鼻咽癌是我國(guó)高發(fā)惡性腫瘤之一,。在南方地區(qū),每年發(fā)病率可達(dá)20~40例/10萬(wàn)人,,并且該地區(qū)的鼻咽癌病例常與EB病毒感染有關(guān),。此外,EB病毒還與其他癌癥類型有關(guān),,也經(jīng)常在無(wú)癌人群中發(fā)現(xiàn),。EB病毒基因組變異在鼻咽癌發(fā)生發(fā)展中的重要作用以及其在我國(guó)南方流行的狀態(tài),一直未得到充分的研究探討,。目前,,部分研究人員已經(jīng)開(kāi)始梳理分析EB病毒中的特定基因突變,這些突變對(duì)我國(guó)南方鼻咽癌,,尤其是鼻癌的發(fā)生構(gòu)成了最大的風(fēng)險(xiǎn),。 6月17日,在線發(fā)表了我國(guó)南方鼻咽癌及EB病毒研究成果,。研究人員通過(guò)大規(guī)?;蚪M測(cè)序和兩階段關(guān)聯(lián)研究,發(fā)現(xiàn)了EB病毒分離株中BALF2基因的兩個(gè)非同義變異體,,并與鼻咽癌風(fēng)險(xiǎn)密切相關(guān),。研究結(jié)果顯示,這些變異體的累積效應(yīng)占我國(guó)南方鼻咽癌總體風(fēng)險(xiǎn)的83%,。此外,,風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)變異的系統(tǒng)發(fā)育分析揭示了EB病毒高危亞型在亞洲的獨(dú)特起源,以及鼻咽癌流行地區(qū)的克隆擴(kuò)增情況,。該研究結(jié)果為我國(guó)南方EB病毒介導(dǎo)的鼻咽癌研究提供了新的見(jiàn)解,,有助于鼻咽癌高危人群的識(shí)別與預(yù)防,。 該研究由中山大學(xué)腫瘤防治中心、中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所以及新加坡,、美國(guó),、瑞典等研究機(jī)構(gòu)合作完成。該研究共對(duì)近1,300例病例和對(duì)照組的EB病毒基因組進(jìn)行了兩階段關(guān)聯(lián)研究,。其中,,研究團(tuán)隊(duì)利用靶向捕獲測(cè)序技術(shù)檢測(cè)表征了分離自腫瘤、唾液和血漿的270個(gè)EB病毒分離株,,這些樣本來(lái)自我國(guó)鼻咽癌患者和健康個(gè)體,。 此前研究已經(jīng)對(duì)可能使我國(guó)南方地區(qū)個(gè)體易患EB病毒相關(guān)鼻咽癌的宿主變異(host variants)和位點(diǎn)進(jìn)行了分析。為補(bǔ)充已有研究,,該研究團(tuán)隊(duì)對(duì)來(lái)自215位鼻咽癌患者的血液,、唾液或腫瘤樣本215個(gè)EB病毒分離株,54位來(lái)自健康對(duì)照個(gè)體唾液的EB病毒分離株進(jìn)行了全基因組測(cè)序,。同時(shí),,研究團(tuán)隊(duì)還對(duì)來(lái)自25位鼻咽癌患者的腫瘤和唾液樣本中的EB病毒進(jìn)行了測(cè)序,以了解個(gè)體內(nèi)病毒變異情況,。 圖:156例鼻咽癌病例和47例對(duì)照中EB病毒變異體的全基因組關(guān)聯(lián)分析,。a. 全基因組P值曼哈頓圖;b. 關(guān)聯(lián)后驗(yàn)概率的區(qū)域圖,;c. EB病毒基因示意圖,。 在獲得的EB病毒基因組中,研究人員追蹤了約8,500種EB病毒變異體,,包括8,015個(gè)SNP和454個(gè)小片段插入和缺失,。根據(jù)這些變異體,以廣東和廣西兩省的156例鼻咽癌病例和47例對(duì)照為研究對(duì)象,,研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)展了第一階段的隊(duì)列研究,。 研究結(jié)果顯示,BALF2變異體與鼻咽癌在全基因組范圍內(nèi)有顯著關(guān)聯(lián),。研究人員觀察到,,攜帶SNP 162476_C和163364_T風(fēng)險(xiǎn)變體的病毒集中于亞洲地區(qū),而SNP 162215_C的風(fēng)險(xiǎn)變體具有更廣泛的分布,。在亞洲群體中,,SNP 162476_C和163364_T富集于鼻咽癌患者,。隨后,,通過(guò)對(duì)來(lái)自483例病例和605例對(duì)照的EB病毒分離株進(jìn)行驗(yàn)證檢測(cè),研究人員證實(shí)了這一研究結(jié)果,。 研究人員分析發(fā)現(xiàn),,攜帶EB病毒BALF2基因兩個(gè)非同義變異體的個(gè)體患鼻咽癌風(fēng)險(xiǎn)增加了6倍,,遠(yuǎn)超過(guò)任何其他已知的風(fēng)險(xiǎn)因素。這兩個(gè)非同義變異體可以解釋我國(guó)南方83%的鼻咽癌總體風(fēng)險(xiǎn),。他們認(rèn)為,,BALF2基因編碼的單鏈DNA結(jié)合蛋白參與EB病毒感染和DNA復(fù)制早期裂解階段,支持了EB病毒裂解周期在鼻咽癌發(fā)展中起重要作用的觀點(diǎn),。 此外,,通過(guò)對(duì)鼻咽癌相關(guān)BALF2基因座的精細(xì)定位分析,研究團(tuán)隊(duì)對(duì)該研究和全球EB病毒分離株進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育分析,。研究發(fā)現(xiàn)了高風(fēng)險(xiǎn)EB病毒亞型,,并對(duì)鼻咽癌的總體風(fēng)險(xiǎn)以及鼻咽癌在我國(guó)南方的獨(dú)特流行趨勢(shì)有著顯著作用。同時(shí),,該研究還發(fā)現(xiàn),,兩種BALF2基因變異體攜帶者僅在亞洲被發(fā)現(xiàn),揭示了鼻咽癌相關(guān)EB病毒變異體的亞洲起源,。 EB病毒感染在世界范圍內(nèi)隨處可見(jiàn),,并與包括鼻咽癌在內(nèi)的多種癌癥有關(guān)。該研究發(fā)現(xiàn)的鼻咽癌相關(guān)的高風(fēng)險(xiǎn)EB病毒亞型是迄今為止與鼻咽癌發(fā)生相關(guān)的最大風(fēng)險(xiǎn)因素,。高風(fēng)險(xiǎn)EB病毒變異的發(fā)現(xiàn)對(duì)減輕鼻咽癌的公共衛(wèi)生工作負(fù)擔(dān)具有重要意義,,特別是在我國(guó)南方地區(qū)。通過(guò)檢測(cè)特定EB病毒變異體可以識(shí)別高風(fēng)險(xiǎn)個(gè)體,,有針對(duì)性地實(shí)施常規(guī)臨床監(jiān)測(cè)可以及早發(fā)現(xiàn)鼻咽癌,。此外,開(kāi)發(fā)針對(duì)高鼻咽癌風(fēng)險(xiǎn)EB病毒的疫苗進(jìn)行一級(jí)預(yù)防,,或有助于減少我國(guó)南方地區(qū)鼻咽癌的發(fā)生,。 參考資料: 1. Genome sequencing analysis identifies Epstein–Barr virus subtypes associated with high risk of nasopharyngeal carcinoma 2.Risky Epstein-Barr Virus Variants Found in South China Nasopharyngeal Cancer Cases · END · |
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