一站式Arraystar lncRNA芯片技術(shù)服務(wù)包含系統(tǒng)而詳細(xì)的lncRNA注釋,、子類分析等重要分析項(xiàng)目，這些信息有助于揭示lncRNAs復(fù)雜的生物學(xué)功能,。通過研究發(fā)現(xiàn),，lncRNAs在凋亡、分化,、發(fā)育等多種生物學(xué)過程以及人類疾病,，如癌癥、神經(jīng)系統(tǒng)疾病及心血管疾病中發(fā)揮重要功能,。針對上述研究報道的所有LncRNAs,，我們提供了全面的注釋便于交叉引用，幫助您深入了解lncRNAs的生物功能和分子機(jī)制,。

基因組結(jié)構(gòu)

     根據(jù)LncRNAs在基因組上相對于蛋白編碼基因的位置關(guān)系,，可以系統(tǒng)的將其分為 （1） Intergenic （LincRNA），（2） Intronic,，（3） Bidirectional,，（4） Sense-overlapping，（5） Antisense ，（6） Pseudogene這6種類型 （圖 1）,，這種位置關(guān)系對于推測lncRNA的功能具有很大幫助,，包括調(diào)控方式是順式（cis）還是反式（trans），調(diào)控層面是轉(zhuǎn)錄還是轉(zhuǎn)錄后,。

圖釋：上：lncRNAs分類及和臨近基因位置關(guān)系圖,。下：lncRNAs可能通過多種機(jī)制調(diào)控基因表達(dá)，比如招募染色質(zhì)修飾物/重塑,，即通過表觀修飾調(diào)控基因表達(dá),；通過增強(qiáng)子RNAs、核亞結(jié)構(gòu),、核質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn),、ceRNA機(jī)制或者mRNAs穩(wěn)定和翻譯，在轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后水平順式或者反式發(fā)揮調(diào)控功能,。

高度保守的LncRNAs

       基因組中高保守區(qū)域（UCR） 或高保守非編碼元件（UCNEs） 轉(zhuǎn)錄出來的lncRNAs可能具有重要的生物學(xué)功能。在其他物種中與人類基因組結(jié)構(gòu)相同的lncRNAs（即使只有中度同源）也會被收錄,。因?yàn)榕c全序列保守性相比,，基因組結(jié)構(gòu)與基因調(diào)控的關(guān)系更加密切[1]。

組織特異性lncRNAs

       LncRNAs呈現(xiàn)出嚴(yán)格的組織或時序特異性,，可能與其發(fā)揮的功能密切相關(guān)[1],。其中特別標(biāo)示出6,059個與細(xì)胞譜系或癌癥相關(guān)的lncRNAs分子[2]。

疾病相關(guān) lncRNAs

       包含了LncRNADisease數(shù)據(jù)庫中收錄的已知與疾病相關(guān)的lncRNAs [3],。

疾病SNP相關(guān)lncRNAs

       覆蓋帶有疾病易感位點(diǎn)的LncRNAs ,，可能與疾病發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。

在生物學(xué)功能中LncRNAs和mRNA的共表達(dá)

      收錄了與生物學(xué)過程或功能基因集相關(guān)的LncRNAs （例如,，血管生成,、缺氧、代謝,、增殖,、細(xì)胞周期、細(xì)胞黏附,、DNA損傷修復(fù)） [2],。

癌癥相關(guān)LncRNAs

        LncRNAs可以在不同類型癌癥中發(fā)揮作用， 通過上千例癌癥樣本中l(wèi)nRNA的大范圍研究表明,，其表達(dá)量發(fā)生了癌癥特異性改變,。 [4-5].

基因間超長鏈非編碼RNAs (vlincRNA)

      長度從50 kb到1 Mb，作用涉及多種生物學(xué)過程,，例如多能性,、癌癥、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞周期以及細(xì)胞衰老 [6, 7-8].

其他類型

      例如,，缺氧誘導(dǎo)型非編碼高保守轉(zhuǎn)錄本（HINCUTs） [9],，壓力誘導(dǎo)型長鏈非編碼轉(zhuǎn)錄本 （LSINCTs） [10]。

參考文獻(xiàn)

1. Cabili, M.N. et al. （2011） Genes Dev 25（18）:1915-27[PMID: 21890647]

2. Iyer M.K. et al. （2015） Nat. Genet. 47（3）:199-208 [PMID: 25599403]

3. Chen G. et al. （2013） Nucleic Acids Res. 41（Database issue）:D983-6 [PMID: 23175614]

4. St Laurent G. et al. （2015） Trends Genet. 31（5）:239-51 [PMID: 25869999]

5. Yan X. et al. （2015） Cancer Cell 28（4）:529-40 [PMID: 26461095]

6. Clark M.B. et al. （2015） Nat. Methods 12（4）:339-42 [PMID: 25751143]

7. Hackermuller J. et al. （2014） Genome Biol. 15（3）:R48 [PMID: 24594072]

8. St Laurent G. et al. （2013） Genome Biol. 14（7）:R73 [PMID: 23876380]

9. Ferdin J. et al. （2013） Cell Death Differ. 20（12）:675-87 [PMID: 24037088]

10. Silva J.M. et al. （2010） Genomics 95（6）:355-62[PMID: 20214974]