Graphpad Prism號稱作圖神器，名頭可不簡單,。咱們想要得心應(yīng)手,，先要了解自己的數(shù)據(jù)，掌握好它本身的圖形設(shè)計(jì)思路后,，還能通過巧妙的數(shù)據(jù)變換做出更富有表現(xiàn)力的圖形哦~

下面咱們通過幾組數(shù)據(jù)實(shí)例題,，來試試從理解數(shù)據(jù)到繪出圖形的完整過程！

作圖數(shù)據(jù)：

示例圖來自文獻(xiàn)PMID：26565812,，F(xiàn)ig. 5B,。

第1題比較基礎(chǔ)，咱們講詳細(xì)點(diǎn),，照顧一下沒了解過的盆友,。會做的小伙伴可以直接跳到第2題了。

先觀察一下,，這是很明顯的二維分組數(shù)據(jù),，一個(gè)是細(xì)胞分組（MGC-803、SGC-7901）,，一個(gè)是基因編輯分組（Vector,、CISD2、RNAi-vector,、RNAi1,、RNAi2）。所以我們新建數(shù)據(jù)集的時(shí)候選擇Grouped,。

把數(shù)據(jù)貼上,，然后雙擊左邊目錄中Graphs下相應(yīng)的圖形按鈕，選擇summary data選項(xiàng)卡中相應(yīng)的圖形,，就出圖了,。

在出來的毛坯圖上，雙擊某個(gè)柱子,，打開外觀設(shè)置界面,，各種設(shè)置：

呃，截圖時(shí)忘了去掉show legend那個(gè)勾了=_=你知道就好,。然后如果想馬上看效果就先點(diǎn)Apply,，然后繼續(xù)在這個(gè)框里換一根柱子繼續(xù)調(diào),。或者有耐心點(diǎn)的就調(diào)完所有柱子再點(diǎn)OK,。

不過這樣柱子還是胖胖的,，再雙擊回到剛才的界面，最右的選項(xiàng)卡Graph Settings：

再雙擊坐標(biāo)軸設(shè)一下X軸的樣式,。

還有Y軸刻度跟示例圖也是不一樣的,，改一下：

再在最右邊的Titles & Fronts選項(xiàng)卡中將X軸標(biāo)題藏起來。

接著直接在圖上改縱坐標(biāo)軸名稱,。再用畫線和文字工具添加大組名稱（行標(biāo)題）,，并設(shè)置文字樣式。

好了,，看效果,，等燈等燈等燈~

作圖數(shù)據(jù)：

示例圖：PMID：26565812，F(xiàn)ig. 5C,。跟剛才那個(gè)是同一篇,。

一句話點(diǎn)題：這道題學(xué)習(xí)三維分組數(shù)據(jù)的處理。

這回有三個(gè)分組因素,，比剛才多了一個(gè)周期分組（G0/G1 phase,、S phase、G2/M phase）,。有心的小伙伴可能會發(fā)現(xiàn),，這個(gè)三維分組數(shù)據(jù)的組織形式跟Prism軟件示例中不一樣呢。

如果要使用軟件中的三因素方差分析（Three-way ANOVA）,，則需要像下圖中這樣組織數(shù)據(jù)：

行為單一分組因素,，一行一組，而在列上整合兩個(gè)分組因素,，總列數(shù)為兩個(gè)因素分組數(shù)的乘積,，如果中處理方式有2組，劑量有2組,，則總列數(shù)為2×2=4,。

但再看看示例圖，我們需要一個(gè)堆積柱狀圖來觀察不同周期的比例,，這并不是Three-way的出圖方式,。

而當(dāng)你用那樣的三維數(shù)據(jù)表去選Plot summary data中的堆積柱狀圖時(shí)，好像又不是這么回事……

看來它是必須每行作為一根柱子,，各列一起堆上去的,。所以需要對數(shù)據(jù)做一些變換，變成我們摸擬示列中的那個(gè)樣子,。不過這樣，細(xì)胞分組貌似只有自己心知肚明了。而且,，作Three-way ANOVA分析的時(shí)候,，會提示數(shù)據(jù)組織形式不對。所以你可能需要保留兩份數(shù)據(jù)表,。

好了,，把數(shù)據(jù)貼好之后就如上所說選擇堆積柱狀圖。

接下來的外觀調(diào)整跟上邊的做法大同小異,，就不重復(fù)了,。只是在柱子堆積的排序上，跟示例圖不一樣,，可以在外觀選項(xiàng)卡旁邊的Data Sets on Graph中調(diào)整,。

