非目標代謝組學和脂質(zhì)組學通常都需要進行大樣本量的分析,，因此需要操作快速且重復性好的樣本前處理方法,。同時這些方法還需要能夠覆蓋到盡可能多的代謝物，從水溶性的糖類到脂溶性的甘油三酯,。傳統(tǒng)的靶向代謝組學分析目的在于對目標化合物進行準確的定量,，而非靶向代謝組學和脂質(zhì)組學則需要盡可能多的檢測到樣本中的代謝物，擴大檢測的覆蓋面,，因此對于一些化合物來說,，提取的回收率并不是很好。

必須要了解的是,，沒有一種方法或檢測平臺可以檢測到樣本中所有的代謝物,，因此在非靶向代謝組學方法開發(fā)時，通常去尋找一種方法使用盡可能少的檢測方法或平臺去檢測到盡量多的化合物,，同時也要在檢測代謝物時符合一定的精密度和準確度的要求,。

代謝組學和脂質(zhì)組學研究都是針對復雜基質(zhì)樣本進行分析，如血樣,，尿樣,，動物植物組織等。由于受到檢測方法的限制以及代謝物信號響應的影響,，在進行代謝組學分析時通常需要的樣本量如下：組織樣本1-100mg,，細胞數(shù)量10e5-10e7,，生物液體10-250μl。樣本的量的局限也使得在一個代謝組學研究中要優(yōu)化一個有效率的提取方法變得非常有挑戰(zhàn)性,。

此外,，特定的檢測方法的檢測限也決定了需要的樣本量。例如,，在脂質(zhì)組學中,，少量的（10-30μl）血清或者血漿樣本完全可以滿足對主要磷脂類成分的檢測，但是如果要像檢測痕量的脂氧化物或者維生素D的代謝產(chǎn)物,，則需要250μl左右的樣本,。

不同的代謝組學研究對樣本前處理的要求不一樣。但是蛋白沉淀幾乎是所有方法所要求的,，因為蛋白的存在會嚴重的影響檢測的精密度,，準確性，同時也會對儀器的壽命造成影響,。在以發(fā)現(xiàn)為目的的非目標代謝組學和脂質(zhì)組學研究中,，為了在樣本中檢測到盡可能多的代謝物，生物樣本在分析前的前處理步驟越少越好,。因此,，研究者們通常使用一些沒有選擇性的前處理方法如用有機溶劑沉淀蛋白（如血清或血漿樣本前處理）,，樣本稀釋（如尿液樣本前處理）,。

在靶向代謝組學研究中，樣本前處理時,，在經(jīng)過有機溶劑沉淀蛋白之后,，還會接著做液液萃取或者固相萃取來去除基質(zhì)的干擾，從而進一步對目標代謝物進行分離和富集,。這些操作大大提高了檢測的靈敏度和動態(tài)范圍,。對于非靶向和靶向代謝組學來說，樣本前處理的最后階段都是溶劑揮發(fā)（富集代謝物）和提取物復溶（使用和流動相互溶的溶劑）

脂質(zhì)組學是代謝組學的一個分支,，在樣品前處理時如果使用多步溶劑提取或者兩相溶劑提取要比使用單獨溶劑提取的效率高,。但是增加提取步驟會增加前處理操作的時間，這就降低了實驗室樣本處理的數(shù)量,，尤其在大樣本量的代謝組學或者脂質(zhì)組學實驗中,，實驗的通量會大大降低。通常,，代謝組學研究和脂質(zhì)組學研究的樣本前處理方法都是分開的,。

未完待續(xù)