

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圖6. 物種不同但適合度相同的情形。

在這個(gè)穩(wěn)定狀態(tài)下,,每個(gè)物種的能量適合度非常接近EFP的標(biāo)準(zhǔn)22.4 kJ/g/代 (eq 1),。該值是由新陳代謝和生命史的生物物理定律設(shè)定的。在生理和行為上的權(quán)衡,限制了任何給定物種可以獲得的NPP的份額,,并通過物種間的紅皇后零和交互作用得到強(qiáng)化,。綜上所述,在較小的尺度下,,穩(wěn)態(tài)隱藏了復(fù)雜的非平衡動(dòng)態(tài),,各組分物種的多度波動(dòng)較大,其性狀也在響應(yīng)非生物環(huán)境和生物相互作用的適應(yīng)性進(jìn)化,。當(dāng)環(huán)境發(fā)生變化,,有新的資源可用時(shí),本地物種會(huì)改變它們的生態(tài)位,,外來物種會(huì)入侵并利用它們,。一些物種能夠保持,但任何產(chǎn)量和多度的增加都是暫時(shí)的,,最終由生態(tài)補(bǔ)償和紅皇后在22.4 kJ/g/代 EFP的穩(wěn)定狀態(tài)下進(jìn)行抑制,。其它物種就沒那么成功了;它們在零和博弈中落后,,數(shù)量減少,,最終走向滅絕,除非通過環(huán)境變化或新的適應(yīng)來拯救它們,。

這些復(fù)雜的生態(tài)和進(jìn)化動(dòng)態(tài)的一個(gè)后果是共存物種多度,、分布和生態(tài)位的巨大變異。達(dá)爾文敏銳地觀察到:“繁殖力最強(qiáng)的物種,,或者可以稱之為優(yōu)勢物種——那些分布廣泛的物種,,在它們自己的地區(qū)中分布最廣,個(gè)體數(shù)量最多……”,。從那時(shí)起,,許多作者都探討過這種變化,不僅是在數(shù)量和分布上,,也會(huì)對生態(tài)系統(tǒng)的物理結(jié)構(gòu),、能量和養(yǎng)分流動(dòng)以及物種多樣性產(chǎn)生影響。這種生態(tài)關(guān)系上的不平等是EFP的另一個(gè)后果,。生態(tài)群落里充滿了幾乎等適合度的物種,,但它們的適合度只有在種群保持不變,且自然選擇不起作用時(shí)才完全相同,。在脫離穩(wěn)態(tài)時(shí),,外部環(huán)境或遺傳特征的微小變化會(huì)對適合度產(chǎn)生巨大影響,并引發(fā)群落的多度,、分布,、群落組成和生態(tài)過程的巨變,。這一解釋與充分記錄的群落對氣候變化和入侵物種的“個(gè)人主義”反應(yīng)相一致。

縱觀其歷史,,生物學(xué)一直專注于生物多樣性——描述生命階段和物種的獨(dú)特解剖,、生理、行為和生態(tài),,并根據(jù)結(jié)構(gòu),、功能和系統(tǒng)發(fā)育歷史的共同特征將它們組織成等級(jí)分類。這些研究總是包含了經(jīng)驗(yàn)主義者和理論家之間的一種健康的辯證關(guān)系,,經(jīng)驗(yàn)主義者專注于變化并努力量化和組織它,,而理論家則專注于重復(fù)的模式并試圖用生物物理定律和數(shù)學(xué)方程來“解釋”它們。

本綜述所提出的設(shè)想是基于目前尚未完成的能量理論框架,。我們感謝半個(gè)多世紀(jì)前奠定基礎(chǔ)的先驅(qū)們:Boltzmann(1886),,Thompson(1917), Lotka(1922)和Odum(1971),。最近,,其他人一直在做相關(guān)的工作;有些人直接或間接地對本文的研究做出了貢獻(xiàn),,有些人則提出了一定的挑戰(zhàn),。在此無法全部回顧或引用,但方框4中列出了一些共同的主題和尚未解決的分歧,。

