卓雨農(nóng)治療經(jīng)驗(yàn)豐富,，學(xué)術(shù)造詣深,。 他對(duì)婦科疾病論治，重在調(diào)氣血,，養(yǎng)肝腎,，和脾胃，三者有機(jī)聯(lián)系,，相互化生,。具體施治，重在調(diào)理,，要在補(bǔ)而不滯,，滋而不膩，溫而不燥,，清而不凝,，行而不破，澀不留瘀。 

如養(yǎng)血之中,，時(shí)佑丹參,、 益母草； 滋補(bǔ)肝腎諸方配山藥,、砂仁,、臺(tái)烏等品，疏肝解郁,。 理氣行滯,，習(xí)選香附、木香,、香櫞,、柴胡、郁金,、 金鈴炭,；活血化瘀常用當(dāng)歸、川芎,、丹參,、赤芍、桃仁,、牛膝,、蒲黃、五靈脂,、紅澤蘭,、 益母草之屬；溫經(jīng)散寒,，則以桂心,、臺(tái)烏、吳萸,、小茴,、 鹿角霜為首選藥。

他注意照顧婦女經(jīng)期,、孕期,、產(chǎn)期、哺乳期的生理特點(diǎn),，辨證用藥,。應(yīng)用古方，則師而不泥,。卓雨農(nóng)繼承家傳并經(jīng)自己長(zhǎng)期診療實(shí)踐的磨礪,，形成了藥味少,、用量輕、價(jià)低廉的特點(diǎn),。陳毅副總理曾經(jīng)當(dāng)面稱贊他：“你的中藥,，貧下中農(nóng)看得起！” 

1958年,，溫江縣發(fā)生流行疾病,，卓雨農(nóng)義不容辭參加滅病工作，在治療上獲得顯著成績(jī),。為了攻克疑重疾,，他承擔(dān)組建了腫瘤治療研究組的任務(wù)，在子宮癌,、卵巢囊腫的研究治療方面取得了成效,。

 弘揚(yáng)中醫(yī)，傳道授業(yè)著書立說(shuō)

卓雨農(nóng)對(duì)中醫(yī)教育事業(yè)滿懷熱忱,，為培養(yǎng)學(xué)生傾注了大量心血,，經(jīng)常熬更守夜，精編教材,，認(rèn)真?zhèn)湔n,。他常常為學(xué)生介紹學(xué)習(xí)讀物， 修訂學(xué)習(xí)計(jì)劃,，審閱作業(yè)醫(yī)案,，指導(dǎo)臨床疑難， 并對(duì)學(xué)生的生活,、健康關(guān)懷備至,。學(xué)生們無(wú)不稱贊他是傳道授業(yè)的好老師。

他主編的全國(guó)高等中醫(yī)院校試用教材《中醫(yī)婦科學(xué)》 (一,、 二版),，為中國(guó)高等中醫(yī)婦科學(xué)教材建設(shè)奠定了基礎(chǔ)。

他著的《中醫(yī)婦科治療學(xué)》(陶涵清補(bǔ)充修改),，1958年由四川人民出版社出版,， 從病種到證型，自制方,，習(xí)用方，都是他畢生經(jīng)驗(yàn)的凝結(jié),。書中所載他常用自制方劑155 首,，其間多有匠心獨(dú)運(yùn)之處。

《卓雨農(nóng)中醫(yī)婦科治療秘訣》經(jīng)卓老的同事和學(xué)生繼承修訂后,，已經(jīng)是第三次再版發(fā)行了,，該書記錄了卓雨農(nóng)一生的中醫(yī)婦科臨證經(jīng)驗(yàn),，文字簡(jiǎn)潔，通俗易懂,，使卓老生前寶貴的中醫(yī)婦科治療經(jīng)驗(yàn)得以傳承并惠及后學(xué)與患者,。