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Python科學(xué)計(jì)算之Pandas

 ly88 2017-03-18

2016年5月30日,,作者:Jamal Moir

在我看來(lái),,對(duì)于Numpy以及Matplotlib,,Pandas可以幫助創(chuàng)建一個(gè)非常牢固的用于數(shù)據(jù)挖掘與分析的基礎(chǔ)。而Scipy(會(huì)在接下來(lái)的帖子中提及)當(dāng)然是另一個(gè)主要的也十分出色的科學(xué)計(jì)算庫(kù),,但是我認(rèn)為前三者才是真正的Python科學(xué)計(jì)算的支柱,。

所以,不需要太多精力,,讓我們馬上開始Python科學(xué)計(jì)算系列的第三帖——Pandas,。如果你還沒(méi)有查看其他帖子,不要忘了去看一下哦,!

導(dǎo)入Pandas

我們首先要導(dǎo)入我們的演出明星——Pandas,。


這是導(dǎo)入Pandas的標(biāo)準(zhǔn)方式。顯然,,我們不希望每時(shí)每刻都在程序中寫’pandas’,,但是保持代碼簡(jiǎn)潔、避免命名沖突還是相當(dāng)重要的,。因而我們折衷一下,,用‘pd’代替“pandas’。如果你仔細(xì)查看其他人使用Pandas的代碼,,你會(huì)發(fā)現(xiàn)這條導(dǎo)入語(yǔ)句,。

Pandas的數(shù)據(jù)類型

Pandas基于兩種數(shù)據(jù)類型:series與dataframe。

一個(gè)series是一個(gè)一維的數(shù)據(jù)類型,,其中每一個(gè)元素都有一個(gè)標(biāo)簽,。如果你閱讀過(guò)這個(gè)系列的關(guān)于Numpy的文章,你就可以發(fā)現(xiàn)series類似于Numpy中元素帶標(biāo)簽的數(shù)組,。其中,,標(biāo)簽可以是數(shù)字或者字符串。

一個(gè)dataframe是一個(gè)二維的表結(jié)構(gòu),。Pandas的dataframe可以存儲(chǔ)許多種不同的數(shù)據(jù)類型,,并且每一個(gè)坐標(biāo)軸都有自己的標(biāo)簽。你可以把它想象成一個(gè)series的字典項(xiàng),。

將數(shù)據(jù)導(dǎo)入Pandas

在我們開始挖掘與分析之前,,我們首先需要導(dǎo)入能夠處理的數(shù)據(jù)。幸好,,Pandas在這一點(diǎn)要比Numpy更方便,。

在這里我推薦你使用自己所感興趣的數(shù)據(jù)集來(lái)使用,。你的或其他國(guó)家的政府網(wǎng)站上會(huì)有一些好的數(shù)據(jù)源,。例如,你可以搜索英國(guó)政府?dāng)?shù)據(jù)美國(guó)政府?dāng)?shù)據(jù)來(lái)獲取數(shù)據(jù)源,。當(dāng)然,,Kaggle是另一個(gè)好用的數(shù)據(jù)源,。

在此,我將采用英國(guó)政府?dāng)?shù)據(jù)中關(guān)于降雨量數(shù)據(jù),,因?yàn)樗麄兪忠子谙螺d,。此外,我還下載了一些日本降雨量的數(shù)據(jù)來(lái)使用,。


這里我們從csv文件中讀取到了數(shù)據(jù),,并將他們存入了dataframe中,。我們只需要調(diào)用read_csv函數(shù)并將csv文件的路徑作為函數(shù)參數(shù)即可,。header關(guān)鍵字告訴Pandas這些數(shù)據(jù)是否有列名,在哪里,。如果沒(méi)有列名,,你可以將其置為None,。Pandas非常智能,所以你可以省略這一關(guān)鍵字,。