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框4. 代謝生態(tài)學(xué)相關(guān)工作

尺度關(guān)系

正如上文所指出的,,人們早就認(rèn)識(shí)到,許多特征會(huì)隨著體型和體溫的變化而變化,。在20世紀(jì)80年代中期,,繼Kleiber(1932),Brody (1945),,Hemmingsen(1960)和其他人的開創(chuàng)性研究之后,,四本重要的書試圖綜合科學(xué)的結(jié)果。每本書都提出了一個(gè)獨(dú)特的觀點(diǎn),,但大家一致認(rèn)為,,代謝率和相關(guān)過程是體重的四分之一次方。但在缺乏普遍理論的情況下,,人們的興趣逐漸減退。當(dāng)West等人(1997)試圖從分布代謝資源的分形血管網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)和功能來解釋Kleiber的m3/4“代謝率”時(shí),,得到了一系列支持和關(guān)鍵的研究,。爭論點(diǎn)包括:(1)違反WBE模型的關(guān)鍵假設(shè)的血管網(wǎng)絡(luò);(2)擬合回歸方程參數(shù)的變化; (3)分析數(shù)據(jù)和評估假設(shè)的不同統(tǒng)計(jì)方法。許多研究,,以及相關(guān)的理論和經(jīng)驗(yàn)問題,。

在本文中,,我們通過提出整個(gè)四分之一次方尺度反映了世代時(shí)間適合度的重要性和非常普遍的生物時(shí)間m1=4尺度,從而規(guī)避了這些爭議性問題,。我們將這一見解主要?dú)w功于Linsdtedt和Calder 1981,。然而,像大多數(shù)科學(xué)思想一樣,,它也有其前任和后繼者,。

生命速率

EFP顯示了一些類似于“生命速率”或“生活節(jié)奏”理論。最近的版本認(rèn)為,,衰老是由能量代謝引起的:更高的代謝率導(dǎo)致壽命縮短,,因?yàn)檠趸粑a(chǎn)生自由基和其它副產(chǎn)品,導(dǎo)致分子和細(xì)胞損傷,,并促進(jìn)老化,、衰老和死亡。然而,,越來越清楚的是,,因果關(guān)系是相互交織的:新陳代謝確實(shí)影響壽命,但壽命也影響新陳代謝,,尤其是生殖,。形成和繁殖一個(gè)更大更復(fù)雜的生物體需要更長的時(shí)間,所以它必須比一個(gè)更小更簡單的生物體生長和抵抗衰老和外部死亡的時(shí)間更長,。

動(dòng)態(tài)能量收支

Kooijman及其合作者在動(dòng)態(tài)能量收支(DEB)方面的研究是一個(gè)長期的研究項(xiàng)目,,與生態(tài)學(xué)的代謝理論相同。DEB可能不是“迄今為止最全面的生命代謝理論”,,但它與MTE有很多共同之處,。它們都旨在闡明基于質(zhì)能平衡的生命基本規(guī)則、其它物理和化學(xué)定律,,以及生物學(xué)的首要原則和既定事實(shí),。兩者都提供了模型和數(shù)據(jù)的集成框架。但在內(nèi)容和應(yīng)用上存在差異,。DEB更多地基于新陳代謝的生化和生理細(xì)節(jié),,引用了一些不同的假設(shè),在其模型中包含了更多的參數(shù),,并更多地應(yīng)用于環(huán)境政策和管理的實(shí)際問題,。MTE更多地基于簡單的假設(shè)和參數(shù)較少的模型,更多地關(guān)注整個(gè)生物體的尺度關(guān)系和其它現(xiàn)象,,更多地?cái)U(kuò)展到生態(tài)系統(tǒng),、群落、地理和進(jìn)化尺度上的生態(tài)和進(jìn)化模式和過程,。然而,,我們并沒有看到DEB和MTE之間的任何內(nèi)在沖突,。替代假設(shè)和模型的相對優(yōu)點(diǎn)可以辯論和解決,并收集和匯編更多更好的數(shù)據(jù)來檢驗(yàn)和擴(kuò)展理論,。在很大程度上,,這兩種理論的優(yōu)劣是主觀的,而不是客觀的科學(xué)問題,。

