Molecular Ecology科研| Molecular Ecology：昆蟲-微生物共生關系中共生密度的種內(nèi)變異 本文由挖提編譯 英國牛津大學動物學系Benjamin J. Parker等人于2021年1月29日在Molecular Ecology發(fā)表題為《Intraspecific variation in symbiont density in an insect‐microbe symbiosis》的文章,。本研究驗證了宿主與共生基因型之間相對密度的變化以及密度與適應度之間的關系等一系列假說,，并解釋了昆蟲-微生物共生關系中共生密度的種內(nèi)變異情況。 摘要：許多昆蟲宿主垂直傳播一些有利于宿主的微生物,，但是宿主要維持和調(diào)節(jié)這些微生物形成的共生體卻要付出很大的代價,。這些共生體的一個關鍵特征是變異：例如，宿主和共生體基因型之間的共生體密度可能會有所不同,。不過,，維持這種變異的進化力量仍不清楚。本研究利用豌豆蚜蟲 (Acyrthosiphon pisum) 和一種能保護宿主免受真菌病原體侵染的昆蟲共生細菌Regiella insecticola來研究共生體密度的變化,。我們發(fā)現(xiàn),，兩個Regiella系統(tǒng)發(fā)育分支和蚜蟲“生物型”之間的相對共生密度都存在差異。高密度的共生體感染與更高的生存成本有關,，但是密度的變化對Regiella菌株提供的抗真菌保護幾乎沒有影響,。相反，我們發(fā)現(xiàn)在一些蚜蟲基因型中,，共生體密度的急劇下降先于共生體感染的喪失,。總之,，我們的數(shù)據(jù)表明,，從蚜蟲和微生物適合度的角度來看，共生感染的最佳密度可能不同,。Regiella可能通過保持宿主內(nèi)部的高密度來防止損失,，但宿主似乎無法從較高的共生體數(shù)量中獲益,，甚至可能在某些環(huán)境中因丟失代價昂貴的共生體而受益。因此,，在自然種群中觀察到的共生體密度的持續(xù)變化可以通過宿主與其共生微生物之間的協(xié)同進化來維持,。 關鍵詞：共生，種內(nèi)變異,，密度,，豌豆蚜蟲 原名：Intraspecific variation in symbiont density in an insect‐microbe symbiosis 譯名：昆蟲-微生物共生關系中共生密度的種內(nèi)變異 期刊：Molecular Ecology IF：5.163 發(fā)表時間：2021.01.29 通訊作者：Benjamin J. Parker 通訊作者單位：英國牛津大學動物學系；美國田納西州大學微生物學系,；美國羅徹斯特大學生物系 DOI號：10.1111/mec.15821 原文鏈接： https://onlinelibrary./doi/abs/10.1111/mec.15821 AEM科研| Applied Environmental Microbiology：不使用抗生素飼養(yǎng)的育肥豬盲腸微生物組中抗菌和重金屬耐藥性的宏基因組學研究 本文R.A Uyghurii編譯 泰國曼谷朱拉隆功大學獸醫(yī)學院生理學系生物化學部的Gunnaporn Suriyaphol等人于2021年2月5日在Applied Environmental Microbiology發(fā)表題為《Metagenomics of antimicrobial and heavy metal resistance in the cecal microbiome of fattening pigs raised without antibiotics》的文章,。本研究中，利用全基因組鳥槍測序技術（whole-genome shotgun sequencing）檢測無抗生素條件下飼養(yǎng)的育肥豬與普通豬（對照C）盲腸微生物組進行了比較,，對兩組豬的抗生素抗性基因和重金屬抗性基因的分布進行了研究,，并發(fā)現(xiàn)：無抗生素條件下飼養(yǎng)的育肥豬和對照組中只有一些四環(huán)素和大環(huán)內(nèi)酯抗性基因tet（Q），tet（W）和mef（A）豐富顯著高,。tet（Q）和tet（W）基因與每組中不同的優(yōu)勢細菌相關,，顯示出主要細菌具有作AMR基因的貯藏庫的潛在作用。此外,，在兩個豬群中也觀察到了染色體上的銅和鋅的抗性基因,，這與兩個農(nóng)場中銅和鋅添加劑的使用與否無關。 摘要：這項研究旨在利用全基因組鳥槍測序技術（whole-genome shotgun sequencing）檢測：無抗生素（ABF）條件下飼養(yǎng)的育肥豬與普通豬（對照C）相比的盲腸微生物組,，抗生素抗性基因（AMR）和重金屬抗性基因（MRGS）,。