將你的數(shù)據(jù)準(zhǔn)備好以進(jìn)行挖掘和分析

現(xiàn)在我們已經(jīng)將數(shù)據(jù)導(dǎo)入了Pandas,。在我們開始深入探究這些數(shù)據(jù)之前,我們一定迫切地想大致瀏覽一下它們,,并從中獲得一些有用信息,,幫助我們確立探究的方向。

想要快速查看前x行數(shù)據(jù):


我們僅僅需要使用head()函數(shù)并傳入我們期望獲得的行數(shù),。

你將獲得一個(gè)類似下圖一樣的表:


另一方面,,你可能想要獲得最后x行的數(shù)據(jù):


類似于head,我們只需要調(diào)用tail函數(shù)并傳入我們想獲取的行數(shù),。需要注意的是,,Pandas不是從dataframe的結(jié)尾處開始倒著輸出數(shù)據(jù),而是按照它們?cè)赿ataframe中固有的順序輸出給你,。

你將獲得類似下圖的表


當(dāng)你在Pandas中查找列時(shí),,你通常需要使用列名。這樣雖然非常便于使用,,但有時(shí)候,,數(shù)據(jù)可能會(huì)有特別長(zhǎng)的列名,例如,,有些列名可能是問(wèn)卷表中的某整個(gè)問(wèn)題,。把這些列名變短會(huì)讓你的工作更加輕松:


有一點(diǎn)需要注意的是,在這里我故意讓所有列的標(biāo)簽都沒(méi)有空格和橫線,。后面你將會(huì)看到,,如果我們這樣命名變量,Pandas會(huì)將它們存成什么類型。

 你將獲得同之前一樣的數(shù)據(jù),,但是列名已經(jīng)變了:


另一件你很想知道的關(guān)于你的數(shù)據(jù)的重要的事情是數(shù)據(jù)一共有多少條目,。在Pandas中,一個(gè)條目等同于一行,,所以我們可以通過(guò)len方法獲取數(shù)據(jù)的行數(shù),,即條目數(shù)。


這將給你一個(gè)整數(shù)告訴你數(shù)據(jù)的行數(shù),。在我的數(shù)據(jù)集中,,我有33行。

此外,,你可能需要知道你數(shù)據(jù)的一些基本的統(tǒng)計(jì)信息,。Pandas讓這件事變得非常簡(jiǎn)單。


這將返回一個(gè)包含多種統(tǒng)計(jì)信息的表格,,例如,,計(jì)數(shù),均值,,標(biāo)準(zhǔn)方差等,。它看起來(lái)像這樣:



過(guò)濾

當(dāng)你查看你的數(shù)據(jù)集時(shí),你可能希望獲得一個(gè)特殊的樣本數(shù)據(jù),。例如,,如果你有一個(gè)關(guān)于工作滿意度的問(wèn)卷調(diào)查數(shù)據(jù),你可能想要獲得所有在同一行業(yè)或同一年齡段的人的數(shù)據(jù),。

Pandas為我們提供了多種方法來(lái)過(guò)濾我們的數(shù)據(jù)并提取出我們想要的信息,。有時(shí)候你想要提取一整列??梢灾苯邮褂昧袠?biāo)簽,,非常容易。


注意到當(dāng)我們提取了一列,,Pandas將返回一個(gè)series,,而不是一個(gè)dataframe。是否還記得,,你可以將dataframe視作series的字典,。所以,如果我們?nèi)〕隽四骋涣?,我們獲得的自然是一個(gè)series,。

還記得我所說(shuō)的命名列標(biāo)簽的注意事項(xiàng)嗎?不使用空格和橫線等可以讓我們以訪問(wèn)類屬性相同的方法來(lái)訪問(wèn)列,,即使用點(diǎn)運(yùn)算符,。


這里返回的結(jié)果和之前的一模一樣,,即一個(gè)包含我們所選列的數(shù)據(jù)的series。

如果你讀過(guò)這一系列中Numpy那一篇帖子,,你可能會(huì)記得一項(xiàng)技術(shù)叫做‘boolean masking’,即我們可以在數(shù)組上運(yùn)行一個(gè)條件語(yǔ)句來(lái)獲得對(duì)應(yīng)的布爾值數(shù)組,。好,,我們也可以在Pandas中做同樣的事,。


