上個月25日,JAMA刊文,,題為Prevalence of Variant Reclassification Following Hereditary Cancer Genetic Testing,。這是來自于德克薩斯大學西南醫(yī)學中心的最新研究成果。
這項針對基因檢測進行的研究,,揭示了一個十分重要的問題:隨著人們對于基因不斷產(chǎn)生更多認識,,對基因的分類也會持續(xù)細化,從前在基因檢測時出現(xiàn)的意義不明的基因都會逐步產(chǎn)生合理解釋,,因此基因檢測實驗室應該定期回顧其測序結果,,并給醫(yī)生提供相關信息。
典型的基因約包含27000個堿基對(A-T,,G-C),,這些大量的堿基對意味著無數(shù)的潛在變異。然而并不是所有的基因突變都與疾病有關,,基因突變往往被分成“良性”,、“可能良性”“不確定重要性的變異”、“可能致病”和“致病性的”等幾大類,。隨著高通量腫瘤測序和胚系基因檢測的廣泛應用,,如何應對臨床意義不明確的基因突變,,是大家面臨的挑戰(zhàn)之一。
在研究團隊所擁有的06年到18年的總計145萬人次的基因檢測數(shù)據(jù)中,,有超過一半以上的病例均為癌癥患者,。經(jīng)過對癌癥患者數(shù)據(jù)的重新分析,團隊發(fā)現(xiàn),,有7.7%(26 670中的2048)具有不確定意義的獨特變異被重新分類,,91.2%(2048中的1867)被降級為良性或可能是良性的,8.7%(2048中的178)升級為致病性或可能致病性變異,。由于很多此類變異不止影響一個個體,,因此重新分類最終影響了整個隊列中25%的臨床報告(46 890個,184 327個),。 由此可見,,定期將已經(jīng)被檢測過的數(shù)據(jù)進行重新分類,確實能得到更多有效信息,,而這無疑對于臨床診斷治療具有重要的指導意義,。當然,在實際操作中需要考慮的問題依舊有很多,,比如需要多久對分類進行一次更新,?如何恰當?shù)嘏c先前進行檢測的客戶進行溝通,告知其結果已經(jīng)更新,?
另外值得注意的是,,研究所用的145萬人次的基因檢測數(shù)據(jù),均來自Myriad Genetics一家公司,。而不同基因檢測公司和實驗室在該領域的實踐存在多大差異,,是否會對基因檢測結果有影響,或許也是未來值得探討的問題,。
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