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R語言之常用函數(shù)

 520jefferson 2014-04-08

R語言之常用函數(shù)

對(duì)一般數(shù)據(jù)進(jìn)行運(yùn)算的常用函數(shù):

數(shù)學(xué)函數(shù):

1,、round() #四舍五入
例:x <- c(3.1416, 15.377, 269.7)
round(x, 0) #保留整數(shù)位
round(x, 2) #保留兩位小數(shù)
round(x, -1) #保留到十位
 
2,、signif() #取有效數(shù)字(跟學(xué)過的有效數(shù)字不是一個(gè)意思)
例:略
 
3,、trunc() #取整
   floor() #向下取整
   ceiling() #向上取整
例:xx <- c(3.60, 12.47, -3.60, -12.47)
trunc(xx)
floor(xx)
ceiling(xx)
 
4,、logb(a, b) #以b為底的對(duì)數(shù),省略b表示自然對(duì)數(shù)
   log() #自然對(duì)數(shù)
   log10() #以10為底的常用對(duì)數(shù)
例:logb(8, 2)
log(8); logb(8)
log10(100); logb(100, 10)
 
5,、sqrt() #平方根
   exp() #指數(shù)
 
6,、sin() #正弦
   cos() #余弦
   tan() #正切
   asin() #反正弦
   acos() #反余弦
   atan() #反正切
   sinh() #雙曲正弦
   tanh() #雙曲正切
 
7、nchar() #字符長(zhǎng)度
例:xx <- 'China is a great country'
nchar(xx)
 
8,、substring() #取子字符串
例:substring(xx, 1, 5)
 
9,、paste() #連接字符
語法是:paste(..., sep = " ", collapse = NULL)
例1:x <- 'I'; y <- 'am'; z <- 'a'; d <- 'student'
paste(x, y, z, d)
例2:paste(c('x', 'y'), 1:4, sep = '')
例3:paste('x', 1:4, sep = '', collapse = '+')
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10、計(jì)算
+, -, *, /, ^, %%, %/%:四則運(yùn)算ceiling,,floor,,round,signif,,trunc,,zapsmall:舍入max,min,,pmax,,pmin:最大 最小值 range:最大值和最小值sum,prod:向量元素和,,積cumsum,,cumprod,cummax,,cummin:累加,、累乘sort:排序 approx和approx fun:插值diff:差分sign:符號(hào)函數(shù)

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11、自己寫函數(shù)程序流程
一,、控制結(jié)構(gòu)
if,,else,ifelse,,switch:分支for,while,,repeat,,break,next:循環(huán)apply,,lapply,,sapply,tapply,,sweep:替代循環(huán)的函數(shù),。
二、函數(shù)
function:函數(shù)定義 source:調(diào)用文件 call:函數(shù)調(diào)用.C,,.Fortran:調(diào)用C或者Fortran子程序的動(dòng)態(tài)鏈接庫,。Recall:遞歸調(diào)用 browser,,debug,trace,,traceback:程序調(diào)試options:指定系統(tǒng)參數(shù) missing:判斷虛參是否有對(duì)應(yīng)實(shí)參nargs:參數(shù)個(gè)數(shù) stop:終止函數(shù)執(zhí)行on.exit:指定退出時(shí)執(zhí)行 eval,,expression:表達(dá)式計(jì)算system.time:表達(dá)式計(jì)算計(jì)時(shí) invisible:使變量不顯示menu:選擇菜單(字符列表菜單)
其它與函數(shù)有關(guān)的還有:delay,delete.response,,deparse,,do.call,dput,,environment ,,,formals,,format.info,,interactive,is.finite,,is.function,,is.language,is.recursive ,,match.arg,,match.call,match.fun,,model.extract,,name,parse,,substitute,,sys.parent ,warning,,machine,。
三、輸入輸出
cat,,print:顯示對(duì)象
sink:輸出轉(zhuǎn)向到指定文件
dump,,save,dput,,write:輸出對(duì)象
scan,,read.table,load,,dget:讀入
四,、工作環(huán)境
ls,objects:顯示對(duì)象列表
rm, remove:刪除對(duì)象
q,quit:退出系統(tǒng)
.First,,.Last:初始運(yùn)行函數(shù)與退出運(yùn)行函數(shù)
options:系統(tǒng)選項(xiàng)
 ,,help,help.start,,apropos:幫助功能
data:列出數(shù)據(jù)集

