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生物機(jī)器人,不只是機(jī)器人那么簡單

 where5 2021-07-08

生物機(jī)器人,,不僅可以給癌細(xì)胞送藥,,還能清除海洋微塑料,更可能為多細(xì)胞生物起源提供啟示,。


活細(xì)胞機(jī)器人,。|來源:Douglas Blackiston

作者|湯波 分子生物學(xué)博士
編輯|陳天真

說到機(jī)器人,你想到的大概是有著金屬身體,,由計算機(jī)程序給出指令,、自動執(zhí)行任務(wù)的智能機(jī)器。不過,,科學(xué)家正在利用DNA,、細(xì)胞創(chuàng)造出一些“生物機(jī)器人”,它們可以在生物體中自動執(zhí)行一些特殊任務(wù),,比如給癌細(xì)胞送藥,、清除體內(nèi)微塑料等。

例如,,用青蛙細(xì)胞創(chuàng)造出的一種名為“xenobots”的生物機(jī)器人,,乍一看像是變形蟲之類微小的水生生物,,一會兒繞著什么東西轉(zhuǎn)圈,一會兒來回巡邏,,放佛在尋找什么,。

與金屬和塑料機(jī)器人不同,它們不僅可以進(jìn)行新陳代謝,,受到損壞后能自我修復(fù),,還會響應(yīng)彼此的存在,表現(xiàn)出群體行為,,甚至可能為多細(xì)胞生命的起源提供新視角,。

活細(xì)胞機(jī)器人xenobots。|來源:Douglas Blackiston, Quanta Magazine


“帶貨”DNA納米機(jī)器人

我們研究機(jī)器人,,最主要目的是讓它們自動完成一些任務(wù),。對于生物機(jī)器人而言,最主要的一個用途就是“帶貨”,,比如給癌細(xì)胞帶點(diǎn)藥,,讓它們稀里糊涂被毒死。

可是要怎么制造生物機(jī)器人呢,?科學(xué)家首先瞄上了DNA,。

DNA具有自我折疊的特性,可以像玩折紙游戲一樣,,自行折疊和組裝成形狀各異的二維圖案或三維空間結(jié)構(gòu),,如五角星、笑臉,、美洲地圖以及立方體等,,被認(rèn)為是理想的帶藥載體。

2012年,,哈佛醫(yī)學(xué)院的遺傳學(xué)家喬治·丘奇(George Church)教授帶領(lǐng)兩位博士,,首次完成DNA給藥機(jī)器人的概念設(shè)計。他們經(jīng)過精確模擬計算,,將一段7300多個堿基對的長單鏈DNA和近200個堿基對的短單鏈DNA組裝成一個六邊形的DNA納米管,,管腔內(nèi)可以搭載一些蛋白和其他藥物分子。

DNA納米管可以識別特定的細(xì)胞表面抗原,,從而準(zhǔn)確找到并結(jié)合到癌細(xì)胞上,,然后自動開啟表面的分子開關(guān),將封閉的納米管打開,,釋放出搭載的藥物分子,,直接殺死癌細(xì)胞,甚至讓癌細(xì)胞自殺。

六邊形DNA納米管,。|來源:Science

2018年,,DNA納米機(jī)器人的實際抗癌效果在動物體內(nèi)實驗中得到驗證。在《自然生物技術(shù)》雜志發(fā)表的一項研究中,,DNA納米機(jī)器人攜帶著凝血酶(血液中重要的凝血因子,,可形成血栓)進(jìn)入小鼠的腫瘤組織,結(jié)果在腫瘤組織內(nèi)形成血栓,,導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞無法得到足夠的養(yǎng)分而生長停滯,,甚至被活活餓死。

之后,,研究人員在巴馬小香豬體內(nèi)觀察到類似情況,證明DNA納米機(jī)器人有望成為癌癥治療的新武器,。


活細(xì)胞機(jī)器人也能帶貨?

之所以選擇DNA機(jī)器人帶藥,,主要是因為DNA具有生物相容性且容易降解,也就是說DNA機(jī)器人既能精準(zhǔn)“帶藥”,,又不會給身體惹麻煩,。

既然DNA可以,活的細(xì)胞是不是也可以呢,?生物學(xué)家又想到讓細(xì)胞組團(tuán)來帶貨,。

2020年初,計算機(jī)科學(xué)家約書亞·邦加德(Josh Bongard)與生物學(xué)家邁克爾·萊文(Michael Levin)合作,,利用100%的非洲爪蟾細(xì)胞,,創(chuàng)造出一種可編程、可自主移動,、可降解的活細(xì)胞機(jī)器人,,將其命名為xenobots(爪蟾拉丁名“Xenopus laevis”和機(jī)器人“robots”兩個詞的結(jié)合),研究成果發(fā)表在《美國科學(xué)院院報》上,。

首先,,計算機(jī)專家借助超級計算機(jī)開發(fā)出一種復(fù)雜的進(jìn)化算法,來設(shè)計機(jī)器人模型,。他們模擬出非洲爪蟾的皮膚和心肌細(xì)胞的最佳組裝方案,,希望這些細(xì)胞能自主移動,甚至自動修復(fù),。接下來,,生物學(xué)家從非洲爪蟾胚胎中分離出干細(xì)胞,讓干細(xì)胞進(jìn)一步分化成皮膚細(xì)胞和心肌細(xì)胞,。

根據(jù)超級計算機(jī)設(shè)計的機(jī)器人模型,,研究人員將皮膚細(xì)胞放在上層,將有運(yùn)動能力的心肌細(xì)胞放在下層,中間則可設(shè)計成 “口袋”,,以便于攜帶藥物,。

