今天是第1060期日報(bào),。

Nature子刊：全球數(shù)據(jù)揭示結(jié)直腸癌特征菌群

Nature Medicine[IF:32.621]

① 納入來自歐美,、東亞地區(qū)的8項(xiàng)人群對照研究共計(jì)768參與者,，發(fā)現(xiàn)在結(jié)直腸癌（CRC）患者的糞便菌群中有29個(gè)菌種豐度升高,；② 來自單個(gè)CRC研究的特征菌群，同樣可預(yù)測其他研究中的CRC患者,；③ CRC患者的糞便菌群基因組中,，分解蛋白質(zhì)和粘蛋白的基因較多，降解碳水化合物的基因減少,；④ CRC患者體內(nèi)的次級膽汁酸產(chǎn)量可能增加,，CRC相關(guān)的腸道菌群變化很可能與高脂、高肉類的飲食相關(guān),；⑤ CRC相關(guān)的特征菌群及其功能,，有望在全球用于CRC診斷,。

Meta-analysis of fecal metagenomes reveals global microbial signatures that are specific for colorectal cancer
04-01, doi: 10.1038/s41591-019-0406-6

【主編評語】《Nature Medicine》近期發(fā)表一項(xiàng)涵蓋全球多個(gè)地區(qū)結(jié)直腸癌研究的薈萃分析，發(fā)現(xiàn)了29個(gè)具有全球代表性的特征腸道菌群,，以及與結(jié)直腸癌相關(guān)的菌群代謝特點(diǎn),，這些宏基因組信息有望用于全球范圍內(nèi)的結(jié)直腸癌診斷。（@小腸君）

Nature子刊：跨越人群的大腸癌腸道菌群特征和診斷標(biāo)志物

Nature Medicine[IF:32.621]

① 對7個(gè)隊(duì)列的數(shù)據(jù)集進(jìn)行薈萃分析,，尋找通用的結(jié)直腸癌（CRC）腸道菌群標(biāo)志物,，并在2個(gè)額外隊(duì)列中進(jìn)行驗(yàn)證，共涉及969個(gè)糞便宏基因組,；② CRC腸道菌群比對照具有更高的豐富度,，口腔菌種的富集是部分原因；③ 菌群功能中,，糖異生以及腐敗和發(fā)酵通路與CRC相關(guān),，而水蘇糖和淀粉降解通路與對照相關(guān)；④ 用機(jī)器學(xué)習(xí)鑒定出含16個(gè)菌群物種的最小集合,，可較準(zhǔn)確的區(qū)分CRC與對照（AUC>0.8）,；⑤ 菌群基因中，膽堿三甲胺裂解酶基因（cutC）在CRC中富集,。

Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation
04-01, doi: 10.1038/s41591-019-0405-7

【主編評語】不少研究報(bào)道了腸道菌群與結(jié)直腸癌（CRC）之間的密切關(guān)系,，但在不同隊(duì)列和人群之間是否存在通用的菌群診斷標(biāo)志物，仍需進(jìn)一步探究,?！禢ature Medicine》剛剛上線的一項(xiàng)研究，對涉及5個(gè)國家人群的已報(bào)道的隊(duì)列和意大利的2個(gè)新隊(duì)列的糞便宏基因組數(shù)據(jù)集,，進(jìn)行了薈萃分析,，鑒定出在不同人群間共通的CRC相關(guān)腸道菌群組成和功能特征，構(gòu)建了含16個(gè)物種的CRC疾病預(yù)測模型,，并在兩個(gè)額外的隊(duì)列數(shù)據(jù)中得到驗(yàn)證,。該研究再次證實(shí)了，不同人群中的CRC菌群特征存在異質(zhì)性,，但綜合分析多個(gè)隊(duì)列獲得的菌群標(biāo)志物,，能提高診斷準(zhǔn)確性。這些發(fā)現(xiàn)對于用菌群標(biāo)志物進(jìn)行疾病診斷,，以及研究菌群成員在CRC中的潛在作用,，均有參考價(jià)值。（@李丹宜）

Science子刊：納米疫苗可通過免疫調(diào)節(jié)提高免疫原性

Science advances[IF:11.511]

① TLR5敲除小鼠感知腸道菌群的能力受影響,，且導(dǎo)致代謝綜合征,，聚乳酸-羥基乙酸（PLGA）納米疫苗可進(jìn)一步改變腸道菌群；② 小鼠TLR5的缺失限制了PLGA納米疫苗向淋巴組織的轉(zhuǎn)運(yùn)，減少其引起的生發(fā)中心免疫應(yīng)答,，從而限制體液免疫應(yīng)答,；③ 抗生素處理證實(shí)腸道菌群失調(diào)導(dǎo)致了交叉的疫苗應(yīng)答；④ Pyr-pHEMA納米凝膠能夠通過TLR2介導(dǎo)體液免疫,，從而提高免疫原性,；⑤ 先進(jìn)的納米材料可在腸道菌群失調(diào)介導(dǎo)的代謝綜合征下起到免疫調(diào)節(jié)作用。