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12,、統(tǒng)計(jì)計(jì)算函數(shù)
一、統(tǒng)計(jì)分布
每一種分布有四個(gè)函數(shù):d――density(密度函數(shù)),,p――分布函數(shù),,q――分位數(shù) 函數(shù),r――隨機(jī)數(shù)函數(shù),。比如,,正態(tài)分布的這四個(gè)函數(shù)為dnorm,pnorm,,qnorm,,rnorm。各分布后綴,,前面加前綴d,、p、q或r就構(gòu)成函數(shù)名:
norm:正態(tài)
t:t分布
f:F分布
chisq:卡方(包括非中心)
unif:均勻
exp:指數(shù)
weibull:威布爾
gamma:伽 瑪
beta:貝塔
lnorm:對(duì)數(shù)正態(tài)
logis:邏輯分布
cauchy:柯西
binom:二項(xiàng)分布
geom:幾何分布
hyper:超幾 何
nbinom:負(fù)二項(xiàng)
pois:泊松
signrank:符號(hào)秩
wilcox:秩和
tukey:學(xué)生化極差
二,、簡(jiǎn)單統(tǒng)計(jì)量
sum, mean, var, sd, min, max, range, median, IQR(四分位間距)等為統(tǒng)計(jì) 量
sort,,order,rank與排序有關(guān)
其它還有ave,,fivenum,,mad,quantile,,stem等,。
三、統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)
R中已實(shí)現(xiàn)的有chisq.test,,prop.test,,t.test。
四,、多元分析
cor,,cov.wt,var:協(xié)方差陣及相關(guān)陣計(jì)算
biplot,,biplot.princomp:多元數(shù)據(jù)biplot圖
cancor:典則相關(guān)
princomp:主成分分析
hclust:譜系聚類:
kmeans:k-均值聚類
cmdscale:經(jīng)典多維標(biāo)度
其它有dist,mahalanobis,,cov.rob,。
五、時(shí)間序列
ts:時(shí)間序列對(duì)象 diff:計(jì)算差分 time:時(shí)間序列的采樣時(shí)間 window:時(shí)間窗
六,、統(tǒng)計(jì)模型
lm,,glm,,aov:線性模型、廣義線性模型,、方差分析

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13,、其他
(1)rm(list = ls())
#清空控制臺(tái)所有向量
(2)setwd("D:/ziliao/zhuanye/R bear/R code")
#設(shè)置工作目錄
(3)library(Biostrings)
#調(diào)用程序包
(4)aa <- AAString("LANDEECQW")
#將一個(gè)字符向量轉(zhuǎn)化成氨基酸序列aa
(5)typeof(aa)
#查看aa類型
[1] "S4"
#aa為S4方法類型
(6)write(aa,"chuana.txt")
#嘗試將aa輸出到文件chuana.txt中
(7)aa=as.character(aa)
#將aa轉(zhuǎn)化為字符向量
(8)write(aa,"chuana.txt")
#再次輸出
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奇葩函數(shù)
看別人的代碼會(huì)遇到一些奇葩的函數(shù),一般的教程上很少提到,,但卻有很好的用處,,這類函數(shù)基本上分布在base以及utils包中,下面將它們略為歸納一下,,以備后用,。

1 文件執(zhí)行:
在用R生成一個(gè)PDF文檔后,如果想去打開它,,你可能會(huì)在文件夾里找到再點(diǎn)開,。再或者我們想調(diào)用系統(tǒng)中的其它程序來做點(diǎn)事情,可能要打開cmd敲點(diǎn)命令,。實(shí)際上這都可以在R內(nèi)部完成,。舉例來說用pandoc轉(zhuǎn)換na.md成docx再打開它。
 
system('pandoc d:\\rspace\\na.md -o d:\\rspace\\na.docx')
shell.exec('d:\\rspace\\na.docx')
 

2 網(wǎng)絡(luò)瀏覽:
browseURL:瀏覽某個(gè)指定的網(wǎng)頁
download.file:下載網(wǎng)絡(luò)文件到本地

3 文件操作
dir.create:新建一個(gè)文件夾
list.dirs:顯示目錄下的文件夾
list.files:顯示目錄下的文檔
file.create:文檔創(chuàng)建
file.exists:判斷文檔是否存在
file.remove:文檔刪除
file.rename:重命名
file.append:文檔添加
file.copy:文檔復(fù)制
file.symlink(from, to)
file.show:顯示文檔內(nèi)容
file.info:顯示文檔信息
file.edit:編輯文檔
zip: 壓縮文件
unzip: 解壓縮文件

4 運(yùn)算進(jìn)度條
在一個(gè)大循環(huán)運(yùn)算時(shí),,如果可以看到目前的進(jìn)度是比較方便的,,txtProgressBar和setTxtProgressBar函數(shù)可以幫助做到這一點(diǎn),下面是內(nèi)置的一個(gè)小例子

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