ABF豬檢測到普雷沃菌屬（Prevotella）（33％）和乳桿菌屬（Lactobacillus）（13％）的富集，而在C組中,，大腸桿菌（Escherichia coli）（40％）,，梭桿菌屬（Fusobacterium）和擬桿菌屬（Bacteroides）（分別為4％）富集。揭示了ABF和C豬的獨特盲腸菌群簇 (cecal microbiota clusters),；但是,，某些C豬（C1）的微生物群與ABF出現(xiàn)在同一簇中，并且與其余C豬（C2）完全分離,。對于抗生素耐藥性基因 (AMR),，ABF組中檢測到最高的豐度tet（Q）（35.7％）和mef（A）（12.7％），然而在C組中最高的是tet（Q）（26.2％）和tet（W）（10.4％）,。在ABF和C1樣本中,，tet（Q）與普雷沃菌屬（Prevotella）正相關。在C2組中,，突出的tet（W）與梭桿菌屬（Fusobacterium）和擬桿菌屬（Bacteroides）正相關,。實驗所用的豬從未接受過四環(huán)素，但懷孕的母豬在分娩前7天使用了金霉素。不管是否添加Cu和Zn飼料,，兩組中均顯示了染色體上的Cu和Zn的抗性基因,。對于多金屬抗性基因豐度，與ABF組（41％）相比,，C組（44％）觀察到了更高的多金屬抗性基因豐度,。總之,，一些C豬的微生物群與ABF豬相似,。在ABF和C型豬中均觀察到與主要細菌相關的高豐度四環(huán)素抗性基因。還觀察到了MRG,。 重要信息：由于農(nóng)場動物中抗生素抗性基因的問題日益嚴重,，飼養(yǎng)沒有抗生素的農(nóng)場動物是解決這一問題的一種方法。我們的研究表明,，ABF和C組中只有一些四環(huán)素和大環(huán)內(nèi)酯類抗性基因tet（Q）,，tet（W）和mef（A）豐富顯著高。tet（Q）和tet（W）基因與每組中不同的優(yōu)勢細菌相關,，顯示出主要細菌具有作AMR基因的貯藏庫的潛在作用,。此外，在兩個豬群中也觀察到了染色體上的銅和鋅的抗性基因,，這與兩個農(nóng)場中銅和鋅添加劑的使用與否無關,。接下來的研究中,，應進一步研究MRGs和AMR基因型和表型的關聯(lián)以及使細菌對抗生素重新敏感的方法,，以揭示高耐藥基因的原因并解決問題。 原名：Metagenomics of antimicrobial and heavy metal resistance in the cecal microbiome of fattening pigs raised without antibiotics 譯名：不使用抗生素飼養(yǎng)的育肥豬盲腸微生物組中抗菌和重金屬耐藥性的宏基因組學研究 期刊：Applied Environmental Microbiology IF：4.016 發(fā)表時間：2021.2.5 通訊作者：Gunnaporn Suriyaphol 通訊作者單位：泰國曼谷朱拉隆功大學獸醫(yī)學院生理學系生物化學部 DOI號：10.1128/AEM.02684-20 原文鏈接： https://aem./content/early/2021/02/02/AEM.02684-20 科研| Applied and Environmental Microbiology: 微生物群落變化反映了添加熱成和新鮮有機質(zhì)后天然土壤碳的損失,，且在低碳土壤中最大 本文由許茜編譯 威斯康星大學麥迪遜分校土壤科學系Thea Whitman等人于1月29日在Applied and Environmental Microbiology發(fā)表題為《Microbial community shifts reflect losses of native soil carbon with pyrogenic and fresh organic matter additions and are greatest in low-carbon soils》的文章,，本研究用穩(wěn)定同位素、培養(yǎng)試驗及高通量測序方法追蹤有無熱成有機質(zhì)（pyrogenic organic matter PyOM）和有機質(zhì)（organic matter OM）改良的天然有機碳（native Soil organic carbon nSOC）衍生的CO2排放量,，并分析細菌,、古菌和真菌群落以及他們對PyOM（pyrogenic organic matter PyOM）和OM（organic matter OM）的響應。最終研究結果表明：添加OM或PyOM且具有較低土壤有機碳（Soil organic carbon SOC）的土壤可能特別容易受SOC損失短期增加的影響,。 