Immunomodulatory nanogels overcome restricted immunity in a murine model of gut microbiome–mediated metabolic syndrome
03-27, doi: 10.1126/sciadv.aav9788

【主編評語】《Science advances》上發(fā)表的一項(xiàng)最新研究,，發(fā)現(xiàn)納米疫苗可通過其免疫調(diào)節(jié)活性,，在缺失TLR5且腸道菌群失調(diào)的小鼠代謝綜合征模型中激活TLR2通路以增強(qiáng)其免疫原性。（@沈志勛）

Nature子刊：可能驅(qū)動(dòng)多種自身免疫疾病的CD4+ T細(xì)胞

Nature Medicine[IF:32.621]

① 在乳糜瀉患者的腸道中,，鑒定出一群有著特殊表型的谷蛋白特異性CD4+ T細(xì)胞,；② 這群CD4+ T細(xì)胞表達(dá)CXCR3、CD38,、CD161,、CD28、HLA-DR,、OX40等活化標(biāo)志物,，并表達(dá)CD39與PD-1，而不表達(dá)KLRG1,；③ 這群CD4+ T細(xì)胞在腸道中不表達(dá)增值標(biāo)志物Ki-67,，但在血液中表達(dá)，并且在體內(nèi)并無調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的活性,；④ 在7/8的乳糜瀉患者,、8/10的系統(tǒng)性硬化患者及4/10的系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者體內(nèi)，有著相似表型的CD4+ T細(xì)胞數(shù)量顯著增加,。

Distinct phenotype of CD4+ T cells driving celiac disease identified in multiple autoimmune conditions
03-25, doi: 10.1038/s41591-019-0403-9

【主編評語】《Nature Medicine》上發(fā)表的一項(xiàng)最新研究,，在乳糜瀉患者的腸道內(nèi)鑒定出了一群有著特殊表型的谷蛋白特異性CD4+ T細(xì)胞，有趣的是,，在一些其它的自身免疫疾病患者體內(nèi),，也有一群相似表型的CD4+ T細(xì)胞的數(shù)量顯著增加。結(jié)果提示,，這群罕見的CD4+ T細(xì)胞可能驅(qū)動(dòng)了多種自身免疫疾病的發(fā)生,。（@沈志勛）

BMJ：42萬人數(shù)據(jù)揭示BMI與死亡率的因果性關(guān)聯(lián)

British Medical Journal[IF:23.259]

① 納入HUNT和英國生物庫兩個(gè)隊(duì)列中42萬人的隨訪數(shù)據(jù)，分析BMI與死亡率的因果關(guān)聯(lián),；② 線性孟德爾隨機(jī)分析表明,，遺傳預(yù)測的BMI與死亡率之間總體呈正相關(guān)：BMI每增加1單位，則超重者和肥胖者的死亡風(fēng)險(xiǎn)分別增加5%和增加9%,，而體重過輕者和低正常體重者的死亡風(fēng)險(xiǎn)分別減少34%和14%；③ 非線性孟德爾隨機(jī)分析表明，遺傳預(yù)測的BMI與死亡率之間存在J型關(guān)系,，BMI在22-25時(shí)死亡風(fēng)險(xiǎn)最低,，但體重過輕導(dǎo)致死亡率增加的風(fēng)險(xiǎn)只在吸煙人群中明顯存在。

Body mass index and all cause mortality in HUNT and UK Biobank studies: linear and non-linear mendelian randomisation analyses
03-26, doi: 10.1136/bmj.l1042

【主編評語】BMI與全因死亡率間存在J型關(guān)聯(lián),，即體重過輕和過重都與死亡風(fēng)險(xiǎn)上升相關(guān),。《BMJ》近期發(fā)表的大型隊(duì)列研究,，用孟德爾隨機(jī)化方法對挪威和英國的兩個(gè)大型隊(duì)列數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,，在人群層面揭示了BMI與死亡風(fēng)險(xiǎn)間的潛在因果性關(guān)聯(lián)，并闡釋了性別,、吸煙狀態(tài),、年齡、死亡原因等因素對二者關(guān)系曲線的影響,，對于制定相關(guān)公共健康政策有參考意義,。（@李丹宜）

Nature Reviews：遠(yuǎn)離西式飲食，規(guī)避代謝炎癥

Nature Reviews Immunology[IF:41.982]