上述代碼將范圍一個(gè)布爾值的dataframe,其中,,如果9,、10月的降雨量低于1000毫米,則對(duì)應(yīng)的布爾值為‘True’,反之,,則為’False’,。

我們也可以使用這些條件表達(dá)式來(lái)過(guò)濾一個(gè)已知的dataframe。


這將返回一個(gè)僅僅包含9,、10月降雨量低于1000mm的條目的dataframe,。


你也可以使用多條條件表達(dá)式來(lái)進(jìn)行過(guò)濾:


這將返回rain_octsep小于1000并且outflow_octsep小于4000的那些條目。

值得注意的是,,由于操作符優(yōu)先級(jí)的問(wèn)題,,在這里你不可以使用關(guān)鍵字‘a(chǎn)nd’,而只能使用’&’與括號(hào)


好消息是,,如果在你的數(shù)據(jù)中有字符串,,你也可以使用字符串方法來(lái)過(guò)濾數(shù)據(jù)。


注意到你必須使用.str.[string method],,你不能直接在字符串上直接調(diào)用字符串方法,。這一語(yǔ)句返回1990年代的所有條目。


索引

前幾部分為我們展示了如何通過(guò)列操作來(lái)獲得數(shù)據(jù),。實(shí)際上,,Pandas同樣有標(biāo)簽化的行操作。這些行標(biāo)簽可以是數(shù)字或是其他標(biāo)簽,。獲取行數(shù)據(jù)的方法也取決于這些標(biāo)簽的類型,。

 如果你的行有數(shù)字索引,你可以使用iloc引用他們:


iloc僅僅作用于數(shù)字索引,。它將會(huì)返回該行的一個(gè)series,。在返回的series中,這一行的每一列都是一個(gè)獨(dú)立的元素,。

 可能在你的數(shù)據(jù)集里有年份的列,,或者年代的列,并且你希望可以用這些年份或年代來(lái)索引某些行,。這樣,,我們可以設(shè)置一個(gè)(或多個(gè))新的索引,。


這將會(huì)給’water_year’一個(gè)新的索引值。注意到列名雖然只有一個(gè)元素,,卻實(shí)際上需要包含于一個(gè)列表中,。如果你想要多個(gè)索引,你可以簡(jiǎn)單地在列表中增加另一個(gè)列名,。


在上面這個(gè)例子中,,我們把我們的索引值全部設(shè)置為了字符串。這意味著我們不可以使用iloc索引這些列了,。這種情況該如何,?我們使用loc。


這里,,loc和iloc一樣會(huì)返回你所索引的行數(shù)據(jù)的一個(gè)series,。唯一的不同是此時(shí)你使用的是字符串標(biāo)簽進(jìn)行引用,而不是數(shù)字標(biāo)簽,。

ix是另一個(gè)常用的引用一行的方法,。那么,如果loc是字符串標(biāo)簽的索引方法,,iloc是數(shù)字標(biāo)簽的索引方法,,那什么是ix呢?事實(shí)上,,ix是一個(gè)字符串標(biāo)簽的索引方法,,但是它同樣支持?jǐn)?shù)字標(biāo)簽索引作為它的備選。


正如loc和iloc,,上述代碼將返回一個(gè)series包含你所索引的行的數(shù)據(jù),。

既然ix可以完成loc和iloc二者的工作,為什么還需要它們呢?最主要的原因是ix有一些輕微的不可預(yù)測(cè)性,。還記得我說(shuō)數(shù)字標(biāo)簽索引是ix的備選嗎,?數(shù)字標(biāo)簽可能會(huì)讓ix做出一些奇怪的事情,例如將一個(gè)數(shù)字解釋成一個(gè)位置,。而loc和iloc則為你帶來(lái)了安全的,、可預(yù)測(cè)的、內(nèi)心的寧?kù)o,。然而必須指出的是,,ix要比loc和iloc更快。

