尹嘉銓自此以名儒自居,。乾隆四十六年(1781年),，尹嘉銓已離休回到老家河北博野，當(dāng)年四月,，乾隆西巡五臺(tái)山回蹕保定,，尹嘉銓一心想要參加接駕盛典拍馬屁。然而竟沒有圣旨要傳召他入覲,，尹嘉銓靈機(jī)一動(dòng),，想到老爹尹會(huì)一，便草擬兩份奏折：一是請(qǐng)謚,，二是從祀,。要是皇帝恩準(zhǔn),，不但博個(gè)孝子名聲，還能乘機(jī)出風(fēng)頭,，于是派兒子將請(qǐng)謚奏折送去,，自己呆在家中。乾隆帝看到他兒子替他送上來的奏本,，為父請(qǐng)謚,，沒想到惹惱了乾隆皇帝，朱批：“竟大肆狂吠,，不可恕矣!”于是下旨,，將他“拿交刑部審訊，從重治罪”,，并下令查抄尹嘉銓在京師和原籍的家產(chǎn)著述,。

　　大學(xué)士英廉查抄了尹嘉銓在北京的家產(chǎn)，并搜查出其家藏書大小311套,，　散書1539本,，未裝訂書籍一柜，法帖冊(cè)頁65本,，破字畫58卷,、書信一包計(jì)113　封、書板1200塊,。直隸總督袁守侗又查沒尹嘉銓之父尹會(huì)一祠堂一所,，除祭器之外有隨祀田84畝之多，又有義學(xué)田一頃,。尹嘉銓代其岳父李?公贈(zèng)送祠堂一所共52間,。另外，還搜出大小四十六箱書籍,，派員封送北京,，交英廉一并檢閱。

　　英廉特意精選了通曉文義又查辦過禁書,，同時(shí)認(rèn)真謹(jǐn)慎的翰林?jǐn)?shù)人同他一起對(duì)尹家藏書詳加察勘,，不使可能存在的悖逆語稍有遺漏。他們前后用了半個(gè)月的時(shí)間才將全部書籍檢閱完畢,。

　　尹嘉銓是當(dāng)時(shí)頗有名望的道學(xué)家,，非但藏書豐富非一般人能望其項(xiàng)背，而且著述之多也不是普通文人,、官僚所能比擬的,。他自己撰寫、編纂的書有八十余種,，加上由他注解或代作序文的書,，總共約九十多種,。這些書都是英廉等人檢閱的重點(diǎn)，最后從其中發(fā)現(xiàn)了一百三十多處悖逆文字,。

　　例如尹嘉銓稱他父親尹會(huì)一與張伯行等為“孔門四子”,，稱父母死為“薨”;所著《隨王草擇言》第一卷有：“后世孝友多不見用于世，即用世而立身之大端又難言之”;“今群臣非八人之比,，乃使之遍居人人之官而望功業(yè)之成不可得也”,。同書第二卷內(nèi)有：“固不務(wù)講學(xué)之名以賈禍，亦不避講學(xué)之名以免禍”;《李孝女暮年不字事》中記有女子年逾50,，依然待字,。他的妻子李恭人遣使媒人欲給尹嘉銓收為妾，遭到拒絕;《亭山遺言》稱曾夢到東岳大帝座間,，說他為孟子之后身，當(dāng)繼孔子宗傳,、壽尚未艾;《尹氏家譜》中記有他父親居官時(shí)“密奏之事不載”等語;在《名臣言行錄》中自稱“古稀老人”,，而當(dāng)時(shí)乾隆曾于乾隆四十五年70歲時(shí)作御制詩稱自己為“古稀”，并刻了一方“古稀老人”的章,，尹嘉銓如此自稱便是犯了忌,。

　　又《隨王草》內(nèi)有“應(yīng)舉入場，直同于庶人之往役”等語,，被認(rèn)為是污蔑朝廷的科舉考試,。同書中還有《朋黨之說起》中云：“而文師之教衰，君亦安能獨(dú)尊于上哉?”當(dāng)時(shí)雍正帝曾作有《朋黨論》,，尹嘉銓的言論便被認(rèn)為是與皇帝唱對(duì)臺(tái)戲,。由于尹嘉銓干越國家大典的行為大大激怒了乾隆皇帝，他不止一次降旨,，飭令嚴(yán)辦,。負(fù)責(zé)該案的大學(xué)士三寶等人不敢怠慢。尹嘉銓被押抵北京后,，即于三月二十八日開堂訊問,。前后提審了尹嘉銓十七次，尹嘉銓無法,，只有一一認(rèn)罪痛哭辯解,。

　　但辯解歸辯解，判官們并不因此就網(wǎng)開一面,、手下留情,。乾隆四十六年四月十七日，大學(xué)士三寶,、英廉及涉及此案的各部,、司人員給皇帝奏疏,，報(bào)告了尹嘉銓的罪證及刑審情況，最后建議將尹嘉銓凌遲處死,，家產(chǎn)全部入官,，所有書籍盡行銷毀，其緣坐家屬,，男十六以上者皆斬,，余人給付功臣之家為奴。

　　奏折遞進(jìn)宮后,，乾隆皇帝于四月十七日下了一道長達(dá)千余言的上諭,，歷數(shù)尹嘉銓處處罪狀，認(rèn)為本應(yīng)“凌遲處死,，家屬緣坐”,，但為了表示皇上的大度，決定“加恩免其凌遲之罪,，改為處絞立決,，其家屬一并加恩，免其緣坐”,。四月二十日又復(fù)旨道：“尹嘉銓悖謬書籍既多,，其原籍親族戚友必有存留之本，著傳諭袁守侗明切曉諭,，令將其書籍板片悉行呈出,，毋任隱匿，一并解京銷毀,?！憋喠罡魇》饨罄簦绕涫且毋尲亦l(xiāng)直隸和他曾任職的山東,、山西,、甘肅等省督撫，詳細(xì)訪查,，“倘查辦不實(shí),，致有隱漏，別經(jīng)發(fā)覺,，必將原辦之該督撫等治罪,。”

　　軍機(jī)處按照乾隆的諭旨,，將尹嘉銓著作書目開列清單,，抄送各地，各省的督撫，則按單查繳,。最后,，“收獲”頗豐。據(jù)陜甘總督李侍堯于七月十四日奏報(bào),，甘肅共繳出尹嘉銓著作五十七種,，計(jì)二百六十四本又九十冊(cè)又一千五百三十四頁，書版二百二十六塊,，擊碎尹撰石刻碑文兩塊,。山西巡撫雅德于七月二十六日奏報(bào)，晉省查出尹嘉銓書文,，十一種拓本是軍機(jī)處書單上所沒有的,。山東巡撫國泰于五月十八日稟報(bào)，共查出尹嘉銓纂著,、疏解的書籍四種二百六十六部,，磨毀石刻詩文、碑記數(shù)塊,。福建巡撫富綱于六月十三日奏稱,，已經(jīng)查出尹嘉銓著作九十余種。云貴總督與云南巡撫于五月二十二日奏稱,，共繳到尹嘉銓所編纂之書七種，計(jì)三百六十一本,，書版三十一塊,。十日二十二日，云南巡撫劉秉恬復(fù)奏,，又查到尹氏著述十八種共七十九本,，其中兩種是軍機(jī)處所開書單上沒有的。其它省份,，如廣西,、湖南、湖北,、江西等省也多有繳獲,。

　　最后，各省督撫將繳到的尹氏文字封送北京集中處理,。尹嘉銓自著之書全部焚毀,，由其疏解或作序的書則用抽毀的辦法將其文字剔除。