日本學者Taisei Kikuchi等人于2018年10月17日在《The ISME Journal》上發(fā)表題目為《Gut bacterial and fungal communities in ground-dwelling beetles are associated with host food habit and habitat》的文章,。該研究表明，地棲甲蟲的腸道細菌和真菌群落受到宿主的食物習性和棲息地的影響,。

文章錄取信息

收稿日期：2018年3月29日,；修訂日期：2018年8月23日；接收日期：2018年9月8日；發(fā)表日期：2018年10月17日

研究摘要

在昆蟲綱的所有目中,，甲蟲（鞘翅目）具有最高的物種多樣性,，并且它們具有不同的飲食習性。腸道微生物可能有助于這種多樣化的飲食習慣,。

在這里,，我們確定了地棲甲蟲與其腸道微生物群落（細菌和真菌）之間關系的模式。

我們收集了來自日本次生落葉林和草原的5個科的46種甲蟲,，并從整個腸道中提取了微生物DNA用于擴增子測序,。

結果表明：除了肉食動物和腐食動物之間的真菌群落，腸道細菌和真菌群落在所有棲息地和宿主的所有飲食習性（肉食動物,，草食動物,，雜食動物和腐食動物）之間存在差異。具體而言,，豐富的細菌群落在飲食習性中有所不同：腐食動物腸道中黃單胞菌科豐富,，而腸桿菌科則在肉食動物和草食動物中豐富。系統(tǒng)發(fā)育上密切相關的甲蟲具有系統(tǒng)發(fā)育相似的腸桿菌科群落,，表明該科的菌群群落結構與甲蟲生態(tài)學的進化變化有關,。據(jù)報道，其中一種真菌群,，耶氏酵母屬（Yarrowia）與多種肉食甲蟲有共生關系,。

我們的研究結果表明，地棲甲蟲和這些微生物之間的共生關系是很普遍的,。

文中主要圖片說明

圖1 來自不同棲息地（a）和不同飲食習性（b）的甲蟲的腸道中的細菌OTU系統(tǒng)發(fā)育多樣性,。不同的字母表示在棲息地或飲食習性中系統(tǒng)發(fā)育多樣性的顯著差異（P <0.05）,。

圖2 基于未加權Unifrac距離,，甲蟲腸道中的細菌群落的PCoA聚類分析圖。圓圈和三角形分別對應于在森林和草地中收集的樣本,，并根據(jù)甲蟲的飲食習性進行著色,。PCoA1和PCoA2的特征值顯示在括號中。

圖3 來自不同棲息地（a）和不同飲食習性（b）的甲蟲的腸道中的細菌科的相對豐度,。采樣深度設置為1300以去除具有低序列讀數(shù)的樣品,。無法歸類為目水平的OTU匯總為“未分類”?？傌S度> 5％的細菌科的名稱在括號中顯示其目名稱,。其他細菌科概括為“其他”。

圖4 來自不同棲息地（a）和不同飲食習性（b）的甲蟲的腸道中的真菌OTU系統(tǒng)發(fā)育多樣性,。

圖5 基于未加權Unifrac距離,，甲蟲腸道中的真菌群落的PCoA聚類分析圖。圓圈和三角形分別對應于在森林和草地中收集的樣本，并根據(jù)甲蟲的飲食習性進行著色,。PCoA1和PCoA2的特征值顯示在括號中,。

圖6 來自不同棲息地（a）和不同飲食習性（b）的甲蟲的腸道中的真菌科的相對豐度。采樣深度設置為1300以去除具有低序列讀數(shù)的樣品,。無法歸類為目水平的OTU匯總為“未分類”,。總豐度> 5％的真菌科的名稱在括號中顯示其目名稱,。其他真菌科概括為“其他”,。

圖7 甲蟲腸道細菌的未加權Unifrac距離與甲蟲菌種（相對豐度較高的科水平菌種）的系統(tǒng)發(fā)育距離之間的關系。還顯示了Pearson相關系數(shù)的Mantel檢驗的統(tǒng)計結果,。