通常我們都希望索引是整齊有序地,。我們可以在Pandas中通過(guò)調(diào)用sort_index來(lái)對(duì)dataframe實(shí)現(xiàn)排序,。


由于我的所以已經(jīng)是有序的了,所以為了演示,,我設(shè)置了關(guān)鍵字參數(shù)’ascending’為False,。這樣,,我的數(shù)據(jù)會(huì)以降序排列。


當(dāng)你為一列數(shù)據(jù)設(shè)置了一個(gè)索引時(shí),,它們將不再是數(shù)據(jù)本身了,。如果你想把索引設(shè)置為原始數(shù)據(jù)的形式,你可以使用和set_index相反的操作——reset_index,。


這將返回?cái)?shù)據(jù)原始的索引形式,。


對(duì)數(shù)據(jù)集應(yīng)用函數(shù)

有時(shí)候你會(huì)想以某些方式改變或是操作你數(shù)據(jù)集中的數(shù)據(jù)。例如,,如果你有一列年份的數(shù)據(jù)而你希望創(chuàng)建一個(gè)新的列顯示這些年份所對(duì)應(yīng)的年代,。Pandas對(duì)此給出了兩個(gè)非常有用的函數(shù),,apply和applymap,。


這會(huì)創(chuàng)建一個(gè)名為‘year‘的新列。這一列是由’water_year’列所導(dǎo)出的,。它獲取的是主年份,。這便是使用apply的方法,即如何對(duì)一列應(yīng)用一個(gè)函數(shù),。如果你想對(duì)整個(gè)數(shù)據(jù)集應(yīng)用某個(gè)函數(shù),,你可以使用dataset.applymap()。

操作一個(gè)數(shù)據(jù)集結(jié)構(gòu)

另一件經(jīng)常會(huì)對(duì)dataframe所做的操作是為了讓它們呈現(xiàn)出一種更便于使用的形式而對(duì)它們進(jìn)行的重構(gòu),。

首先,,groupby:


grouby所做的是將你所選擇的列組成一組。上述代碼首先將年代組成一組,。雖然這樣做沒(méi)有給我們帶來(lái)任何便利,,但我們可以緊接著在這個(gè)基礎(chǔ)上調(diào)用其它方法,例如max, min, mean等,。例子中,,我們可以得到90年代的均值。


你也可以對(duì)多行進(jìn)行分組操作:



接下來(lái)的unstack操作可能起初有一些困惑,。它的功能是將某一列前置成為列標(biāo)簽,。我們最好如下看看它的實(shí)際效果。


這個(gè)操作會(huì)將我們?cè)谏厦嫘」?jié)創(chuàng)建的dataframe轉(zhuǎn)變成如下形式,。它將標(biāo)識(shí)‘year’索引的第0列推起來(lái),,變?yōu)榱肆袠?biāo)簽。


我們?cè)俑郊右粋€(gè)unstack操作,。這次我們對(duì)’rain_octsep’索引的第1列操作:



現(xiàn)在,,在我們下一個(gè)操作前,我們首先創(chuàng)造一個(gè)新的dataframe,。


上述代碼為我們創(chuàng)建了如下的dataframe,,我們將對(duì)它進(jìn)行pivot操作,。


pivot實(shí)際上是在本文中我們已經(jīng)見過(guò)的操作的組合。首先,,它設(shè)置了一個(gè)新的索引(set_index()),,然后它對(duì)這個(gè)索引排序(sort_index()),最后它會(huì)進(jìn)行unstack操作,。組合起來(lái)就是一個(gè)pivot操作,。看看你能不能想想會(huì)發(fā)生什么:


