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讀文萬(wàn)卷016期:DCE和DSC用于膠質(zhì)瘤分級(jí)的性能對(duì)比;復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)揭示帕金森早期病程

 思影科技 2020-10-13
1,、European Journal of RadiologyDCEDSC用于膠質(zhì)瘤分級(jí)的性能對(duì)比

DSC技術(shù)在用于膠質(zhì)瘤分級(jí)時(shí),,具有較高的診斷精度,盡管會(huì)受到磁敏感影響的限制,。DCE作為另一種可選技術(shù),,可以克服上述缺點(diǎn)。該文中,,作者(Corrado Santarosa,,意大利San Raffaele研究所)意在對(duì)比這兩種技術(shù)衍生的指標(biāo)用于膠質(zhì)瘤分級(jí)時(shí),哪種精度更高,。

作者主要使用的分析方式為Hotspot分析,,即基于手工繪制的ROI,提取ROI內(nèi)的指標(biāo)峰值,,再做后續(xù)統(tǒng)計(jì),。對(duì)于DSC,使用的指標(biāo)主要為rCBV,,相對(duì)腦血容量,。其計(jì)算方式為,先計(jì)算出腫瘤區(qū)域的CBV,,再除以對(duì)側(cè)大腦區(qū)域進(jìn)行歸一化,。對(duì)于DCE,則使用VpKtrans這兩種衡量滲透率的指標(biāo),。三種指標(biāo)如圖所示,,左圖為 II級(jí)膠質(zhì)瘤,右圖為IV級(jí)膠質(zhì)瘤,;b/c/d分別為Ktrans,、CBVVp指標(biāo)圖,,可以看到,,II級(jí)膠質(zhì)瘤區(qū)域三種指標(biāo)都很低,而IV級(jí)膠質(zhì)瘤三種指標(biāo)都很高,。

統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)表明,,rCBV的差異顯著(p=0.017),,VpKtrans差異顯著(p=0.008)。ROC曲線分析表明,,Vp,、Ktrans的曲線下面積可達(dá)到0.94~0.98左右,,而rCBV則在0.89~0.93左右,,提示DCE在膠質(zhì)瘤等級(jí)分類時(shí)具有更好性能

 
原文:Dynamic contrast-enhanced and dynamic susceptibility contrast perfusion MR imaging for glioma grading: preliminary comparison of vessel compartment and permeability parameters using hotspot and histogram analysis
https:///10.1016/j.ejrad.2016.03.020

2,、Medical Image Analysis:復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)揭示帕金森早期病程

帕金森病(PD)是繼阿爾茨海默病之后最常見(jiàn)的神經(jīng)系統(tǒng)疾病,,其特征是長(zhǎng)達(dá)20年的前驅(qū)期。由于年齡是帕金森病的重要危險(xiǎn)因素,,未來(lái)幾年帕金森病患者將持續(xù)增加,,迫切需要制定有效的早期診斷和治療策略。Nicola Amoroso等人在Medical Image Analysis上發(fā)文,,提出一種基于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的利用磁共振成像(MRI)數(shù)據(jù)進(jìn)行準(zhǔn)確早期診斷的新方法,。他們利用MRI定義了一個(gè)大腦區(qū)域的網(wǎng)絡(luò)模型,并將每個(gè)區(qū)域關(guān)聯(lián)到適當(dāng)?shù)倪B接度量,。因此,,每個(gè)大腦都通過(guò)一個(gè)特征向量來(lái)表示,該特征向量編碼了大腦區(qū)域交織的局部關(guān)系,。然后,,利用隨機(jī)森林進(jìn)行特征選擇。最后,,使用支持向量機(jī)將復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)特征與帕金森病前驅(qū)期典型臨床評(píng)分相結(jié)合,,提供診斷指標(biāo)。評(píng)估了帕金森病進(jìn)展標(biāo)記計(jì)劃(PPMI)數(shù)據(jù)庫(kù)的分類性能,,包括169例正常對(duì)照(NC)374PD患者的混合隊(duì)列,。
結(jié)果與現(xiàn)有的最先進(jìn)的核磁共振成像方法相比較是一致的,表明MRI數(shù)據(jù)的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)指標(biāo)可以作為早期PD的標(biāo)志物,,此方法沒(méi)有任何先驗(yàn)的假設(shè),,探索性的發(fā)現(xiàn)腦區(qū),根據(jù)疾病的影響對(duì)大腦區(qū)域進(jìn)行排序,,并且比其他方法的分類表現(xiàn)更好,。
 