還有最后的一個(gè)問題，兩種細(xì)胞分組之間的距離分不開,，用剛才的方法好像不湊效,，怎么辦？

那是因?yàn)閿?shù)據(jù)組織形式不一樣了,，各組已經(jīng)堆起來了,。所以現(xiàn)在應(yīng)該在兩組間加一個(gè)空行：

并且保證那個(gè)空行占有一根柱子的位置（其實(shí)默認(rèn)就是100%）：

做完了。

作圖數(shù)據(jù)：

示例圖：PMID：27832663,，F(xiàn)ig. 1A,。

這樣看起來好像跟第1題一樣的嘛，二維分組數(shù)據(jù),。但再仔細(xì)看看,，第1題的各大組內(nèi)，每根柱子用不同的顏色區(qū)分,，而這里,，同一個(gè)大組中各柱子的填充是一樣的。如果按這樣的數(shù)據(jù)排布方式來選擇分離柱狀圖：

得到的效果就不是示例那樣：

第1題中的交錯(cuò)柱狀圖（interleaved bar）是以行區(qū)分大組,，以列區(qū)的不同顏色分各柱子,；而分離柱狀圖（Separated bar）可理解為以列區(qū)分各大組，但也可理解為仍是以行區(qū)分大組,，但把每組中相同成分（列）提取出來,，在圖上拆分排布，所以叫分離柱狀圖,。

說了這么多,，就是叫你重新組織一下數(shù)據(jù)啦~把行和列倒過來。

這樣選擇分離柱狀圖,，就可以得到示例圖中的效果了,。

最后一點(diǎn)是Y軸的截?cái)?，因?yàn)楦鹘M數(shù)據(jù)值差得太大，小的那些組幾乎看不到了,，像示例圖那樣截?cái)嗄芸吹揭恍┘?xì)節(jié),。我們之前在《你終于會做截?cái)鄨D了，可審稿人說不讓做,，怎么破,？》中講解過，還提到另一種處理方式,，大家可以看情況選用哦,。

作圖數(shù)據(jù)：

示例圖：PMID: 28114280；Fig. 2f,。

一句話點(diǎn)題：這道題注意坐標(biāo)軸變換,。

其實(shí)數(shù)據(jù)表很長，有45行,，我只截了一部分,。剛才的柱狀圖都是將一組數(shù)據(jù)經(jīng)過匯總計(jì)算，在圖上展示它們的平均分,、標(biāo)準(zhǔn)差等描述性統(tǒng)計(jì)量,。而現(xiàn)在是把每個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)都展示出來，用縱橫坐標(biāo)來描述位置,，觀察它們的分布特征,。所以創(chuàng)建表格時(shí)要選擇XY形式：

填好數(shù)據(jù)后選散點(diǎn)圖：

可是畫風(fēng)不對呀~

原來X軸上的值跨度太大了，從0.5到幾萬,，適合做對數(shù)轉(zhuǎn)換,，像示例中2n那樣。雙擊X軸設(shè)置：

也同樣到Left Y axis那里把Y軸最大值設(shè)為4,。

嗯,，要是還覺得215后邊還有一點(diǎn)延長不滿意，那只好計(jì)算一下215=32768,，把這個(gè)數(shù)填回剛才填40000的地方,。

最后一道大題了，木有示例圖,，作圖數(shù)據(jù)：

仔細(xì)想想,，劑量是有遞增關(guān)系的數(shù)值，旁邊幾個(gè)處理組也是一一對應(yīng)的數(shù)值,，所以也是XY圖,。不過數(shù)據(jù)錄入方式不一樣，不是第4題那種原始數(shù)據(jù)了,，而是已經(jīng)把平均值,、標(biāo)準(zhǔn)差,、樣本量計(jì)算整理好了。所以在創(chuàng)建表格的時(shí)候也有相應(yīng)的選擇,。

選擇具體圖形的時(shí)候再想想,，這數(shù)據(jù)是記錄不同處理方式下,，劑量遞增時(shí)細(xì)胞的生存情況,，目的是要看變化趨勢，所以最好是點(diǎn)線圖不是散點(diǎn)圖,。

后面的內(nèi)容基本都講過了,。主要提醒一下X軸，這回是太小而不是太大,，所以可以選擇科學(xué)計(jì)數(shù)法：

或者干脆各×106變成μM,，這種時(shí)候就考驗(yàn)細(xì)心，不要忘記改X軸標(biāo)題：

其實(shí)把劑量看成一種分組因素也未嘗不可,，那就成為二維分組數(shù)據(jù),，可做成柱狀圖：

或分離柱狀圖：

其他外觀啥的可自由調(diào)整發(fā)揮，玩到好看為止~

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