文章摘要：土壤有機碳（Soil organic carbon SOC）在調(diào)節(jié)全球氣候變化,、土壤中碳與養(yǎng)分循環(huán)及土壤水分中扮演著重要角色。土壤中添加有機質(zhì)（organic matter OM）會影響微生物礦化有機碳的速率,，從而對有機碳儲量產(chǎn)生潛在的影響,。了解熱成有機質(zhì)（pyrogenic organic matter PyOM）如何影響天然有機碳（native Soil organic carbon nSOC）的循環(huán)以及引起這些影響的微生物對研究受火災影響的生態(tài)系統(tǒng)及生物碳改良系統(tǒng)都很重要。我們對美國國家生態(tài)觀測站五種不同土壤進行了培養(yǎng)試驗,，并用13C標記的350℃玉米秸稈熱成有機質(zhì)和新鮮的玉米秸稈追蹤有無PyOM和OM改良的nSOC衍生的CO2排放量,。我們利用rRNA基因的高通量測序來分析細菌、古菌和真菌群落以及他們對PyOM和OM的響應。我們發(fā)現(xiàn),，改良對nSOC衍生的CO2的影響反映了未改良的土壤碳狀況,，其中改良使低碳土壤中的碳礦化增加最多。與添加PyOM相比,，OM添加對nSOC-CO2排放的影響更大,。此外，微生物群落組成變化的幅度反映了nSOC-CO2增加的幅度,，表明特定的微生物子集可能是導致觀察到的nSOC礦化改變的原因,。但是，PyOM響應者在不同的土壤有所不同,，并不一定反映出一個共同的“碳際微域”,。總體而言,，這項研究表明：添加OM或PyOM且具有較低SOC的土壤可能特別容易受SOC損失短期增加的影響,。 原名：Microbial community shifts reflect losses of native soil carbon with pyrogenic and fresh organic matter additions and are greatest in low-carbon soils 譯名：微生物群落變化反映了添加熱成和新鮮有機質(zhì)后天然土壤碳的損失，且在低碳土壤中最大 期刊：Applied and Environmental Microbiology IF: 4.016 發(fā)表時間：2021.01 通訊作者：Thea Whitman 通訊作者單位：威斯康星大學麥迪遜分校土壤科學系 DOI號：10.1128/ AEM.02555-20 原文鏈接： https://aem./content/early/2021/01/25/AEM.02555-20 FEMS Microbiology Ecology科研| FEMS Microbiology Ecology：東部蠑螈（綠眼蠑螈,，Notophthalmus viridescens）三個不同生命階段的腸道微生物群落的變化 本文R.A Uyghurii編譯 美國賓夕法尼亞州匹茲堡大學生物科學系Samantha S Fontaine等人于2021年2月6日在FEMS Microbiology Ecology發(fā)表題為《Changes in the gut microbial community of the eastern newt (Notophthalmus viridescens) across its three distinct life stages》的文章,。在東部蠑螈復雜生命周期的每個階段中對腸道微生物群落的比較可能有助于弄清宿主和環(huán)境因素對其腸道微生物群落的影響，因為腸道微生物群落在整個發(fā)育過程中都在變化,。例如,，如果宿主因素更為重要，則由于宿主的生理變化,，每個生命階段都應擁有一個獨特的微生物群落,。但是，如果環(huán)境因子也有所貢獻,，則幼體和成年蠑螈的微生物群落可能彼此更相似,，因為它們生活在同一棲息地。本研究中,，報告了野生東部蠑螈的三個生命階段的腸道菌群特征,，并評估了宿主和環(huán)境因素對其微生物群落組裝的潛在貢獻。 摘要：闡明在整個發(fā)育過程中影響脊椎動物腸道微生物群落組裝和組成的動力是微生物組領域的主要重點,。在這里,，我們將東部蠑螈（綠眼蠑螈，Notophthalmus viridescens）復雜的生命周期作為自然野生模型來比較宿主和環(huán)境因素對腸道微生物組變化的影響,。 我們比較了各個蠑螈三個生理上不同的發(fā)育階段中每個階段的細菌組成,，以確定每個階段是否都擁有一個獨特的群落，或者兩個共享水生生境的階段（幼體和成年）時期是否比第三階段,，即：陸生幼體,，具有更相似的群落。此外，我們評估了發(fā)育過程中,，選擇過程對腸道微生物組裝的貢獻,。