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感覺ImageJ和PS太難?其實不然,,看視頻操作就行了,。 上周《lncRNA研究套路》系列課的第二節(jié)內(nèi)容已通過以下案例文章介紹了lncRNA發(fā)揮作用的四種模式,并對文章中數(shù)據(jù)進(jìn)行了詳細(xì)地解讀和分析,。本周,老談將繼續(xù)以該文章為例,,從SCI作圖基本原則,,Image J和Photoshop三部分講解文章數(shù)據(jù)處理和展示方法。
01 常言道,,無規(guī)矩不成方圓,。因而,SCI論文中圖片制作和排版也是存在一些約定熟成的“規(guī)矩”,,只有熟知“規(guī)矩”才能練就“火眼金睛”,,成功避開圖片制作各種坑。 首先,,以參考文獻(xiàn)中的6張圖片為實例,,課程通過找茬的方式為大家展示各個小圖制作的小錯誤,并說明如何根據(jù)“規(guī)矩”進(jìn)行改正,。 雖然這6張圖片質(zhì)量整體不錯,,沒有太多的低級失誤,但仍存在一些格式上不協(xié)調(diào)的微小瑕疵,。以問題最多的Figure4為例,,就存在以下問題:圖片邊界、Y軸標(biāo)題太長,、Y軸刻度線太密集,、圖片對比度等。 此外課程也重點關(guān)注了排版問題,,通過修改前和修改后圖片對比展示,,說明SCI圖片排版的基本方法,。同時,也會通過實例探討小圖拼成大圖的方法和技巧,。 02 檢測蛋白的Western blot(wb)作為基礎(chǔ)科研中的經(jīng)典分子實驗,,在大多數(shù)情況下,其結(jié)果圖僅僅是典型的圖片展示,,但有時也需要對wb結(jié)果圖進(jìn)行定量統(tǒng)計,。 Image J是最常用的western blot定量方法。本節(jié)課程則會詳解Image J軟件分析圖片灰度狀態(tài)表達(dá)的方法及步驟,。 首先,,就以黑白為基礎(chǔ)的灰度圖片而言,其灰度值可表征圖片灰度的狀態(tài),。以8bit圖片為例,,全黑狀態(tài)時灰度定義為0;全白狀態(tài)時灰度定義為255,;從0到255之間有256個級差,,可覆蓋全黑到全白的整個廣譜。所以實際應(yīng)用中一般以8bit圖片為準(zhǔn),。
最后分別選取背景干凈圖片(文獻(xiàn)Figure3a)和背景干擾典型圖片(文獻(xiàn)Figure5e)為實例,,手把手教授Image J如何獲得灰度值和數(shù)據(jù)均一化方法,并可獲得以下數(shù)據(jù),。
03 Photoshop(PS)作為一款極為強大的圖片處理軟件,,當(dāng)然不僅僅是網(wǎng)紅的專屬??蒲姓邆円嗫衫肞hotoshop來實現(xiàn)圖片的裁剪,、組合等操作,不僅能使做出的科研配圖更加美觀規(guī)范,,還能通過制作精良的圖片提升論文的整體檔次,。 第三節(jié)的課程則先對PS軟件的界面和常用工具進(jìn)行簡要介紹,并以western blot條帶截取組圖和免疫組化畫中畫為實例,,手把手教授以上兩種圖片制作過程,。 此外,PS還可以處理熒光圖片,,而第四節(jié)課程則會以免疫熒光圖片調(diào)整,、免疫熒光圖片merge和流式實驗結(jié)果重新繪制為實例,示范以上3種圖片制作過程,。
通過以上兩節(jié)PS作圖示例課程中,,老談詳細(xì)介紹了處理論文圖片的基本操作方法以及注意事項,,學(xué)員們依樣畫葫蘆,也能獲得范例文獻(xiàn)中漂亮規(guī)整的圖片,,實現(xiàn)即學(xué)即用的目的,。 |
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