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12個ggplot2擴展包幫你實現(xiàn)更強大的可視化

 生物_醫(yī)藥_科研 2018-12-07

ggplot2 Extension


ggplot2自從2007年推出以來,,成為世界范圍內(nèi)下載最頻繁、使用最廣泛的R包之一,。許多人包括ggplot2的創(chuàng)建人Hadley Wickham將這一成功歸功于ggplot2背后的哲學,。這個軟件包的靈感來源于Leland Wilkinson編寫的《圖形語法》一書,,在此書中將graphs 分解成scaleslayers,并將原始數(shù)據(jù)與表現(xiàn)形式分離開,。


具體使用可見下面簡化示例和后面列出的往期繪圖文章,。


如果你是ggplot2的眾多粉絲之一,你會發(fā)現(xiàn)自己有時想要尋找更多“花哨”的形式來擴展它的功能,。幸運的是,,在過去10年里,R社區(qū)一直在努力為ggplot2構建擴展包,,到如今已有超過40個擴展包可供使用,,今天為要介紹的是大家比較鐘愛的12個ggplot2擴展包,想要查看所有ggplot2擴展包的介紹及使用例子,,請瀏覽官網(wǎng):http://www./gallery/ (有一部分擴展包未收錄在內(nèi))


十二個ggplot2擴展包介紹

1

gganimate

作者:David Robinson 

網(wǎng)址:https://www./packages/gganimate 或 https://github.com/thomasp85/gganimate (新版)

簡介:gganimate可以使圖片以更加生動形象的動圖展示出來,,可以直觀展示數(shù)據(jù)的動態(tài)變化過程,最后我們可以將動畫保存為GIF,、視頻或動畫網(wǎng)頁,,以便在RStudio或筆記本之外使用。如下面這個例子以動態(tài)圖展現(xiàn)了歷年來諾貝爾獲獎者出生地的變化情況,,《利用gganimate可視化全球范圍R-Ladies(R社區(qū)性別多樣性組織)發(fā)展情況》一文中有更詳細的事例展示如何使用此包,。

2

ggthemes

作者:Jeffrey B. Arnold

網(wǎng)址:https://www./packages/ggthemes

簡介:ggthemes主要作用是提供一些額外的themes、geoms,、scales可以讓我們快速畫出不同主題,、背景和配色方案的圖片。學術圖表基本配色方法

3

ggpubr

作者:Alboukadel Kassambara

網(wǎng)址:https://www./packages/ggpubr

簡介:要通過ggplot2定制一套圖形,,尤其是適用于雜志期刊等出版物的圖形,,對于那些沒有深入了解ggplot2的人來說就有點困難了,而ggpubr可輕松繪制出符合出版物要求的圖形,。

4

patchwork

作者:Thomas Pedersen

網(wǎng)址:https://www./packages/patchwork

簡介:平常我們繪制圖形的時候常常要將幾幅圖形組合在一起,,而ggplot2本身沒有強大的拼圖語法,這時利用patchwork擴展包,,使用幾個簡單的如/,、+*,、^等符號就可以輕松實現(xiàn)拼圖這件事,。還有其它包也可以做類似事情,具體見ggplot2學習筆記之圖形排列,。

5

ggridges

作者:Claus O. Wilke

網(wǎng)址:https://www./packages/ggridges

簡介:ggridges包主要用來繪制山巒圖,。尤其是針對時間或者空間分布可視化具有十分好的效果。

6

ggdendro

作者:Andrie de Vries

網(wǎng)址:https://www./packages/ggdendro

簡介:ggdendro有幾個函數(shù)可用來提取樹狀圖數(shù)據(jù),,可以保存或操作數(shù)據(jù)本身,。旋轉你的樹狀圖,、刪除網(wǎng)格背景、倒轉scale,,畫三角線段,,創(chuàng)建dianaAgnes聚類圖,等等,。結合dendextendape包來完全控制你的樹狀圖,。

7

ggmap

作者:David Kahle

網(wǎng)址:https://www./packages/ggmap

簡介:ggmap包整合了四種地圖資源,分別是Google,、OpenStreetMaps,、Stamen,它使gplot2的所有geoms都可以用于地圖可視化,,可以在地圖上繪制等高線圖散點圖,。


8

ggrepel

作者:Kamil Slowikowski

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