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未來之路:測試和擴(kuò)展EFP

近幾十年來,,人們對生物尺度和代謝生態(tài)學(xué)的興趣激增。無論是Thompson,、Lotka和Kleiber的開創(chuàng)性研究,,還是最近的能量平衡和代謝標(biāo)度、DEB和MTE,,都取得了巨大的進(jìn)展,。這些廣泛的研究項(xiàng)目的共同主題是基于物理、化學(xué)和生物學(xué)的第一原理的理論,,以及基于整合,、分析和解釋更多更好的數(shù)據(jù)的經(jīng)驗(yàn)主義。一方面,,人們樂觀地認(rèn)為,,這些研究正在促成以生命為基礎(chǔ)的普遍規(guī)則的建立,將個(gè)體生物的生物學(xué)表現(xiàn)與其對生態(tài)系統(tǒng)生態(tài)和全球生物多樣性的影響聯(lián)系起來,。另一方面,,人們清醒地認(rèn)識(shí)到,將這一愿景變?yōu)楝F(xiàn)實(shí)還需要大量研究,。


我們不妄圖預(yù)測或規(guī)劃未來,。然而,可以就可采取的幾個(gè)具體步驟提供一些看法,。其中一些主要是理論性的,。進(jìn)展將在很大程度上依賴于擴(kuò)展現(xiàn)有框架來開發(fā)模型,并對迄今為止很少探索的現(xiàn)象做出預(yù)測,。進(jìn)步將在很大程度上取決于應(yīng)用新的和更好的數(shù)據(jù)來演繹的區(qū)分現(xiàn)有的選擇,,并歸納激發(fā)統(tǒng)一和新的選擇。

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生活史變異

如框4所示,,DEB和MTE都依賴于質(zhì)能平衡來闡明生命歷史的模式和過程,。然而,目前MTE和EFP的“大畫面”框架和DEB的更詳細(xì)模型之間似乎存在差距,。這兩個(gè)理論都還沒有發(fā)展和測試模型來解決這些相關(guān)現(xiàn)象的幾個(gè)重要方面,。

性的雙倍成本
   大多數(shù)動(dòng)物有性繁殖,所以雌性產(chǎn)生兩個(gè)后代來取代她自己和她的配偶的下一代,。其中一些動(dòng)物與孤雌物種有著密切的關(guān)系:它們沒有有性生殖,,后代由未受精的卵子發(fā)育而來,母本只產(chǎn)生一個(gè)雌性后代,,存活下來,,并在下一代中取代自己。由此產(chǎn)生的所謂的“性的雙倍成本”,,用物質(zhì)能量平衡表示,,意味著一個(gè)有性繁殖物種的一生產(chǎn)出,Pcohin eqns 1和2應(yīng)該是其它情況下相同的單性繁殖物種的兩倍,。但在穩(wěn)定狀態(tài)下,,兩者的適合度必須相等。解決這個(gè)難題的辦法是另一個(gè)生態(tài)補(bǔ)償?shù)睦?。新的孤雌植物的雙重優(yōu)勢只是暫時(shí)的,;其種群增長最終會(huì)受到環(huán)境限制因素和有性繁殖的其它適應(yīng)性優(yōu)勢的制約,由此產(chǎn)生的遺傳變異開始發(fā)揮作用,。EFP和有性生殖的普遍性意味著有性生殖的能量成本和健康效益是22.4 kJ/g/代,,這是產(chǎn)生存活雄性后代所需的“額外”能量。


親代撫養(yǎng)

