本文首發(fā)于微信公眾號“生信補給站”,，

學習了ggplot2|詳解八大基本繪圖要素后,，就可以根據(jù)自己的需要繪制圖形,。前面也給出了一些ggplot2繪制生信分析基本圖形的例子

pheatmap|暴雨暫歇，“熱圖”來襲?。,。?/a>

ggplot2-plotly|讓你的火山圖“活”過來

ggplot2|擴展包從0開始繪制雷達圖

ggplot2| 繪制KEGG氣泡圖

ggplot2|繪制GO富集柱形圖

ggplot2|從0開始繪制PCA圖

ggplot2|ggpubr進行“paper”組圖合并

本文將介紹一些對legend的細節(jié)操作來完成圖形的“精雕細琢”,。

載入R包和數(shù)據(jù)

mtcars數(shù)據(jù)集作為示例數(shù)據(jù)

library(ggplot2)#查看數(shù)據(jù)集head(mtcars)                   
# 將cyl gear變量轉為因子變量mtcars$cyl<-as.factor(mtcars$cyl)
mtcars$gear <- as.factor(mtcars$gear)

繪制基本圖形

#gear為橫坐標,，對mpg做箱線圖，gear填充顏色
p <- ggplot(mtcars, aes(x=gear, y=mpg, fill=gear)) + geom_boxplot()
p

設置 legend position

使用 theme() 參數(shù)設置legend位置

# 可選參數(shù)為“l(fā)eft”,“top”, “right”, “bottom”.
p + theme(legend.position="bottom")

# 數(shù)值向量 c(x,y) 調控位置
p + theme(legend.position = c(0.8, 0.2))

更改legend 的title ,， font styles

# legend titlep + theme(legend.title = element_text(colour="blue", size=10,                                     face="bold"))# legend labelsp + theme(legend.text = element_text(colour="blue", size=10,                                    face="bold"))

設置 legend 背景色

#fill設置legend box背景色,，colour設置邊框顏色p + theme(legend.background = element_rect(fill="lightblue",                                 size=0.5, linetype="solid",                                 
    colour ="darkblue"))

設置legend items順序

scale_x_discrete自定義設置順序

p + scale_x_discrete(limits=c("3", "5", "4"))

去除legend

# 去除legend titlep + theme(legend.title = element_blank())# 去除整個legendp + theme(legend.position='none')

guides 設置specific aesthetic

使用guides()參數(shù)來設置或移除特定的美學映射(fill, color, size, shape等).
因子變量cyl和gear映射為點圖的顏色和形狀，qsec決定點的大小,。

p <- ggplot(data = mtcars,   aes(x=mpg, y=wt, color=cyl, size=qsec, shape=gear))+   geom_point()# 不設定specific aesthetic時候p

設置多個legend的位置

# 更改 legend positionp +theme(legend.position="bottom")# Horizontal legend boxp +theme(legend.position="bottom", legend.box = "")

設置multiple guides順序

使用 guide_legend() 參數(shù)：

p+guides(color = guide_legend(order=1),        size = guide_legend(order=2),        shape = guide_legend(order=3))

去除particular aesthetic

通過設置FALSE,，可不展示對應的legend

p+guides(color = FALSE)

也可以使用scale_xx.函數(shù)去掉特定的legend

# Remove legend for the point shapep+scale_shape(guide=FALSE)# Remove legend for sizep +scale_size(guide=FALSE)# Remove legend for colorp + scale_color_manual(values=c('#999999','#E69F00','#56B4E9'),                      guide=FALSE)

通過以上參數(shù)的設置即完成對所繪制圖形的legend的細節(jié)修改，得到自己所需要的圖形,。

更多關于生信,，R，Python的內容請關注小號“生信補給站”,，謝謝 ,！