|
大家在研究某個分子的時候,，常常需要了解下某個基因在各個組織和細胞中的表達，今天我們就介紹兩個工具： （1）The human protein atlas 網(wǎng)址：http://www.proteinatlas.org/ 這個數(shù)據(jù)庫我們前面介紹過（（工具篇）S5E50：航母級神器——蛋白組學結果大收錄,！）,，功能非常強大，我們舉例查詢一下基因Sox2在組織和腫瘤中的表達情況： 首先輸入sox2, 接下來選擇第一個, 打開后我們看到可以查詢組織,、細胞和腫瘤中的表達情況： 組織： 分別是蛋白表達和mRNA表達。單擊細胞后,，各個細胞系里面的表達： 以及在細胞內部的定位： 最后是腫瘤里面的免疫組化結果： （2）CCLE：Cancer Cell Line Encyclopedia 網(wǎng)址：https://portals./ccle/home 下面我們看一下怎么操作,，在右上角的search框輸入基因名：sox2 提交后在彈出的界面里選擇sox2單擊：
下面是打開的界面：
這里展示的就是sox2在各個組織類型的細胞里面的總體表達情況，這是箱式圖,，下面是散點圖：
我們可以下載數(shù)據(jù),，下載后可以直接用morpheus（https://software./morpheus/）展示：
也可以用graphpad自己繪制表達情況：
用origin8自己繪制：
關注后獲取《科研修煉手冊》1.0、2.0,、3.0,、4.0、基金篇精華合集 |
|
|
