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基因檢測在腫瘤臨床領(lǐng)域的運用系列專題(1)

 a我愛醫(yī)學(xué) 2017-08-30

目錄


引言


對于腫瘤,,很多人談癌色變,、望而生畏;對于基因,,則被視為“生命密碼”,,被寄予無限厚望!過去二十年,,隨著生命科學(xué)和檢測技術(shù)的不斷發(fā)展,,從人類基因組計劃到美國精準(zhǔn)醫(yī)療的“登月計劃”,基因宛如一位蒙著面紗的“美少女”,,慢慢被揭開其神秘而令人向往的面容,,基因檢測也成為生命領(lǐng)域,尤其是癌癥領(lǐng)域最熱門的話題之一,。

 

隨著檢測技術(shù)和分子生物學(xué)的發(fā)展,,基于基因檢測的腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療(分子靶向治療)在肺癌、腸癌,、惡性黑色素瘤等腫瘤領(lǐng)域(尤其是EGFR突變的非小細(xì)胞肺癌)開始展露鋒芒,,很多過去預(yù)期壽命只有短短幾個月的晚期癌癥患者生命得到了顯著延長,幾年不再是夢想,,也讓長期“帶瘤生存”成為可能,!

 

基于基因檢測的精準(zhǔn)醫(yī)療毫無疑問是很多癌癥患者獲得新生的希望,但是鑒于許多腫瘤的多基因突變特點、基因/基因和基因/環(huán)境相互作用的很多機制尚未探明,,注定了精準(zhǔn)醫(yī)療在腫瘤領(lǐng)域的充分運用還有很長一段路要走,。

 

精準(zhǔn)醫(yī)療是希望,但是亦被某些“標(biāo)題黨”過度神話,,為了與大家一起更好地認(rèn)識基因檢測在腫瘤領(lǐng)域的運用,,《指南解讀》主編黃志鋒醫(yī)生邀請來自至本醫(yī)療科技的CEO、好友王凱博士共同撰寫此專題,,敬請大家關(guān)注,,也歡迎大家一起交流探討、幫忙批評指正,!

 

作者簡介:

感謝張金丹,、龐菲幫忙查閱文獻(xiàn)、一起撰稿,!


基因檢測的發(fā)展歷程 


1.什么是基因,?基因與腫瘤的關(guān)系?


基因是指帶有遺傳訊息的DNA片段,,亦稱遺傳因子,。基因支持著生命的基本構(gòu)造和性能,,儲存著生命的種族,、血型、孕育,、生長,、凋亡等過程的全部信息。生物體的生,、長,、衰、病,、老,、死等一切生命現(xiàn)象都與基因有關(guān),基因是決定生命健康的內(nèi)在因素,。遺傳和環(huán)境(外在因素)互相依賴,演繹著生命的繁衍,、細(xì)胞分裂和蛋白質(zhì)合成等重要生理過程,。

 

腫瘤是機體細(xì)胞在內(nèi)外致瘤因素長期協(xié)同作用下導(dǎo)致其基因水平的突變和功能調(diào)控異常,從而促使細(xì)胞持續(xù)過度增殖并導(dǎo)致發(fā)生轉(zhuǎn)化而形成的新生物,。

 

顧名思義,,腫瘤與基因突變密切相關(guān)!

  

2.什么是基因檢測?


基因檢測是通過血液,、其他體液,、或細(xì)胞對DNA進(jìn)行檢測的技術(shù)。


基因檢測可以用于疾病風(fēng)險的預(yù)測,、診斷與治療,。在疾病的預(yù)測方面,利用基因檢測技術(shù)發(fā)現(xiàn)疾病易感基因,,并評估罹患遺傳疾病風(fēng)險的高低,,及早輔助患者更好的預(yù)防疾病,;在疾病診斷方面,,則可借助基因檢測技術(shù),幫助臨床病理更好的進(jìn)行疾病的判斷和確認(rèn),,據(jù)統(tǒng)計,,目前有1000多種遺傳性疾病可以通過基因檢測技術(shù)做出診斷;對于疾病的治療,,基因檢測技術(shù)找到疾病發(fā)生的內(nèi)在驅(qū)動基因,,通過了解疾病的內(nèi)在分子機制,更好的指導(dǎo)臨床醫(yī)護(hù)工作者選擇相應(yīng)的治療藥物,,如對肺癌患者EGRF,、ALK等基因進(jìn)行檢測,以此來選擇合適的靶向藥物,。

 