我們發(fā)現(xiàn)從結構上來講，每個生命階段都有一個獨特的微生物群,，這可能歸因于宿主因素,。此外，在整個發(fā)育過程中,，我們發(fā)現(xiàn)微生物群的組裝過程從占主導地位的中立力量轉(zhuǎn)變?yōu)檫x擇性力量,。然而，由于基于這些指標的后代群落的獨特性,，棲息地在確定微生物群成員和多樣性方面也可能很重要,。我們的結果與其他脊椎動物類群中的結果相似，表明腸道菌群的組裝過程可能在不同譜脊椎動物系中是具有普遍性,。 原名：Changes in the gut microbial community of the eastern newt (Notophthalmus viridescens) across its three distinct life stages 譯名：東部蠑螈（綠眼蠑螈,，Notophthalmus viridescens）三個不同生命階段的腸道微生物群落的變化 期刊：FEMS Microbiology Ecology IF：3.675 發(fā)表時間：2021.2.6 通訊作者：Samantha S Fontaine 通訊作者單位：美國賓夕法尼亞州匹茲堡大學生物科學系 DOI號：10.1093/femsec/fiab021 原文鏈接： https://academic./femsec/advance-article/doi/10.1093/femsec/fiab021/6129798?login=true 科研| FEMS Microbiology Ecology：土壤深度對森林土壤中微生物組成變化及界間共生模式的重要性 本文由許茜編譯 挪威奧斯陸大學生物科學系Sunil Mundra等人于2月6日在FEMS Microbiology Ecology發(fā)表題為《Soil depth matters: Shift in composition and inter-kingdom co-occurrence patterns of microorganisms in forest soils》的文章，通過對挪威白樺樹林四個不同深度的土壤樣品進行DNA宏條形碼和細菌,、真菌以及其他微型真核生物的網(wǎng)絡分析,，發(fā)現(xiàn)所有生物類群的微生物群落組成隨土壤深度呈強烈的周轉(zhuǎn)性變化。且與有機質(zhì)土壤和下部礦質(zhì)土壤相比,，上部礦質(zhì)層 (0-5cm) 的界間共生模式更為強烈,，表明土壤深度對生物相互作用有重要影響。 文章摘要：土壤深度代表了顯著的理化梯度,，極大地影響著棲息在土壤中的微生物,。真菌群落結構通常取決于土壤深度，但其他微生物構成受哪些因素影響還不清楚,。本文我們研究了與土壤深度相關的化學變化是否影響土壤微生物群落的分布和共生模式,。通過對挪威白樺樹林四個不同深度的土壤樣品進行DNA宏條形碼和細菌、真菌以及其他微型真核生物的網(wǎng)絡分析,，發(fā)現(xiàn)所有生物類群的微生物群落組成隨土壤深度呈強烈的周轉(zhuǎn)性變化。營養(yǎng)豐富的有機層微生物多樣性和真菌生物量顯著增加,，向營養(yǎng)豐富程度較低的礦物層急劇減少,。有機層中營養(yǎng)豐富細菌、節(jié)肢動物和頂復門原蟲的比例明顯較高,，而貧營養(yǎng)細菌,，絲足蟲類（Cercozoa）、子囊菌（Ascomycota）和菌根真菌的類型則相反,。網(wǎng)絡分析表明,，與上述有機質(zhì)土壤和下部礦質(zhì)土壤相比，上部礦質(zhì)層 (0-5cm) 的界間共生模式更為強烈，表明土壤深度對生物相互作用有重要影響,。本研究支持不同微生物群落適應不同森林土壤層的觀點,，其相互作用程度隨深度梯度而變化。 關鍵詞：共生模式,、宏條形碼,、微生物群落、微生物相互作用,、白樺,、北方白樺林 原名：Soil depth matters: Shift in composition and inter-kingdom co-occurrence patterns of microorganisms in forest soils 譯名：土壤深度對森林土壤中微生物組成變化及界間共生模式的重要性 期刊：FEMS Microbiology Ecology IF: 3.675 發(fā)表時間：2021.02 通訊作者：Sunil Mundra 通訊作者單位：挪威奧斯陸大學生物科學系 DOI號：10.1093/femsec/fiab022/6129799 原文鏈接： https://academic./femsec/advance-article/doi/10.1093/femsec/fiab022/6129799 科研| FEMS Microbiology