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PLOS Biology: 人工智能(AI) 可預(yù)測下一種從動物傳播到人類的病毒

 PaperRSS 2021-09-29

在出現(xiàn)之前確定人畜共患病是一項重大挑戰(zhàn),,因為在估計的167萬種動物病毒中,,只有少數(shù)能夠感染人類。為了開發(fā)使用病毒基因組序列的機器學(xué)習(xí)模型,,研究人員首先匯編了36個家族中861種病毒的數(shù)據(jù)集,。然后,他們建立了機器學(xué)習(xí)模型,,根據(jù)病毒基因組中的模式分配人類感染的概率,。然后,作者應(yīng)用表現(xiàn)最佳的模型分析從一系列物種中取樣的其他病毒基因組預(yù)測的人畜共患病潛力模式,。

研究人員發(fā)現(xiàn),,病毒基因組可能具有不依賴于病毒分類關(guān)系的可概括特征,并可能預(yù)先適應(yīng)病毒感染人類,。他們能夠開發(fā)出能夠利用病毒基因組識別候選人畜共患病的機器學(xué)習(xí)模型,。這些模型有局限性,因為計算機模型只是識別可能感染人類的人畜共患病病毒的初步步驟,。在進行重大的額外研究投資之前,,模型標記的病毒將需要進行確認性實驗室測試。此外,,雖然這些模型預(yù)測了病毒是否能夠感染人類,,但感染能力只是更廣泛的人畜共患病風(fēng)險的一部分,這也受到病毒在人體內(nèi)的毒力,、人與人之間傳播的能力以及人類接觸時的生態(tài)條件的影響,。

根據(jù)作者的說法,“我們的發(fā)現(xiàn)表明,,病毒的人畜共患病潛力可以從其基因組序列中驚人地推斷出來,。通過突出顯示最有可能成為人畜共患病的病毒,基于基因組的排名可以更有效地針對進一步的生態(tài)和病毒學(xué)特征,?!?/span>

Babayan補充道:“這些發(fā)現(xiàn)為我們利用人工智能技術(shù)從病毒基因序列中提取的數(shù)量驚人的信息增加了一個關(guān)鍵部分。”,?!盎蚪M序列通常是我們掌握的關(guān)于新發(fā)現(xiàn)病毒的第一個信息,而且往往是唯一的信息,,我們能從中提取的信息越多,,我們就越早確定病毒的起源及其可能帶來的人畜共患病風(fēng)險。隨著病毒的特征化程度越來越高,,我們的機器學(xué)習(xí)模型將變得越有效這是一種罕見的病毒,,應(yīng)該受到密切監(jiān)測,并優(yōu)先發(fā)展先發(fā)制人的疫苗,?!?/strong>

In your coverage please use these URLs to provide access to the freely available article in PLOS Biology:  http://journals./plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.3001390

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