注意到最后有一個(gè).fillna(‘’),。這個(gè)pivot創(chuàng)造了許多空的或值為NaN的條目,。我個(gè)人覺(jué)得我的dataframe被亂七八糟的NaN分散了注意力,所以使用了fillna(‘’)將他們變成了空字符串,。你也可以輸入任何你喜歡的東西,,例如一個(gè)0。我們也可以使用函數(shù)dropna(how=’any’)來(lái)刪除所有的帶有NaN的行,。然而在這個(gè)例子里,,它可能會(huì)把所有東西都刪了,所以我們沒(méi)有這樣做,。


上述dataframe為我們展現(xiàn)了所有降雨量大于1250的年份中的總雨量,。不可否認(rèn)的是,這個(gè)并不是一個(gè)pivot的最好的示范,,但是希望你能get到它的核心,。看看你能在你自己的數(shù)據(jù)集中想出什么點(diǎn)子,。

合并數(shù)據(jù)集

有時(shí)候你有兩個(gè)單獨(dú)的數(shù)據(jù)集,,它們直接互相關(guān)聯(lián),而你想要比較它們的差異或者合并它們,。沒(méi)問(wèn)題,,Pandas可以很容易實(shí)現(xiàn):


開始時(shí)你需要通過(guò)’on’關(guān)鍵字參數(shù)指定你想要合并的列。你也可以忽略這個(gè)參數(shù),,這樣Pandas會(huì)自動(dòng)確定合并哪列,。

如下你可以看到,兩個(gè)數(shù)據(jù)集在年份這一類上已經(jīng)合并了,。rain_jpn數(shù)據(jù)集僅僅包含年份以及降雨量,。當(dāng)我們以年份這一列進(jìn)行合并時(shí),僅僅’jpn_rainfall’這一列和我們UK雨量數(shù)據(jù)集的對(duì)應(yīng)列進(jìn)行了合并,。


采用Pandas快速繪制圖表

Matplotlib很好用,,但是想要畫出一個(gè)中途下降的圖表還是需要費(fèi)一番功夫的。而有的時(shí)候你僅僅想要快速畫出一個(gè)數(shù)據(jù)的大致走勢(shì)來(lái)幫助你發(fā)掘搞清這些數(shù)據(jù)的意義,。Pandas提供了plot函數(shù)滿足你的需求:


這里非常輕松快速地利用plot畫出了一個(gè)你的數(shù)據(jù)的圖表,。利用這個(gè)圖表,,你可以緊接著直觀地發(fā)現(xiàn)深入挖掘的方向。例如,,如果你看我畫出的我數(shù)據(jù)的圖表,,你可以看到1995年英國(guó)可能發(fā)生了干旱。


你也能發(fā)現(xiàn)英國(guó)的降雨量明顯低于日本,,然而人們卻說(shuō)英國(guó)雨下得很多,!

存儲(chǔ)你的數(shù)據(jù)集

在清理、重構(gòu)以及挖掘完你的數(shù)據(jù)后,,你通常會(huì)剩下一些非常重要有用的東西,。你不僅應(yīng)當(dāng)保留下你的原始數(shù)據(jù),也同樣需要保存下你最新處理過(guò)的數(shù)據(jù)集,。


上述代碼會(huì)將你的數(shù)據(jù)存入一個(gè)csv文件以備下次使用,。

到此為止,我們簡(jiǎn)單介紹了Pandas,。正如我之前說(shuō)的,,Pandas是非常好用的庫(kù),,而我們僅僅是接觸了一點(diǎn)皮毛,。但是我希望通過(guò)我的介紹,你可以開始進(jìn)行真正的數(shù)據(jù)清理與挖掘工作了,。

像往常一樣,,我非常希望你能盡快開始嘗試Pandas。找一兩個(gè)你喜歡的數(shù)據(jù)集,,開一瓶啤酒,,坐下來(lái),然后開始探索你的數(shù)據(jù)吧,。這確實(shí)是唯一的熟悉Pandas以及其他這一系列文章中提到的庫(kù)的方式,。再加上你永遠(yuǎn)不知道的,你會(huì)找到一些你感興趣的東西的,。



英文原文:http://www./2016/05/scientific-python-pandas/
譯者:LuCima

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