Ecology：不同農(nóng)業(yè)管理歷史條件下生菜根際微生物群落結構和植物生長習性的差異 本文由小西編譯 朱利葉斯庫恩研究所-德國聯(lián)邦栽培植物研究中心流行病和病原診斷研究所Doreen Babin等人于2021年2月11日在FEMS Microbiology Ecology發(fā)表題為《Distinct rhizomicrobiota assemblages and plant performance in lettuce grown in soils with different agricultural management histories》的文章，本研究以模式作物生菜作為研究目標,，通過對假單胞菌 (Pseudomonas ) 16S rRNA基因和油壺菌屬 (Olpidium) ITS2區(qū)進行高通量測序,，結果表明耕作方式、施肥強度,、前茬作物等農(nóng)業(yè)管理措施對土壤以及生菜根際微生物群均有不同程度的影響,，合理有效的施肥方式甚至可調(diào)控生菜的生長發(fā)育。該項研究進一步證明了農(nóng)業(yè)管理實踐可影響土壤微生物群落的形成,，為作物的可持續(xù)生產(chǎn)的提供理論依據(jù),。 摘要：更好地了解根際微生物群落形成的影響因素對于作物的可持續(xù)生產(chǎn)至關重要。我們猜想農(nóng)業(yè)管理對于土壤微生物的影響主要反映在根際微生物群落結構形成過程中,，并對植物的生長習性具有一定的作用,。我們以模式作物生菜作為研究目標，設計了一個在土壤控制條件下的培養(yǎng)室,。在長期田間試驗條件下,，并對比其在耕作方式（平地犁與耕耘機）、施肥強度（密集標準氮（N）+農(nóng)藥/生長調(diào)節(jié)劑與含氮量不足且無殺菌劑或生長調(diào)節(jié)劑）,、前茬作物（油菜與冬小麥）等不同條件下的生長狀態(tài),。細菌/古生菌16S rRNA基因和真菌ITS2區(qū)的高通量測序表明，以上這些因素對土壤以及生菜根際微生物群均有不同程度的影響,。假單胞菌(Pseudomonas )和油壺菌屬 (Olpidium) 是生菜根際農(nóng)業(yè)管理的重要指標,。與過度施肥相比，長期施肥可促進生菜生長,，并引起其逆境脅迫相關基因的上調(diào)表達,。我們的工作豐富了如何通過農(nóng)業(yè)管理實踐來控制土壤微生物群的相關知識，這些實踐亦可應用于作物的可持續(xù)生產(chǎn),。 關鍵詞：耕作,，施肥，輪作,，16S rRNA基因,，ITS區(qū),，植物基因表達 原名：Distinct rhizomicrobiota assemblages and plant performance in lettuce grown in soils with different agricultural management histories. 譯名：不同農(nóng)業(yè)管理歷史條件下生菜根際微生物群落結構和植物生長習性的差異 期刊：FEMS Microbiology Ecology IF：3.675 發(fā)表時間：2021.02.11 通訊作者：Doreen Babin 通訊作者單位：朱利葉斯庫恩研究所-德國聯(lián)邦栽培植物研究中心流行病和病原診斷研究所 DOI號：10.1093/femsec/fiab027 原文鏈接： https://academic./femsec/advance-article-abstract/doi/10.1093/femsec/fiab027/6133471 Plant and Soil科研| Plant soil：高產(chǎn)和傳統(tǒng)水稻品種之間絲狀菌根真菌群落的比較 本文由永稷編譯 比利時魯汶大學植物保護與種群生物學系的S. Parvin于2021年02月03日在Plant soil發(fā)表題為《A comparison of the arbuscular mycorrhizal fungal communities among Bangladeshi modern high yielding and traditional rice varieties》的文章。菌根絲狀真菌在自然和農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)中具有重要的作用,。大量研究報道絲狀菌根真菌存在于所有陸地生態(tài)系統(tǒng)中,，包括熱帶和溫帶森林、高山,、山丘,、沙漠、草地,、水生植物及農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)中,。