內(nèi)存溢出問題是參加kaggle比賽或者做大數(shù)據(jù)量實驗的第一個攔路虎,。
以前做的練手小項目導(dǎo)致新手產(chǎn)生一個慣性思維——讀取訓(xùn)練集圖片的時候把所有圖讀到內(nèi)存中,然后分批訓(xùn)練,。
其實這是有問題的,,很容易導(dǎo)致OOM。現(xiàn)在內(nèi)存一般16G,,而訓(xùn)練集圖片通常是上萬張,,而且RGB圖,還很大,,VGG16的圖片一般是224x224x3,,上萬張圖片,,16G內(nèi)存根本不夠用。這時候又會想起——設(shè)置batch,,但是那個batch的輸入?yún)?shù)卻又是圖片,,它只是把傳進(jìn)去的圖片分批送到顯卡,而我OOM的地方恰是那個“傳進(jìn)去”的圖片,,怎么辦,?
解決思路其實說來也簡單,打破思維定式就好了,,不是把所有圖片讀到內(nèi)存中,,而是只把所有圖片的路徑一次性讀到內(nèi)存中。
大致的解決思路為:
將上萬張圖片的路徑一次性讀到內(nèi)存中,,自己實現(xiàn)一個分批讀取函數(shù),,在該函數(shù)中根據(jù)自己的內(nèi)存情況設(shè)置讀取圖片,只把這一批圖片讀入內(nèi)存中,,然后交給模型,,模型再對這一批圖片進(jìn)行分批訓(xùn)練,因為內(nèi)存一般大于等于顯存,,所以內(nèi)存的批次大小和顯存的批次大小通常不相同,。
下面代碼分別介紹Tensorflow和Keras分批將數(shù)據(jù)讀到內(nèi)存中的關(guān)鍵函數(shù)。Tensorflow對初學(xué)者不太友好,,所以我個人現(xiàn)階段更習(xí)慣用它的高層API Keras來做相關(guān)項目,,下面的TF實現(xiàn)是之前不會用Keras分批讀時候參考的一些列資料,在模型訓(xùn)練上仍使用Keras,,只有分批讀取用了TF的API,。
在input.py里寫get_batch函數(shù)。
def get_batch(X_train, y_train, img_w, img_h, color_type, batch_size, capacity): ''' Args: X_train: train img path list y_train: train labels list img_w: image width img_h: image height batch_size: batch size capacity: the maximum elements in queue Returns: X_train_batch: 4D tensor [batch_size, width, height, chanel],\ dtype=tf.float32 y_train_batch: 1D tensor [batch_size], dtype=int32 ''' X_train = tf.cast(X_train, tf.string)
y_train = tf.cast(y_train, tf.int32) # make an input queue input_queue = tf.train.slice_input_producer([X_train, y_train])
y_train = input_queue[1] X_train_contents = tf.read_file(input_queue[0]) X_train = tf.image.decode_jpeg(X_train_contents, channels=color_type)
X_train = tf.image.resize_images(X_train, [img_h, img_w], tf.image.ResizeMethod.NEAREST_NEIGHBOR)
X_train_batch, y_train_batch = tf.train.batch([X_train, y_train], batch_size=batch_size, num_threads=64, capacity=capacity)
y_train_batch = tf.one_hot(y_train_batch, 10) return X_train_batch, y_train_batch
在train.py文件中訓(xùn)練(下面不是純TF代碼,,model.fit是Keras的擬合,,用純TF的替換就好了)。
X_train_batch, y_train_batch = inp.get_batch(X_train, y_train, img_w, img_h, color_type, train_batch_size, capacity) X_valid_batch, y_valid_batch = inp.get_batch(X_valid, y_valid, img_w, img_h, color_type, valid_batch_size, capacity)with tf.Session() as sess:
coord = tf.train.Coordinator() threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord) try: for step in np.arange(max_step): if coord.should_stop() : break X_train, y_train = sess.run([X_train_batch, y_train_batch]) X_valid, y_valid = sess.run([X_valid_batch, y_valid_batch]) ckpt_path = 'log/weights-{val_loss:.4f}.hdf5' ckpt = tf.keras.callbacks.ModelCheckpoint(ckpt_path, monitor='val_loss', verbose=1, save_best_only=True, mode='min') model.fit(X_train, y_train, batch_size=64, epochs=50, verbose=1, validation_data=(X_valid, y_valid), callbacks=[ckpt]) del X_train, y_train, X_valid, y_valid except tf.errors.OutOfRangeError: print('done!') finally: coord.request_stop() coord.join(threads)
sess.close()
keras文檔中對fit,、predict,、evaluate這些函數(shù)都有一個generator,這個generator就是解決分批問題的,。
關(guān)鍵函數(shù):fit_generator
# 讀取圖片函數(shù) def get_im_cv2(paths, img_rows, img_cols, color_type=1, normalize=True): ''' 參數(shù): paths:要讀取的圖片路徑列表 img_rows:圖片行 img_cols:圖片列 color_type:圖片顏色通道 返回: imgs: 圖片數(shù)組 ''' # Load as grayscale imgs = [] for path in paths: if color_type == 1: img = cv2.imread(path, 0) elif color_type == 3: img = cv2.imread(path) # Reduce size resized = cv2.resize(img, (img_cols, img_rows)) if normalize: resized = resized.astype('float32') resized /= 127.5 resized -= 1. imgs.append(resized)
return np.array(imgs).reshape(len(paths), img_rows, img_cols, color_type)
獲取批次函數(shù),,其實就是一個generator
def get_train_batch(X_train, y_train, batch_size, img_w, img_h, color_type, is_argumentation): ''' 參數(shù): X_train:所有圖片路徑列表 y_train: 所有圖片對應(yīng)的標(biāo)簽列表 batch_size:批次 img_w:圖片寬 img_h:圖片高 color_type:圖片類型 is_argumentation:是否需要數(shù)據(jù)增強(qiáng) 返回: 一個generator, x: 獲取的批次圖片 y: 獲取的圖片對應(yīng)的標(biāo)簽 ''' while 1: for i in range(0, len(X_train), batch_size): x = get_im_cv2(X_train[i:i+batch_size], img_w, img_h, color_type) y = y_train[i:i+batch_size] if is_argumentation: # 數(shù)據(jù)增強(qiáng) x, y = img_augmentation(x, y) # 最重要的就是這個yield,,它代表返回,,返回以后循環(huán)還是會繼續(xù),然后再返回,。就比如有一個機(jī)器一直在作累加運算,,但是會把每次累加中間結(jié)果告訴你一樣,,直到把所有數(shù)加完
yield({'input': x}, {'output': y})
訓(xùn)練函數(shù)
result = model.fit_generator(generator=get_train_batch(X_train, y_train, train_batch_size, img_w, img_h, color_type, True), steps_per_epoch=1351, epochs=50, verbose=1, validation_data=get_train_batch(X_valid, y_valid, valid_batch_size,img_w, img_h, color_type, False), validation_steps=52, callbacks=[ckpt, early_stop], max_queue_size=capacity,
workers=1)
就是這么簡單。但是當(dāng)初從0到1的過程很難熬,,每天都沒有進(jìn)展,,沒有頭緒,急躁占據(jù)了思維的大部,,熬過了這個階段,,就會一切順利,不是運氣,,而是踩過的從0到1的每個腳印累積的靈感的爆發(fā),,從0到1的腳印越多,后面的路越順利,。
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