原文:Complex networks reveal early MRI markers of Parkinson’s disease
https:///10.1016/j.media.2018.05.004
 
3、Trends in Cognitive Sciences:皮層神經(jīng)節(jié)律與感覺(jué)預(yù)測(cè)

      已有的很多研究表明,,大腦在不斷地調(diào)整其節(jié)律,,而這與感覺(jué)的預(yù)測(cè)有關(guān)。同時(shí),,大腦的預(yù)測(cè)能力包含了時(shí)間和事物兩個(gè)方面,。本文從神經(jīng)節(jié)律的角度,,總結(jié)了已有的時(shí)間和事件預(yù)測(cè)的具體機(jī)制。我們認(rèn)為大腦在時(shí)間和事件的預(yù)測(cè)上的神經(jīng)節(jié)律是存在差異的,,且這種差異是動(dòng)態(tài)變化的,。 
      已有研究表明,人類的感知系統(tǒng)依據(jù)事物已有的規(guī)則進(jìn)行預(yù)測(cè),,事物已有的規(guī)則包括刺激出現(xiàn)的頻率,、背景等信息。在眾多關(guān)于人類感知預(yù)測(cè)的假說(shuō)中,,最為經(jīng)典的是,,大腦通過(guò)學(xué)習(xí)事物的規(guī)則對(duì)其產(chǎn)生預(yù)測(cè)能力。而貝葉斯模型是事物預(yù)測(cè)能力的經(jīng)典應(yīng)用,。在該模型中,,信息的輸入時(shí)候以概率的形式進(jìn)行挑選,從而實(shí)現(xiàn)優(yōu)化,,進(jìn)而達(dá)到事物預(yù)測(cè)的目標(biāo),。
       但是以日常中的言語(yǔ)交流為例,在該過(guò)程中,,事物/詞匯和時(shí)間/詞匯出現(xiàn)的順序?qū)τ谘哉Z(yǔ)交流都至關(guān)重要,。但是,即便對(duì)時(shí)間和事物的預(yù)測(cè)有時(shí)候是同時(shí)發(fā)生的,,但事物和時(shí)間的預(yù)測(cè)的神經(jīng)生物學(xué)機(jī)制卻存在差異,。大腦皮層的低頻成分可以對(duì)大腦活動(dòng)進(jìn)行調(diào)諧,從而對(duì)大腦信息的挑選實(shí)現(xiàn)優(yōu)化,,進(jìn)而達(dá)到時(shí)間預(yù)測(cè)的目標(biāo),。
原文:Cortical oscillations and sensory predictions
DOI:http://dx./10.1016/j.tics.2012.05.003

4、Neuron 持續(xù)活動(dòng)神經(jīng)元聯(lián)合相位率編碼是維持多項(xiàng)目工作記憶的機(jī)制

在工作記憶(WM)中保持多個(gè)項(xiàng)目是人類行為的核心,。持續(xù)活躍的神經(jīng)元被認(rèn)為是維持WMs的一種機(jī)制,,但當(dāng)記憶中同時(shí)保存多個(gè)項(xiàng)目時(shí),這種活動(dòng)是如何被協(xié)調(diào)的仍未可知,。來(lái)自美國(guó)洛杉磯市Cedars-Sinai醫(yī)療中心神經(jīng)外科的Jan Kaminski等人在Neuron發(fā)文,,使用ECOG的研究方法在19名癲癇患者的術(shù)中植入電極,并在術(shù)中讓參與者執(zhí)行改良后的斯滕伯格任務(wù),,以探究維持多項(xiàng)目工作記憶的機(jī)制,。