根據(jù)不同設(shè)計,這種活細(xì)胞機(jī)器人不僅能直線運(yùn)動,,還會繞圈運(yùn)動,,也可負(fù)重前行,具備遞送藥物或其他醫(yī)用材料的潛力,。

利用非洲爪蟾的皮膚和心肌細(xì)胞組裝而成的活細(xì)胞機(jī)器人xenobots,。|來源:Douglas Blackiston and Sam Kriegman

一年之后,研究人員再次改進(jìn)這種活細(xì)胞機(jī)器人,,推出了xenobots 2.0,。相關(guān)成果發(fā)表在2021年3月21日的《科學(xué)-機(jī)器人》雜志上。相比xenobots 1.0 ,,xenobots 2.0主要具備六個新特點(diǎn):

一是只需一種細(xì)胞,。新的設(shè)計只用到一種細(xì)胞,即非洲爪蟾的皮膚細(xì)胞,,拋棄了原來充當(dāng)動力的心肌細(xì)胞,。因為細(xì)胞種類更少,引發(fā)機(jī)體免疫排斥反應(yīng)也會越小,。

二是可自動組裝,。由于單個細(xì)胞具有喜歡“抱團(tuán)”的特點(diǎn),可以實現(xiàn)單細(xì)胞自動組裝,,不再需要進(jìn)行人工組裝,。

三是運(yùn)動速度更快。既然沒有心肌細(xì)胞,,那么細(xì)胞團(tuán)的動力來自哪里呢,?原來非洲爪蟾皮膚上皮細(xì)胞表面能長出纖毛,可以以特定方式來回移動或旋轉(zhuǎn),,為細(xì)胞機(jī)器人提供動力,,速度甚至超過原來的心肌細(xì)胞。

四是存活時間更長,。第一版細(xì)胞機(jī)器人大約只能存活1周左右,,但是給這些細(xì)胞添加特殊的營養(yǎng)素后,可以存活超過90天,。

五是具有自動修復(fù)能力,。新的細(xì)胞機(jī)器人即使被剪成兩半也能重新“抱團(tuán)”,大概在5分鐘內(nèi)即可恢復(fù)原有形狀并繼續(xù)工作,,這點(diǎn)可能是金屬機(jī)器人,、塑料機(jī)器人甚至是DNA機(jī)器人都無法比擬的,。

六是具有記憶能力。研究人員通過熒光蛋白來檢測細(xì)胞機(jī)器人是否具有記憶力,,熒光蛋白大多數(shù)時候是發(fā)綠光,,只有在波長390納米的藍(lán)光照射下,熒光蛋白會發(fā)紅色熒光,。當(dāng)研究人員讓10個細(xì)胞機(jī)器人在390納米藍(lán)光照射點(diǎn)附近活動,,結(jié)果有3個細(xì)胞機(jī)器人發(fā)出紅光,而其他機(jī)器人則仍然保留綠色,,表明這3個細(xì)胞機(jī)器人曾經(jīng)游進(jìn)過藍(lán)光區(qū)域,。

細(xì)胞機(jī)器人即使被剪成兩半,也能迅速自我修復(fù),。|來源:Douglas Blackiston and Sam Kriegman


不止于機(jī)器人

之所以將這些微小的細(xì)胞團(tuán)稱為機(jī)器人,,是因為它們能根據(jù)提前設(shè)定的程序,以固定的形狀,、固定的運(yùn)動方式,,去完成特定的任務(wù),如同常見的金屬機(jī)器人那樣,。

在小范圍的模擬實驗中,研究人員發(fā)現(xiàn),,新版細(xì)胞機(jī)器人比舊版細(xì)胞機(jī)器人能更快更好地完成碎片收集任務(wù),,覆蓋更大的面積,還能穿過狹窄的毛細(xì)血管,。所以除了帶藥,,研究人員還想讓這種細(xì)胞機(jī)器人充當(dāng)清潔工。例如,,可以通過編程將細(xì)胞機(jī)器人釋放到海洋中,,吸附微塑料顆粒,為清除海洋中的塑料污染提供一種更簡便的方法,。

雖然活細(xì)胞機(jī)器人有這么多實際用途,,但關(guān)于活細(xì)胞機(jī)器人本身,仍有很多問題有待解答,。例如,,單個細(xì)胞為什么喜歡聚集成團(tuán)?細(xì)胞如何知道要組裝成多大規(guī)模然后停止,?細(xì)胞機(jī)器人中成百上千個細(xì)胞如何協(xié)同一致工作,?細(xì)胞機(jī)器人被切割后可自我修復(fù),之后會不會自我繁殖,,甚至進(jìn)化成有機(jī)體,?

這些問題的解答,,將為我們理解一些生物如何進(jìn)行自我修復(fù)提供啟發(fā),更可能為研究多細(xì)胞生物的起源和演化提供新視角,。通過創(chuàng)造活細(xì)胞機(jī)器人來反思生命本身的奧秘,,或許才是活細(xì)胞機(jī)器人帶給我們更大的驚喜。

參考文獻(xiàn)
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5.Douglas Blackiston,,Emma Lederer,,Sam Kriegman, et al.A cellular platform for the development of synthetic living machines. Science Robotics. 2021, 52(6), eabf1571. DOI: 10.1126/scirobotics.abf1571.
6.https://www./cells-form-into-xenobots-on-their-own-20210331/
7.https://now./news-releases/scientists-create-next-generation-living-robots

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