DEB和MTE突出了通過應(yīng)用質(zhì)能平衡和生物物理dE=dt變量來分析生命史所獲得的見解,。大多數(shù)相關(guān)的適合度特征可以從種群統(tǒng)計(jì)學(xué)和種群生態(tài)學(xué)的dN=dt變量轉(zhuǎn)換為質(zhì)量或能量單位,。因此,舉例來說,,將親代投資定義為配子的生物量或能量含量加上子代獨(dú)立之前的任何直接營養(yǎng)貢獻(xiàn)(如哺乳動(dòng)物的哺乳和晚熟鳥類的喂養(yǎng))是相對簡單的,。但也可能存在問題。一個(gè)明顯的例子是對體內(nèi)妊娠和活產(chǎn)的能量適應(yīng)性的影響,,與硬骨魚,、兩棲動(dòng)物和鳥類相比,在鯊魚,、哺乳動(dòng)物和一些爬行動(dòng)物中,,未出生的后代的死亡率與母本相似。一個(gè)更復(fù)雜的問題是,,如何量化父母和社會(huì)群體成員“教導(dǎo)”和“培養(yǎng)”后代,,并保護(hù)它們不受捕食者和寄生蟲的傷害。這種親代撫育似乎是生產(chǎn)分配的主要影響,,F(xiàn)和1-F,,以及靈長目和口孵慈鯛科等類群的生活史進(jìn)化。


證明規(guī)則的例外情況

概念框架和正式模型即使失敗了也很有用:假設(shè)不成立,,需要額外的因素或參數(shù),,或者數(shù)據(jù)似乎可以反駁預(yù)測。如前所述,,EFP的穩(wěn)態(tài)假設(shè)經(jīng)常被打破,,特別是在小空間和時(shí)間尺度下,。這并沒有否定適合度概念;EFP的機(jī)制基礎(chǔ)(eqs 1和2),,以及生態(tài)和進(jìn)化動(dòng)力學(xué)傾向于在物種間產(chǎn)生幾乎相同的適合度的預(yù)測(圖4),。然而,這確實(shí)意味著在某些情況下可能需要具有更多功能和參數(shù)的模型,。通過將EFP應(yīng)用于特殊情況,,例如孤雌物種,對檢驗(yàn)EFP應(yīng)該是有益的,;具有復(fù)雜生命周期的寄生蟲,、昆蟲和兩棲動(dòng)物;周期性的種群,;以及遷移和衰落的物種,。

實(shí)驗(yàn)測試

DEB、MTE和EFP共享質(zhì)能平衡的關(guān)鍵假設(shè),。但是像Hardy-Weinburg平衡(HWE)一樣,,它們最大的貢獻(xiàn)可能是在穩(wěn)態(tài)假設(shè)不成立時(shí)預(yù)測動(dòng)態(tài)響應(yīng)的應(yīng)用和擴(kuò)展。應(yīng)用環(huán)境科學(xué)的例子包括狩獵,、海洋和淡水魚種群的收獲,、害蟲和入侵物種的控制以及保護(hù)瀕危物種和生態(tài)系統(tǒng)的管理干預(yù)。也有機(jī)會(huì)利用野生動(dòng)物和模型實(shí)驗(yàn)室生物,,如大鼠和小鼠,、果蠅、線蟲和許多單細(xì)胞真核生物和原核生物,,進(jìn)行控制性,、操縱性實(shí)驗(yàn),直接測試?yán)碚擃A(yù)測,。關(guān)于dN=dt生活史性狀的實(shí)驗(yàn)選擇已有相當(dāng)多的文獻(xiàn),,但在檢驗(yàn)選擇對能量適宜度參數(shù)的影響方面仍有豐富的實(shí)驗(yàn)空間。EFP預(yù)測,,增加Pcoh,、G和F的選擇應(yīng)該導(dǎo)致能量適合度的增加。很明顯,,對馴養(yǎng)動(dòng)物的人工選擇導(dǎo)致了人類食物消耗的生物量產(chǎn)量(增長和Pcoh)的大幅增加,,這導(dǎo)致了在影響G和野外生存的性狀上的權(quán)衡。