      結(jié)果發(fā)現(xiàn),在維持工作記憶的過(guò)程中,,顳葉內(nèi)側(cè)的選擇性持續(xù)活動(dòng)神經(jīng)元會(huì)鎖相到持續(xù)的低頻振蕩(1-7hz),。鎖相的性能取決于記憶的容量和負(fù)載。在高記憶負(fù)荷期間,神經(jīng)元鎖相的振蕩活動(dòng)階段,,提供了有關(guān)神經(jīng)元放電率中不可用的記憶內(nèi)容的信息,。研究者們提供了一個(gè)計(jì)算模型,揭示了抑制性-反饋介導(dǎo)的多個(gè)持續(xù)活動(dòng)神經(jīng)元之間的競(jìng)爭(zhēng)現(xiàn)象,。該研究表明,,在較高的記憶負(fù)荷下,神經(jīng)元表現(xiàn)出信息的相位編碼,,這種效應(yīng)可以通過(guò)共享抑制作用從競(jìng)爭(zhēng)中產(chǎn)生,。

 
原文:Combined Phase-Rate Coding by Persistently Active Neurons as a Mechanism for Maintaining Multiple Items in Working Memory in Humans
DOIhttps:///10.1016/j.neuron.2020.01.032
 
5、BRAIN:左顳頂葉和額葉卒中后語(yǔ)言的動(dòng)態(tài)重組

語(yǔ)言功能依賴于多個(gè)腦區(qū)的協(xié)同作用,,其中包括前額下回(IFG),,前顳葉(ATL),后顳葉(PTL)等,,這些區(qū)域構(gòu)成了左側(cè)的額顳網(wǎng)絡(luò),中風(fēng)失語(yǔ)患者可能是由于網(wǎng)絡(luò)動(dòng)態(tài)功能的障礙所引起的,,探索這一機(jī)制可以為中風(fēng)后失語(yǔ)癥的治療提供臨床基礎(chǔ),。
本研究選取34名缺血性卒中的患者,其中17名患者左額葉皮層受損,;另外17名患者顳頂葉皮層受損,,同時(shí)選取17名健康被試作為研究對(duì)照組。在被試的急性期,,亞急性期和慢性期三個(gè)階段分別進(jìn)行一次功能磁共振掃描,。使用AAT(亞琛失語(yǔ)癥測(cè)試)對(duì)語(yǔ)言能力進(jìn)行評(píng)估,綜合得分為1表示完全恢復(fù),。分析兩組患者在三個(gè)階段的fMRI的激活情況的差異(雙因素方差分析,,被試分組*時(shí)間)。動(dòng)態(tài)激使用多變量回歸分析去分析有顯著差異的ROI感興趣區(qū)域,,分析激活情況與語(yǔ)言能力恢復(fù)的關(guān)系,。本文可能為無(wú)創(chuàng)腦刺激提供一個(gè)新的治療方案,使其能夠在正確的位置和時(shí)間應(yīng)用時(shí)會(huì)達(dá)到一定的臨床效果,。
 
原文:Dynamics of language reorganization after left temporo-parietal and frontal stroke
doi:10.1093/brain/awaa023

6,、Cerebral cortex:小鼠纖維追蹤與追蹤數(shù)據(jù)比較

由于想要了解異常的神經(jīng)連接在精神與神經(jīng)性疾病中扮演的角色,人們對(duì)于大腦固有連接的興趣越發(fā)濃厚,。而通過(guò)小動(dòng)物的腦網(wǎng)絡(luò)技術(shù)對(duì)于了解疾病的異常連接十分重要,。基于彌散張量的纖維追蹤技術(shù)可以提供一種非侵入,、3D以及全腦范圍的結(jié)構(gòu)連接網(wǎng)絡(luò),,但是基于彌散張量成像的纖維追蹤技術(shù)也有由于其低分辨率、低信噪比以及單個(gè)體素下纖維方向的不確定性而有所局限。但是通過(guò)結(jié)合造影劑,、先進(jìn)的彌散數(shù)據(jù)采集與重構(gòu)方法可有效解決該問(wèn)題,。本文中Evan Calabrese展示了一種綜合的顯微級(jí)別的全腦概率追蹤,并基于小鼠的艾倫腦圖譜比較了基于纖維追綜的神經(jīng)連接與使用顯影集輔助分析的腦網(wǎng)絡(luò)分析效果,。本工作為后續(xù)小鼠纖維追蹤功能連接研究提供了參考的數(shù)據(jù),,并說(shuō)明了追蹤與顯影劑輔助最終數(shù)據(jù)結(jié)果的根本差異。
 