它們可以形成獨特的樹狀亞細胞結構，稱之為菌根,。其存在于植物根系細胞中,，是植物和土壤營養(yǎng)交換的功能位點。在共生伙伴關系中,，絲狀菌根真菌會為植物提供氮,、磷等礦質(zhì)營養(yǎng)，并從植物根系中獲得碳,，從而促進植物生長,。絲狀菌根真菌還可以保護植物抵御病害，增加其對生物和非生物脅迫的適應性,。此外,，絲狀菌根真菌也會在土壤中形成菌絲網(wǎng)絡，從而改善土壤團聚體結構,。運用絲狀菌根真菌逐漸成為農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展中備受青睞的有力工具,。大量研究表明現(xiàn)代作物育種影響了作物與絲狀菌根真菌共生體的形成，但是有關水稻育種過程中對絲狀菌根真菌的影響仍未可知,。本研究對不同品種絲狀菌根真菌多樣性和群落組成進行了研究,。結果表明，高產(chǎn)品種和傳統(tǒng)品種間絲狀菌根真菌多樣性及群落組成和結構存在顯著差異,，說明基因選擇不經(jīng)意的改變了現(xiàn)代作物品種從土壤微生物中獲益的能力,。盡管絲狀菌根真菌與作為之間的共生關系受到作為基因型和環(huán)境等多種因素的影響，但是絲狀菌根真菌在種間的變化可作為通過改良作物品種招募特異絲狀菌根真菌形成共生體成為可能,，以期為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中通過微生物來進行新品種的選育提供新的視角,。 文章摘要：絲狀菌根真菌（Arbuscular Mycorrhizal Fungi，AMF）是一種特殊的土壤微生物,，在農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)中具有重要的作用。盡管絲狀菌根真菌具有較低的宿主特異性,，但是現(xiàn)代植物育種中所所選擇的作物基因型對菌根絲狀真菌具有更高的選擇性,，從而導致現(xiàn)代高產(chǎn)品種（HYV）較傳統(tǒng)品種具有較低的絲狀菌根真菌多樣性,。然而，該理論對于田間條件下的水稻品種而言仍未可知,。本研究旨在對現(xiàn)代高產(chǎn)品種（HYV）和傳統(tǒng)水稻品種之間絲狀菌根真菌群落的差異性進行比對,。本研究從40個不同水稻田間收集了孟加拉國2個傳統(tǒng)水稻品種和3個現(xiàn)代高產(chǎn)品種（HYV），并通過高通量擴增子測序定量分析了絲狀菌根真菌豐度,、多樣性和群落組成,。總體上,，有分屬于6個絲狀菌根真菌屬的75個絲狀菌根真菌OTUs,。其中，球囊霉科Glomeraceae是主要的屬,。通過對土壤絲狀菌根差異進行分析,，發(fā)現(xiàn)5個水稻品種絲狀菌根真菌的多樣性顯著不同，且傳統(tǒng)品種較現(xiàn)代高產(chǎn)品種的絲狀菌根真菌的多樣性高,，傳統(tǒng)和高產(chǎn)水稻品種的絲狀菌根真菌的組成和結構存在顯著差異,。通過指示物種分析發(fā)現(xiàn)，傳統(tǒng)水稻品種中存在9個OTUs與其顯著相關,，而現(xiàn)代高產(chǎn)品種中不存在指示OTUs存在,。本研究表明現(xiàn)代高肥料使用率育種技術可能是導致現(xiàn)代高產(chǎn)品種和傳統(tǒng)品種之間絲狀菌根真菌多樣性和群落組成差異的主要原因。 原名：A comparison of the arbuscular mycorrhizal fungal communities among Bangladeshi modern high yielding and traditional rice varieties 譯名：高產(chǎn)和傳統(tǒng)水稻品種之間絲狀菌根真菌群落的比較 期刊：Plant soil IF：3.299 發(fā)表時間：2021.02.03 通訊作者：S. Parvin 通訊作者單位：比利時魯汶大學植物保護與種群生物學系生物學 DOI號：10.1007/s11104-021-04858-4 原文鏈接： https:///10.1007/s11104-021-04858-4 科研| Plant and Soil：覆蓋作物種類和土壤類型對植物-微生物-土壤系統(tǒng)營養(yǎng)化學計量的響應 本文由挖提編譯 瑞士尼翁植物生產(chǎn)系統(tǒng)研究部Luca Bragazza等人于2021年1月30日在Plant and Soil發(fā)表題為《Nutrient stoichiometry of a plant-microbe-soil system in response to cover crop species and soil type》的文章,，本研究通過溫室實驗研究了覆蓋作物特性和土壤類型對植物-微生物-土壤系統(tǒng)營養(yǎng)化學計量的具體影響,，發(fā)現(xiàn)與覆蓋作物特性相比，土壤類型在影響微生物代謝方面起主要作用,，為實施農(nóng)業(yè)生態(tài)實踐奠定了堅實的基礎,。 