1933年初,，在日本關東軍以優(yōu)勢兵力壓迫，彈盡援絕的情況下,，東北抗日義勇軍內(nèi)部發(fā)生了動搖和分化,。除一小部分義勇軍分散游擊，繼續(xù)抵抗外,，大部分都退入了蘇聯(lián)境內(nèi),。此時，先期撤入蘇聯(lián)的馬占山,、蘇炳文,、李杜等將領已坐飛機回到了國內(nèi)。

在蘇方的安排下,，除傷病員留在蘇聯(lián)繼續(xù)治療外,，其余的義勇軍官兵先后分8批，于1933年4月乘坐火車經(jīng)西伯利亞到達新疆的塔城,，包括家屬在內(nèi),，共有約3萬多人。

當?shù)谝慌x勇軍在黑龍江省抗日救國軍第十五旅旅長鄭潤成的率領下抵達新疆省會迪化時,，正趕上新疆爆發(fā)了“四一二政變”,。原新疆省主席兼新疆防務督辦金樹仁被參謀處處長陳中等人趕下臺。擁兵觀望的盛世才在陳中的邀請下率兵入城,，召開臨時會議商討善后事宜,。當時有人推舉鄭潤成為臨時督辦，鄭當場表示準備回內(nèi)陸繼續(xù)抗日,，不打算在新疆久留,，并請求新疆當局幫助解決運輸給養(yǎng)問題，以便早日東歸,。同時他還推舉盛世才為臨時督辦,，陳中等人雖有異議，但畏懼盛世才手握重兵,，只好表示擁護,。

盛世才

盛世才取得新疆政權(quán)后不久，名震西北的“尕司令”馬仲英率兵向迪化挺進,，盛世才急忙請東北抗日義勇軍協(xié)助抵御馬仲英,。雙方在紫泥泉子激戰(zhàn),，馬仲英戰(zhàn)敗，退到了鄯善和吐魯番等地,。盛世才借鞏固邊防為名,，在征得國民黨中央政府的同意后，將東北抗日義勇軍編為新疆部隊,。馬仲英得知義勇軍不愿久留新疆,，就向義勇軍表示愿意幫助解決運輸給養(yǎng)問題，以便促使義勇軍早日離開新疆,。不料此事被盛世才得知,，他借請客吃飯的機會，將義勇軍的鄭潤成,、蘇國,、李志等將領逮捕,，并于1939年秘密處死,。

馬仲英借盛世才內(nèi)部分裂以及東北抗日義勇軍軍心不安的時機，于1933年冬天再次進攻迪化,。盛世才采用分散隔離的辦法,，將部分義勇軍調(diào)入迪化城內(nèi)，將另一部分義勇軍留在城外,，抵御馬仲英的進攻,。雙方激戰(zhàn)了一個多月，義勇軍死傷慘重,，后來在蘇軍的援助下,，才打敗了馬仲英。

馬仲英

盛世才為了分散東北抗日義勇軍的力量,，就取消了義勇軍的師旅番號,，將義勇軍編為9個騎兵團、4個邊卡大隊,，分駐各地,。另編炮兵大隊、戰(zhàn)車大隊,、工兵隊,、通信隊和教導團，統(tǒng)歸盛世才直接指揮,。

在盛世才統(tǒng)治新疆的十年里,，東北抗日義勇軍在與馬仲英的戰(zhàn)斗中以及病老而死的不過5千多人，但被盛世才逮捕殺害的卻有1萬多人,。1934年盛世才整編時,，東北抗日義勇軍的官兵占80%,，到1944年盛世才離開新疆時，東北籍官兵就只占20%左右,，總共不超過5千人了,。1944年，東北義勇軍又被整編了一次,，東北籍軍官受到排擠,，有的被迫離職另謀生路，1946年有1500多名官兵更是被直接遣送回東北,。

1949年新疆和平解放后,，留在新疆的東北義勇軍官兵除一部分編入人民解放軍外，其余都被編入,。他們有的把在東北的家屬接到新疆,，有的就在新疆成家落戶，開始了新生活,。