原文:A Diffusion MRI Tractography Connectome of the Mouse Brain and Comparison with Neuronal Tracer Data
Doi: https:/// 10.1093/cercor/bhv121

7,、Schizophrenia Bulletin:催產(chǎn)素增強(qiáng)與精神分裂癥陰性癥狀相關(guān)的杏仁核回路

陰性癥狀是精神分裂癥(SZ)職業(yè)和社會(huì)缺陷的核心因素,,然而可用的抗精神病藥物通常不能減少這些癥狀。鑒于催產(chǎn)素(OT)在杏仁核參與的復(fù)雜社會(huì)行為中的作用,,它是一種很有前途的治療陰性癥狀的藥物,,Samantha V. Abram等人就OT對(duì)于SZ病人的杏仁核回路的作用進(jìn)行了深入研究。在樣本1中,,采用雙盲,、安慰劑對(duì)照、交叉設(shè)計(jì),,使用全腦校正方法,,測(cè)試單劑量鼻內(nèi)OT對(duì)SZ組和健康對(duì)照(HC)杏仁核靜息狀態(tài)功能連接(rsFC)的影響確定了OT調(diào)節(jié)SZ杏仁核rsFC的區(qū)域;評(píng)估SZOT影響的回路相對(duì)于使用安慰劑的HC組是否異常,;SZ杏仁核與左側(cè)顳中回,、顳上溝和角回(MTG/STS/AngG)的rsFCHC高;此外,,與安慰劑組的HC相比,,SZ在該回路中具有低連通性;較為嚴(yán)重的陰性癥狀與安慰劑組杏仁核與左側(cè)MTG/STS/AngG連接減少和OT誘導(dǎo)的連接增加有關(guān),。
這些數(shù)據(jù)表明,,杏仁核至左側(cè)MTG/STS/AngG回路的功能連接異常會(huì)導(dǎo)致精分患者的陰性癥狀,而鼻內(nèi)OT可以使回路的功能連接正?;?。
 
原文:Oxytocin Enhances an Amygdala Circuit Associated With Negative Symptoms in Schizophrenia: A Single-Dose, Placebo-Controlled, Crossover, Randomized Control Trial
doi:10.1093/schbul/sbz091

8、SCIENCE TRANSLATIONAL MEDICINE:阿爾茲海默的縱向萎縮與基線tau-PET的強(qiáng)度和分布有關(guān),。

β-淀粉樣蛋白斑塊和tau-containing神經(jīng)元纖維纏結(jié)是AD的兩個(gè)神經(jīng)病理學(xué)特征,。這兩個(gè)特征都可以通過(guò)PET示蹤劑在體內(nèi)顯示,為研究疾病機(jī)制和改善患者的診斷和預(yù)后評(píng)估提供了新的機(jī)會(huì),。本研究的主要目的測(cè)試β-淀粉樣蛋白和tau-PET能否預(yù)測(cè)AD早期患者未來(lái)的腦萎縮,。文章發(fā)表在Science Translational Medicine

采集36AD患者的3T結(jié)構(gòu)像,、FTP-PETPIB-PET,,15個(gè)月再次收集結(jié)構(gòu)像,。因數(shù)據(jù)質(zhì)量問(wèn)題,剔除4名被試的數(shù)據(jù),。對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,,并提取68個(gè)ROI的灰質(zhì)體積、皮層厚度和PIB,、FTP指標(biāo),。統(tǒng)計(jì)采用皮爾遜相關(guān)。