摘要：目標：生態(tài)化學計量學的理論大多建立在陸地自然生態(tài)系統(tǒng)的研究基礎上，但是卻受限于能夠響應農(nóng)藝實踐的化學計量學信息,。 方法：為了研究覆蓋作物特性和土壤類型對植物-微生物-土壤系統(tǒng)營養(yǎng)化學計量的具體影響,，我們設計了溫室試驗。 結果：覆蓋作物生物量的營養(yǎng)比是種特異性的,，其生長速率解釋了大多數(shù)物種在響應土壤類型方面化學計量上的差異,。相比之下，土壤微生物的營養(yǎng)化學計量更趨于自我平衡,，并且對覆蓋作物種類和土壤類型均無響應,。與裸地相比，覆蓋作物的存在促進了富粘土壤中微生物磷的固定,，而促進了富砂土壤中微生物生物量碳和微生物氮的固定,。在黏土中，微生物累積呼吸作用越大,，在培養(yǎng)開始時觀察到的微生物生物量C就越高,，這表明與覆蓋作物特性相比,，土壤類型在影響微生物代謝方面起主要作用。 結論：通過對植物-微生物-土壤系統(tǒng)化學計量約束的了解,，該發(fā)現(xiàn)讓我們能夠根據(jù)土壤類型選擇合適的覆蓋作物品種來幫助實施農(nóng)業(yè)生態(tài)實踐,，例如，避免由于微生物營養(yǎng)固定造成的營養(yǎng)限制,。 關鍵詞：農(nóng)業(yè)土壤,、生態(tài)化學計量學、土壤質(zhì)地,、代謝商,、累積土壤呼吸、自我平衡,。 原名：Nutrient stoichiometry of a plant-microbe-soil system in response to cover crop species and soil type 譯名：覆蓋作物種類和土壤類型對植物-微生物-土壤系統(tǒng)營養(yǎng)化學計量的響應 期刊：Plant and Soil IF：3.299 發(fā)表時間：2021.01.30 通訊作者：Luca Bragazza 通訊作者單位：瑞士尼翁植物生產(chǎn)系統(tǒng)研究部 DOI號：10.1007/s11104-021-04853-9 原文鏈接： https://link./article/10.1007/s11104-021-04853-9 科研| Plant and Soil：不同土壤類型的有機質(zhì)輸入對楊樹根際細菌群落組成的影響 本文由挖提編譯 南京林業(yè)大學南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心王艮梅等人于2021年2月6日在Plant and Soil發(fā)表題為《Distinct bacterial community compositions in the Populus rhizosphere under three types of organic matter input across different soil types》的文章,，本研究通過盆栽試驗研究了土壤類型和有機輸入對楊樹根際細菌群落組成的影響，結果表明有機質(zhì)輸入增加了楊樹根際的多樣性和網(wǎng)絡交互作用,，并表示可以通過提高資源可用性來促進物種共存,，對楊樹根際細菌群落組成的研究具有重要的借鑒意義。 摘要：背景和目的：添加有機質(zhì)是維持土壤肥力和人工生態(tài)系統(tǒng)可持續(xù)性的一項重要管理措施,。然而,，不同類型的有機質(zhì)對多年生植物根際微生物群落的影響尚不清楚。 方法：通過盆栽試驗研究了土壤類型和有機輸入對楊樹根際細菌群落組成的影響,。在普通森林土壤 (COM) 和楊樹森林土壤 (POP) 中種植植物,，分別施用3種類型的有機質(zhì)。采集生長4個月后的根際土壤樣品,，利用16S rRNA高通量測序技術分析了根際細菌群落結構,。 結果：有機輸入增加了COM的α多樣性，但沒有增加POP的α多樣性,。土壤類型和有機輸入均對群落結構有顯著影響,。不同類型的有機質(zhì)在楊樹根際共同富集了Ramlibacter、Sphingomonas和Adhaeribacter的OTUs,。在門水平上,，添加有機質(zhì)改善了根際網(wǎng)絡的復雜性和穩(wěn)定性，但對根際網(wǎng)絡的物種組成影響不大,。 結論：有機添加物提高了楊樹根際網(wǎng)絡的穩(wěn)定性,。這些結果表明有機質(zhì)輸入增加了楊樹根際的多樣性和網(wǎng)絡交互作用，并表示能通過提高資源可用性來促進物種共存,。 