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生物多樣性與應(yīng)用生態(tài)學(xué)

EFP有助于理解生命的一般規(guī)律,,從物理學(xué),、化學(xué)和生物學(xué)的第一性原理出發(fā),應(yīng)用于系統(tǒng)科學(xué)、人類和應(yīng)用生態(tài)學(xué),,并匯編,、分析和解釋新數(shù)據(jù)。這些包括:

體型譜和能量等效

觀察表明,,一般來說,,小生物是豐富的,而大生物是罕見的,,基于此產(chǎn)生了體型譜的概念。Sheldon的開創(chuàng)性論文表明,,在遠(yuǎn)洋海洋生態(tài)系統(tǒng)中,,所有營養(yǎng)水平上的個(gè)體生物的數(shù)量大約與體質(zhì)量Ni∝mi-1成反比,因此“粒子”的總生物量與體大小無關(guān):Nimi-1≈0,。營養(yǎng)水平內(nèi)的一個(gè)相關(guān)模式是種群密度與克萊伯法則相反,,因此總能量消耗率(同化和呼吸)與體型無關(guān):Ni∝mi-3/4,Ri∝mi3/4和NiRi=mi-3/4 Ri3/4∝mi0

性狀空間

如圖4所示,,個(gè)體發(fā)育和親本投資的時(shí)間順序和數(shù)量分配在不同物種間有很大差異,,但它們都具有相同的能量適合度。很明顯,,這些觀察到的模式只是可能組合的一個(gè)子集,,并且它們中的大多數(shù)沒有等效的適合度。這就提出了一個(gè)有趣的問題,,即生命史參數(shù)的特征空間以及它們?nèi)绾闻c動(dòng)態(tài)環(huán)境相互作用形成群落,。它們能被組合、轉(zhuǎn)化并減少為一個(gè)沿著數(shù)量軸排列的性狀子集嗎,?這些性狀可以解釋大多數(shù)觀察到的變異嗎,?據(jù)推測,這樣的分析將揭示絕對約束,、相對權(quán)衡和其它重要模式,,并導(dǎo)致對生物物理基礎(chǔ)、生態(tài)關(guān)系和進(jìn)化過程的深入了解,。它應(yīng)該有助于回答這樣的問題:為什么在K-T大滅絕后,,硬骨魚入侵海洋,爆炸性地多樣化,,并在很大程度上取代鯊魚和鰩魚,,這種生產(chǎn)大量自己發(fā)育并遭受巨大死亡率的微小卵的戰(zhàn)略顯然促進(jìn)了硬骨魚的發(fā)展?以及如何解釋同一物種兩性在個(gè)體發(fā)育和親本投資分配上有時(shí)存在的巨大差異,。

生態(tài)系統(tǒng)能量學(xué)

MTE已被應(yīng)用于將單個(gè)生物體的新陳代謝與生態(tài)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)和動(dòng)力學(xué)聯(lián)系起來,,從而對理論預(yù)測進(jìn)行演繹檢驗(yàn),并發(fā)現(xiàn)新的經(jīng)驗(yàn)?zāi)J健@?,身體大小和溫度在食物網(wǎng)的結(jié)構(gòu)中起主要作用,。EFP做出了具體的預(yù)測,將個(gè)體表現(xiàn)和種群生活史的能量流與生態(tài)系統(tǒng)能量學(xué)聯(lián)系起來,。參數(shù)F和1-F 與后代的數(shù)量和相對大小密切相關(guān),。例如哺乳動(dòng)物,它們有一些相對較大的后代,,將超過一半的群體生產(chǎn)傳給下一代,;然而,在生態(tài)系統(tǒng)中,,由于繁殖前的死亡,,產(chǎn)生大量微小后代的魚類和無脊椎動(dòng)物失去了超過90%(有時(shí)甚至超過99%)的群體產(chǎn)量。這些來自EFP的新見解對于理解生態(tài)系統(tǒng)在空間和時(shí)間上的動(dòng)態(tài)以及在暫時(shí)脫離穩(wěn)態(tài)種群的過程中整個(gè)生態(tài)系統(tǒng)的能量分支具有重要意義,。