結(jié)果發(fā)現(xiàn):tau-PET的全局強(qiáng)度能預(yù)測(cè)大腦萎縮的速度,,β-淀粉樣蛋白并不能預(yù)測(cè),,并且萎縮的速度獨(dú)立于基線皮層厚度。進(jìn)一步的分析發(fā)現(xiàn),,tau-PET信號(hào)的特異性分布能很好地預(yù)測(cè)單個(gè)被試未來(lái)的腦萎縮區(qū)域,,基線tau-PET與隨后腦萎縮的相關(guān)在年輕的患者中表現(xiàn)尤為強(qiáng)烈。上述結(jié)果表明tau病理學(xué)是局部神經(jīng)退行性變的主要驅(qū)動(dòng)因素,,可幫助預(yù)測(cè)個(gè)體患者的進(jìn)展和設(shè)計(jì)未來(lái)的臨床試驗(yàn),。

原文:Prospective longitudinal atrophy in Alzheimer’s disease correlates with the intensity and topography of baseline tau-PET
DOI: 10.1126/scitranslmed.aau5732
9、NATURE COMMUNICATIONS:fMRI對(duì)自然場(chǎng)景的反應(yīng)預(yù)測(cè)眼球運(yùn)動(dòng)模式

世界的豐富性和復(fù)雜性給人類視覺(jué)系統(tǒng)帶來(lái)了豐富的感官信息,。為了集中資源,,選擇性注意將感知和認(rèn)知過(guò)程導(dǎo)向空間中的重要區(qū)域。長(zhǎng)期以來(lái),,眼動(dòng)跟蹤為顯性空間注意提供了負(fù)擔(dān)得起的、可靠的測(cè)量方法,,而且許多計(jì)算模型描述了引導(dǎo)空間注意所必需的表示和計(jì)算,。
大多數(shù)空間注意力模型的核心是空間優(yōu)先級(jí)映射,這種表示在空間中標(biāo)記區(qū)域以分配注意力,。這種空間優(yōu)先級(jí)算法準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)了人眼的運(yùn)動(dòng)模式,。最近,使用深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNNs)的空間注意模型已經(jīng)獲得了對(duì)人類眼球運(yùn)動(dòng)模式的最新預(yù)測(cè),。麻省理工學(xué)院顯著性基準(zhǔn)測(cè)試(http://saliency./results_mit300.html)根據(jù)空間注意力模型在預(yù)測(cè)眼動(dòng)模式方面的成功程度對(duì)它們進(jìn)行了排名,,排名前十的模型都依賴于某種深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)——CNN
   長(zhǎng)期以來(lái),,眼球追蹤一直被用來(lái)測(cè)量外顯空間注意力,,而空間注意力的計(jì)算模型則可以可靠地預(yù)測(cè)自然圖像的眼球運(yùn)動(dòng)。然而,,研究人員缺乏非侵入性地對(duì)眼球運(yùn)動(dòng)的大腦的空間表征進(jìn)行具體預(yù)測(cè)分析的技術(shù),。
因此,本文的研究者使用功能性磁共振成像(fMRI)來(lái)預(yù)測(cè)由自然場(chǎng)景引起的重建空間表征的眼球運(yùn)動(dòng)模式,。首先,,重建注視圖,直接從fMRI活動(dòng)預(yù)測(cè)眼球運(yùn)動(dòng)模式(通過(guò)構(gòu)建RSA表征矩陣實(shí)現(xiàn))。接下來(lái),,使用一個(gè)基于模型的解碼算法,,將fMRI活動(dòng)與深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)活動(dòng)相結(jié)合,重建空間優(yōu)先級(jí)地圖,,并以零鏡頭的方式預(yù)測(cè)眼球運(yùn)動(dòng),。
結(jié)果發(fā)現(xiàn),通過(guò)功能磁共振成像對(duì)自然場(chǎng)景的反應(yīng)可以預(yù)測(cè)人類的眼球運(yùn)動(dòng)模式,,提供證據(jù)證明場(chǎng)景和物體的視覺(jué)表征與預(yù)測(cè)眼球運(yùn)動(dòng)的神經(jīng)表征相對(duì)應(yīng),。作者的研究在大腦活動(dòng)、深層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型和行為之間發(fā)現(xiàn)了一種新的三向聯(lián)系,。
原文:Predicting eye movement patterns from fMRI responses to natural scenes

DOI: 10.1038/s41467-018-07471-9

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