3.基因檢測與傳統(tǒng)醫(yī)療檢測的區(qū)別


傳統(tǒng)的醫(yī)療檢測手段是針對疾病的具體癥狀或已有病變進(jìn)行檢測?,F(xiàn)代科學(xué)的發(fā)展促進(jìn)了醫(yī)療檢驗手段的進(jìn)步,可以深入細(xì)微之處對疾病進(jìn)行縱向或橫向的剖析,。大家都知道,,人體的基本組成部分是細(xì)胞,如果可以對細(xì)胞展開一種實質(zhì)的剖析,,就可以找到疾病產(chǎn)生的根源,。如癌癥是人體細(xì)胞發(fā)生突變并大量復(fù)制的結(jié)果。


以癌癥為例,,一般醫(yī)療檢測手段是要看身體是否已經(jīng)有癌細(xì)胞存在,,而對于沒有產(chǎn)生癌變但已經(jīng)具有風(fēng)險的細(xì)胞卻無從得知。通過基因檢測不僅可以告訴您所患某種類型的癌癥風(fēng)險有多大,,而且對于已患癌癥的患者,,基因檢測還可以找到癌癥發(fā)生的相關(guān)驅(qū)動基因,并以此有針對性的選擇合適的藥物進(jìn)行靶向治療,。

 

4.基因檢測技術(shù)的發(fā)展歷程


相比較人類基因緩慢的進(jìn)化速度,,有關(guān)基因檢測的速度和能力的進(jìn)化在這短短的40年內(nèi)可謂“天翻地覆”,,其基因檢測技術(shù)也經(jīng)歷了3個時代的發(fā)展歷程:

 

a)第一代基因檢測技術(shù)

第一代基因檢測以Sanger法的出現(xiàn)為主要標(biāo)志,而首臺商業(yè)化基因檢測測序儀對改法進(jìn)行了改進(jìn),,它以熒光信號接收和計算機信號分析代替了核素標(biāo)記和放射自顯影檢測體系,。而1995年推出的首臺毛細(xì)管電泳測序儀PRISM 310更是使測序的通量大大提高。Sanger測序是最為經(jīng)典的一代測序技術(shù),,時至今日依然是基因檢測行業(yè)的金標(biāo)準(zhǔn),。

圖1:第一代基因測序儀

發(fā)展歷程:

b)第二代基因檢測技術(shù)

第二代高通量基因檢測技術(shù)主要通過DNA片段化構(gòu)建DNA文庫、文庫與載體交聯(lián)進(jìn)行擴(kuò)增,、在載體面上進(jìn)行邊合成邊測序反應(yīng),,使得第1代基因檢測技術(shù)中最高基于96孔板的平行通量擴(kuò)大至載體上百萬級的平行反應(yīng),完成對海量數(shù)據(jù)的高通量檢測,。由于該技術(shù)需要對DNA進(jìn)行片段化處理,,并對數(shù)據(jù)進(jìn)行大規(guī)模拼接,因此需要后臺強大的生物信息軟硬件來支持,。

 

二代基因檢車技術(shù)目前已經(jīng)在基因組,、轉(zhuǎn)錄組等組學(xué)檢測,在指導(dǎo)疾病分子靶向治療,、繪制藥物基因組圖譜指導(dǎo)個體化用藥,、感染性疾病的病原微生物宏基因組鑒定及通過母體中胎兒DNA信息進(jìn)行產(chǎn)前診斷等方面已經(jīng)獲得了較為廣泛的應(yīng)用。

圖2:第二代基因測序儀

發(fā)展歷程:

c)第三代基因檢測技術(shù)

第三代基因檢測技術(shù)的核心理念是以單分子為目標(biāo)的邊合成邊測序,。該技術(shù)不需要經(jīng)過PCR擴(kuò)增,,實現(xiàn)了對每一條DNA分子的單獨檢測。

圖3:第三代基因測序儀

發(fā)展歷程:

注:三代測序目前暫時還處在基礎(chǔ)科研階段,,還未走向臨床運用,。


隨著基因檢測技術(shù)的不斷發(fā)展,檢測成本也在逐步下降,,花費幾百美元測一個人的基因組的目標(biāo)相信很快就將實現(xiàn),。屆時,對腫瘤診療的臨床指導(dǎo)以及對于遺傳病的診治將變得更為簡單,、快速,,并有望從基因組水平上指導(dǎo)個體的醫(yī)療和保健,從而進(jìn)入個體化醫(yī)療的時代,。


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