① 與生活方式相關(guān)的疾?。ㄈ鏘I型糖尿病,、肥胖癥和慢性肝病等）有發(fā)展為流行病的趨勢，與長期食用西式飲食有關(guān),；② 西式飲食影響腸道菌群結(jié)構(gòu)和代謝,，破壞腸屏障穩(wěn)態(tài)，引起局部和全身炎癥反應(yīng),；③ 西式飲食引起的炎癥反應(yīng),，會(huì)對固有免疫細(xì)胞的代謝和表觀遺傳特點(diǎn)產(chǎn)生長期影響，引起慢性代謝性炎癥,；④ 飲食引起的長期炎癥反應(yīng)影響人壽命,，但這一風(fēng)險(xiǎn)可被有效規(guī)避；⑤ 需重視由飲食等生活方式導(dǎo)致的代謝性炎癥,，采取措施使公眾免受不健康飲食影響,。

The Western lifestyle has lasting effects on metaflammation
03-25, doi: 10.1038/s41577-019-0156-1

【主編評語】《Nature Reviews Immunology》近期發(fā)表評論，總結(jié)了近年來飲食方式和免疫相關(guān)的研究,，指出長期西式飲食為代表的非健康生活方式會(huì)導(dǎo)致慢性代謝性炎癥,，影響人體健康和壽命。本文列舉的研究對于指導(dǎo)公眾建立健康生活方式具有重要參考價(jià)值,。（@小腸君）

Nature子刊：肝臟巨噬細(xì)胞通過非炎性因子調(diào)節(jié)代謝

Nature Metabolism[IF:N/A]

① 在肥胖誘導(dǎo)的胰島素耐受動(dòng)物模型及人體中,，肝臟巨噬細(xì)胞（LM）沒有經(jīng)歷從抗炎到促炎的表型轉(zhuǎn)換；② LM產(chǎn)生胰島素樣生長因子結(jié)合蛋白7（IGFBP7）等非炎性因子,，直接調(diào)節(jié)肝臟代謝,；③ IGFBP7與胰島素受體結(jié)合，通過激活細(xì)胞外信號調(diào)節(jié)激酶（ERK）通路，誘導(dǎo)脂肪生成和糖異生,，胰島素耐受肥胖病人的受體結(jié)合能力更強(qiáng),；④ LM導(dǎo)致胰島素耐受且不依賴于炎癥狀態(tài)，巨噬細(xì)胞產(chǎn)生的非炎性因子是調(diào)節(jié)代謝的基礎(chǔ),，可能成為治療代謝性疾病的新靶點(diǎn),。

Liver macrophages regulate systemic metabolism through non-inflammatory factors
03-25, doi: 10.1038/s42255-019-0044-9

【主編評語】《Nature Metabolism》上發(fā)表的一項(xiàng)最新研究，發(fā)現(xiàn)在肥胖誘導(dǎo)的胰島素耐受中,，肝臟巨噬細(xì)胞并未經(jīng)歷從抗炎到促炎的表型轉(zhuǎn)換,，而是直接通過產(chǎn)生非炎性因子調(diào)節(jié)肝臟代謝，促進(jìn)脂肪生成及糖異生,。研究結(jié)果提示,，非炎性因子或可作為代謝疾病的治療靶點(diǎn)。（@沈志勛）

上海交大崔大祥等：納米金短期暴露影響腸道菌群

Journal of Biomedical Nanotechnology[IF:5.068]

① BALB/c小鼠口服納米金7天,，在第0,、4、8小時(shí)及第1,、3,、7天分別分析腸道菌群的組成；② 在前3天,，納米金并未顯著改變腸道菌群的多樣性及群落,；③ 攝入納米金后，小鼠菌群中擬桿菌門,、厚壁菌門,、變形菌門、脫鐵桿菌門,、軟壁菌門及放線菌門為6個(gè)豐度最高的菌門,；④ 在第7天時(shí)，納米金顯著增加了小鼠腸道菌群中的變形菌門豐度,，并顯著減少了Roseburia菌屬,，增加了葡萄球菌屬、尿素原體及甲基桿菌屬,。

Impact of Short-Term Exposure of AuNCs on the Gut Microbiota of BALB/c Mice
04-01, doi: 10.1166/jbn.2019.2731

【主編評語】來自上海交通大學(xué)的崔大祥團(tuán)隊(duì)在《Journal of Biomedical Nanotechnology》上發(fā)表的一項(xiàng)最新研究,，發(fā)現(xiàn)在口服納米金7天后，小鼠的腸道菌群組成發(fā)生了顯著變化,，提示應(yīng)注意納米金的安全性及毒性,。（@沈志勛）