從源頭上看,，中醫(yī)有岐黃學(xué)派和神農(nóng)學(xué)派之分。《黃帝內(nèi)經(jīng)》是岐黃醫(yī)學(xué)的代表,，其大旨言天地之至理,，論生命的緣由根本，講治身奉生之大道,，強(qiáng)調(diào)治病之大藥就在人身,、人心。

《神農(nóng)本草經(jīng)》是神農(nóng)醫(yī)學(xué)的代表,，講得天地所偏之氣的藥物,，性味各有不同，所謂治療，是以藥物性味之偏矯正病人身體陰陽之偏,。

仲景天縱奇才,，將岐黃醫(yī)學(xué)與神農(nóng)醫(yī)學(xué)相結(jié)合，采《黃帝內(nèi)經(jīng)》之理,，融《神農(nóng)本草經(jīng)》之藥物,，治驗(yàn)于人身，“撰用《素問》《九卷》《八十一難》《陰陽大論》《胎臚藥錄》”,?！秱摗分腥幦柪碚擉w系源于《黃帝內(nèi)經(jīng)》，《傷寒論》中主要方劑則源于神農(nóng)派的《伊尹湯液》,，如晉代皇甫謐《針灸甲乙經(jīng)·序》所言： “伊尹以元圣之才,，撰用《神農(nóng)本草》以為《湯液》。仲景論廣伊尹《湯液》為數(shù)十卷,，用之多驗(yàn),。”

《黃帝內(nèi)經(jīng)》為中醫(yī)之源,、之本,。《黃帝內(nèi)經(jīng)》分上,、下兩卷,，上卷《素問》，下卷《靈樞》,?！秲?nèi)經(jīng)》言理，罕言方治,，《內(nèi)經(jīng)》所言之理,，乃治身奉生之至理，為生命根本之道,。生命本于天,，起于天道而終于人道，天道,、地道,、人道皆備于人之一身?！秲?nèi)經(jīng)》前九篇尤詳言天人之相應(yīng),、生氣之通天、生理之規(guī)律,、病理之變化，生命之一切皆依乎天地之理而變動(dòng)。

生命的特征為功能氣化,，功能氣化有體系,、規(guī)律和表達(dá)即成結(jié)構(gòu)，人誠之以有氣化結(jié)構(gòu)理論,。人形質(zhì)與功能兼?zhèn)?，有形質(zhì)則成解剖結(jié)構(gòu)，有功能氣化則成氣

化結(jié)構(gòu),，二者可分不可離,，互為根本，共成一體,。氣化結(jié)構(gòu)是生命狀態(tài)下特有的結(jié)構(gòu)，其不離解剖形質(zhì)而又超越解剖形質(zhì),，氣化結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性,、廣泛性、根本性遠(yuǎn)遠(yuǎn)超越解剖結(jié)構(gòu),。只有在生命的框架下,，從功能氣化的角度出發(fā)，才能明了天人合一,、天人相應(yīng),，才能覺悟“通天下一氣耳”，也只有從功能氣化的角度看人體,、看生命才是中醫(yī),。

中醫(yī)研究的對(duì)象是生命，生命根于天,，依乎天地模式而變動(dòng),，一氣流轉(zhuǎn)而分陰陽，四象,、五行,、六節(jié)乃陰陽兩分三分而成天道、地道,、人道不同的體現(xiàn),。醫(yī)

圣張仲景借用三陰三陽以經(jīng)緯疾病之分類與診治，然《傷寒論》言方證,、言治者多而言理者少,，由于仲景在書中未對(duì)三陰三陽以及諸方證治法的根據(jù)、背景,、由來進(jìn)行解釋,，以至后世醫(yī)家迷茫于中醫(yī)之生理病理,，多淪陷為“但見一證便是”的臨床工匠。

后世醫(yī)家喜治而不喜明理久已,，更有甚者,，提出廢《內(nèi)經(jīng)》而獨(dú)尊《傷寒論》，或廢醫(yī)存藥,，豈知理之不明,，用焉能準(zhǔn)確與變通?！胺蜃怨磐ㄌ煺呱尽?，

《內(nèi)經(jīng)》認(rèn)識(shí)到人生理之機(jī)要、病理之變化皆在于人氣本天,、通天,、應(yīng)天，如《素問·病能論》所言：“上經(jīng)者,，言氣之通天也,；下經(jīng)者，言病之變化也,?！毖詺庵咎臁⑼ㄌ?、應(yīng)天者,，指天地與人同構(gòu)，乃一氣之周流,，人氣之升降沉浮隨天運(yùn)而變動(dòng),；言病之變化者，人妄作,，與天地不能同步而失偏,。至于治病，乃糾偏之道,，復(fù)與天地準(zhǔn)而精神歸于道一是也,。

對(duì)醫(yī)者而言，首先要明經(jīng)絡(luò)臟腑乃天地之氣所化,，經(jīng)絡(luò)臟腑的根本屬性為天地之性,，天地立，其后才可定陰陽之性,，陰陽之性明,，方能知?dú)鈾C(jī)升降沉浮之要，然后才有臟氣,、經(jīng)氣流轉(zhuǎn)模式的不同,，在此指導(dǎo)下才可討論人生理之規(guī)律,、病理之變化，才可言治而為中醫(yī),。

《黃帝內(nèi)經(jīng)》言理不言治,，然其中有大治,；《傷寒雜病論》言治不言理,，其中藏至理。二者一體一用,，互證互信,，不可分割。

然從《內(nèi)經(jīng)》到《傷寒論》,，已從源到流矣,，從以天地為本，到以陰陽為統(tǒng),；從以天觀人,，到以人觀天；從詳言針術(shù),，以人身為大藥,，到假借藥物，以外調(diào)身,。藥物治人似愈確鑿,，實(shí)離道本彌遠(yuǎn)矣。