關鍵詞：有機鹽,、楊樹根際、網(wǎng)絡結構,、自然連接 原名：Distinct bacterial community compositions in the Populus rhizosphere under three types of organic matter input across different soil types 譯名：不同土壤類型的有機質(zhì)輸入對楊樹根際細菌群落組成的影響 期刊：Plant and Soil IF：3.299 發(fā)表時間：2021.02.06 通訊作者：王艮梅 通訊作者單位：南京林業(yè)大學南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心 DOI號：10.1007/s11104-021-04859-3 原文鏈接： https://link./article/10.1007/s11104-021-04859-3 科研| Plant and Soil：固氮入侵植物提高有益土壤微生物的豐度但依舊遭受土壤的負面反饋 本文由弈軒編譯 美國加州大學圣克魯斯分校生態(tài)與進化生物學系的Elizabeth J. Davis等人于2021年2月9日在Plant and Soil發(fā)表題為《A widespread nitrogen-fixing invader experiences negative soil feedbacks despite enhancing the abundance of beneficial soil microbes》的文章,，本研究通過對比灌木cytisusscoparius是否入侵土壤,，以及比較該灌木入侵土壤與道格拉斯冷杉入侵土壤對微生物影響的區(qū)別,，發(fā)現(xiàn)Cytisus的入侵確實會導致固氮相關的微生物豐度的增加,，但是經(jīng)過Cytisus處理的土壤中的植物生長比在非侵入土壤中生長的小41%，即整個植物-土壤反饋仍然是負的,。 摘要：背景和目標：植物-土壤反饋可能決定引進物種能否長期成功,。在這里，我們研究了一種全球入侵灌木cytisusscoparius（以下簡稱Cytisus）的植物-土壤反饋,，該灌木與多種微生物之間存在互惠協(xié)會關系,，并導致西北太平洋地區(qū)以道格拉斯冷杉森林為主。 方法：我們在兩個溫室實驗中研究了Cytisus根瘤,，菌根定植和生長,。首先，我們將入侵土壤與未入侵土壤進行了比較,。然后,，用Cytisus（入侵和未入侵的農(nóng)田土壤）和道格拉斯冷杉處理的土壤進行了土壤調(diào)節(jié)試驗。 結果：在入侵土壤中生長的Cytisus比未入侵土壤的根瘤多67%,，菌根定植多72%,。與道格拉斯冷杉處理的土壤相比，Cytisus處理的非侵入土壤根瘤增加14%,，菌根定殖增加55%,。盡管共生體的數(shù)量增加，但在經(jīng)過Cytisus處理的土壤中生長的蘇鐵比在非侵入土壤中生長的小41%,。 結論：Cytisus增加了土壤中微生物共生體的豐度,，但整個植物-土壤反饋仍然是負的，可能是由土傳病原體,、營養(yǎng)耗竭和/或共生體的收益降低所驅(qū)動,。關于Cytisus在其入侵范圍內(nèi)達到的高密度是由植物土壤的積極反饋引起的這一猜想，我們的結果是不支持的,。 關鍵詞：廢核燃料,、微生物生態(tài)學、塞拉菲爾德,、噬菌體,、核儲存池、氫代謝 原名：A widespread nitrogen-fixing invader experiences negative soil feedbacks despite enhancing the abundance of beneficial soil microbes 譯名：固氮入侵植物提高有益土壤微生物的豐度但依舊遭受土壤的負面反饋 期刊：Plant and Soil IF：3.299 發(fā)表時間：2021.2.9 通訊作者：Elizabeth J. Davis 通訊作者單位：美國加州大學圣克魯斯分校生態(tài)與進化生物學系 DOI號：10.1007/s11104-020-04804-w 原文鏈接： https://link./article/10.1007/s11104-020-04804-w#citeas 免費領取方法 關注《微生態(tài)》公眾號,，掃碼聯(lián)系微生態(tài)老師18（微信號M18018711790）,，備注《環(huán)境微生物最新研究進展文獻包-20210407》，即可獲得文獻包,。 |
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