人類生態(tài)學(xué)

DEB,、MTE及其在生物物理定律中的基礎(chǔ)已經(jīng)應(yīng)用于人類生態(tài)學(xué),人類使用能源的關(guān)系和后果是從與環(huán)境處于近似穩(wěn)定狀態(tài)的土著狩獵-采集者向現(xiàn)代農(nóng)業(yè)-工業(yè)技術(shù)社會(huì)過渡,,其不可持續(xù)的做法正在改變生物圈,。跨學(xué)科研究是生態(tài)學(xué)的生物物理科學(xué)與經(jīng)濟(jì)學(xué)和社會(huì)學(xué)的社會(huì)科學(xué)的結(jié)合點(diǎn),,強(qiáng)調(diào)能源和其它資源對現(xiàn)代人類的增長,、社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展和環(huán)境影響的作用。一個(gè)特別有趣的例子是,,如何結(jié)合從靈長類祖先那里繼承下來的生物限制和現(xiàn)代技術(shù)創(chuàng)新來理解城市轉(zhuǎn)型——人類越來越集中在城市,。

結(jié)論:走向現(xiàn)代生態(tài)綜合體

20世紀(jì)中期,現(xiàn)代進(jìn)化綜合理論得到了發(fā)展,,這是一個(gè)統(tǒng)一的理論體系,,它結(jié)合了新發(fā)現(xiàn)的生物遺傳規(guī)律,來解釋生物和化石有機(jī)體的變異和變化的模式和過程,。哈代-溫伯格平衡,,通過假設(shè)穩(wěn)定狀態(tài)并結(jié)合孟德爾遺傳定律,發(fā)揮了重要作用,。同樣地,,我們看到了等適合度范式,通過假設(shè)穩(wěn)定狀態(tài)并結(jié)合生物物理定律,,在現(xiàn)代生態(tài)合成中發(fā)揮了開創(chuàng)性的作用——一個(gè)統(tǒng)一的理論體系,,解釋了生物體與其環(huán)境之間相互作用的模式和過程,即自由能的爭奪,。這樣一種理論有可能把生物的一些最基本的特征結(jié)合起來:(1)新陳代謝,,生物體對能量和物質(zhì)的攝取,、加工和消耗;(2)生理和生活史或生物時(shí)與體重和溫度的標(biāo)度,;(3)種群統(tǒng)計(jì)學(xué)和動(dòng)力學(xué)的普遍特征,;(4)生態(tài)系統(tǒng)的能量和物質(zhì)流動(dòng);(5)生物多樣性的起源與維持,。一些開創(chuàng)性的問題和預(yù)測在本論文之前部分已給出,。要實(shí)現(xiàn)統(tǒng)一還有許多工作要做,但最近的進(jìn)展速度非常樂觀,。

PS:受限于翻譯者的水平,,本文翻譯仍有諸多不當(dāng)之處,請大家多多包涵,。

Microbial Ecology由云南大學(xué)_國際河流與生態(tài)安全研究院_微生物生態(tài)學(xué)研究組創(chuàng)立并負(fù)責(zé)維護(hù),聯(lián)系郵箱:[email protected],。本公眾號(hào)主要推介微生物生態(tài)學(xué)及相關(guān)領(lǐng)域的高質(zhì)量研究論文和綜述,并輔以宏基因組,、宏轉(zhuǎn)錄組、宏病毒組和擴(kuò)增子高通量測序相關(guān)技術(shù)方法的介紹,。點(diǎn)關(guān)注,,不迷路!我們真誠希望與您共學(xué)習(xí),,同進(jìn)步,。

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