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華南農(nóng)大最新論文:從馬來穿山甲中分離出穿山甲冠狀病毒

 秋水共藍(lán)天 2020-02-22

2017年8月,,廣西陸生野生動物救護(hù)研究與疫源疫病監(jiān)測中心接收了走私入境的34只穿山甲,其中有32只活體,,2個月后陸續(xù)發(fā)病和衰竭死亡,。圖片來源:南國早報

2月7日,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)在新聞發(fā)布會表示,,該校聯(lián)合攻關(guān)團(tuán)隊通過分析1000多份宏基因組樣品,,鎖定穿山甲為新型冠狀病毒的潛在中間宿主,但研究尚未發(fā)表,。

2月20日,,預(yù)印本網(wǎng)站bioRxiv(未經(jīng)同行評議)上發(fā)表了針對上述結(jié)論的最新論文,同時,,進(jìn)一步論證了穿山甲冠狀病毒與新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)高度相關(guān),,并且提出穿山甲具有充當(dāng)SARS-CoV-2中間宿主的潛力。

在這項研究中,,研究團(tuán)隊提出了SARS-CoV-2或起源于穿山甲冠狀病毒與蝙蝠樣冠狀病毒RaTG13的重組,,且針對穿山甲外周血的冠狀病毒抗體可以和SARS-CoV-2結(jié)合,再次提供了穿山甲有可能作為中間宿主的證據(jù),。

由于冠狀病毒在哺乳動物和鳥類中常見,,研究人員使用Blast search搜索了所有可用的哺乳動物和鳥類病毒、宏基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中類SARS的CoV序列,。最后在一組穿山甲病毒宏基因組中,,研究人員鑒定出了34個高度相關(guān)的重疊序列,因此,,研究人員將重點放在對穿山甲的SARSr-CoV研究上,。

圖片來源:bioRxiv

研究使用了2019年3月-12月被廣東省海關(guān)和林業(yè)部門沒收的29只死亡穿山甲的組織標(biāo)本,,其中4只中國穿山甲和25只馬來穿山甲,。這些穿山甲被送往野生動物救援中心時,,大都不活躍并嗚咽,盡管全力搶救但還是死亡,。組織標(biāo)本取自剛死亡的穿山甲的肺,、淋巴結(jié)、肝臟,、脾臟,、肌肉、腎臟和其它組織,,采取包括了序列分析,、抗體分析、結(jié)構(gòu)預(yù)測,、組織學(xué)和病理學(xué)分析,。

對8只馬來穿山甲的血漿樣本進(jìn)行分析時發(fā)現(xiàn),其中1個樣本發(fā)生反應(yīng),,血漿成效陽性,,這表明穿山甲自然感染了類似SARS-CoV-2的病毒。在對穿山甲肺部組織的檢測中發(fā)現(xiàn)了肺部間質(zhì)性炎癥和嚴(yán)重堵塞,,在肝臟,、淋巴、腎臟和其它組織中發(fā)現(xiàn)了炎癥細(xì)胞,,少量肺泡管和膀胱表皮發(fā)現(xiàn)了出血現(xiàn)象,。

圖片來源:bioRxiv

研究對9只穿山甲的肺進(jìn)行病毒識別,從穿山甲基因組中分離出編碼結(jié)構(gòu)蛋白S,、E,、M和N分別與SARS-CoV-2的氨基酸同源性為90.4%、100%,、98.2%和96.7%,。檢測出的數(shù)據(jù)顯示,尤其是S蛋白的受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域(RBD)和SARS-CoV-2的S蛋白RBD只差1個氨基酸,。

研究人員推斷,,這些數(shù)據(jù)表明,SARS-CoV-2可能起源于穿山甲冠狀樣病毒(Pangolin-CoV-like)和Bat-CoV-RaTG13病毒的重組,。

另外,,由于SARS-CoV和SARS-CoV-2的S蛋白已被證明在宿主細(xì)胞進(jìn)入時識別ACE2,研究人員對人類,、穿山甲和果子貍的ACE2進(jìn)行了比較分析,,發(fā)現(xiàn)SARS-CoV能夠識別人類和果子貍,,似乎能與穿山甲的ACE2結(jié)合。但SARS-CoV-2和穿山甲冠狀樣病毒的S蛋白能夠識別的只有人類和穿山甲的ACE2,。

研究人員表示,,由于穿山甲冠狀病毒的RBD與SARS-CoV-2幾乎完全相同,對人類ACE2具有很強(qiáng)的結(jié)合能力,,因此穿山甲冠狀病毒未來可能對公共健康構(gòu)成威脅,。穿山甲ACE2與S蛋白RBD的結(jié)合進(jìn)一步證實了穿山甲作為SARS-CoV-2中間宿主的潛力。

圖片來源:bioRxiv

該研究論文作者單位來自,,華南農(nóng)業(yè)大學(xué),、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)、廣州動物園,、廣東省野生動物救助中心,。

不過,這項研究有一點令人失望的是,,2月7日的新聞發(fā)布上,,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)曾表示:“通過對病毒的基因組分析,發(fā)現(xiàn)分離的病毒株與目前感染人的毒株序列相似度高達(dá)99%”,,可是目前看來華南農(nóng)大分離的病毒株和新冠病毒只在一部分基因上是高度類似,,在全基因組層面要比從云南蝙蝠上分離的RaTG13病毒離新冠病毒更遠(yuǎn)。

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